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唾液中细胞外囊泡的分离与蛋白质组研究

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
符号缩写第10-11页
第一章 绪论第11-43页
    1.1 体液分子诊断研究第11-14页
        1.1.1 体液分子诊断简介第11页
        1.1.2 血液分子诊断第11-12页
        1.1.3 尿液分子诊断第12-13页
        1.1.4 唾液分子诊断第13-14页
    1.2 细胞外囊泡第14-25页
        1.2.1 外泌体和微泡第17-21页
        1.2.2 外泌体和微泡的富集方法第21-22页
        1.2.3 细胞外囊泡的表征方法第22-23页
        1.2.4 体液细胞外囊泡的核酸研究第23-24页
        1.2.5 体液细胞外囊泡的蛋白组学研究第24-25页
    1.3 蛋白质组学的研究方法第25-32页
        1.3.1 基于双向凝胶的定量蛋白组学技术第26-27页
        1.3.2 基于质谱的定量蛋白组学技术第27-32页
            1.3.2.1 基质辅助激光解析(MALDI)和电喷雾(ESI)质谱分析技术第27-28页
            1.3.2.2 Label-free非标记质谱定量分析第28-29页
            1.3.2.3 iTRAQ质谱定量分析第29-30页
            1.3.2.4 MRM/PRM目标蛋白质绝对定量第30-31页
            1.3.2.5 DIA/SWATH质谱定量分析第31-32页
    1.4 肺癌及其分子诊断第32-36页
        1.4.1 肺癌简介第32-33页
        1.4.2 肺癌临床诊断的研究现状第33-34页
        1.4.3 肺癌标志物研究进展第34-36页
    1.5 本文的研究内容及策略第36-38页
        1.5.1 研究内容第36-37页
        1.5.2 研究策略第37-38页
    参考文献第38-43页
第二章 建立唾液中细胞外囊泡的富集方法第43-64页
    2.1 前言第43-44页
    2.2 实验材料和方法第44-49页
        2.2.1 试剂和仪器第44-45页
        2.2.2 唾液的收集第45页
        2.2.3 唾液中高丰度蛋白去除方法的建立第45-47页
            2.2.3.1 淀粉亲和层析色谱和膜结合系统的建立(ACCF)第45-47页
            2.2.3.2 淀粉亲和层析方法的评估第47页
        2.2.4 建立ACCF系统富集唾液微泡第47-49页
            2.2.4.1 唾液微泡的富集第47页
            2.2.4.2 唾液微泡蛋白的提取第47-48页
            2.2.4.3 SDS-PAGE微泡蛋白分离第48页
            2.2.4.4 唾液微泡的粒径分析第48页
            2.2.4.5 微泡蛋白的质谱鉴定第48-49页
            2.2.4.6 微泡蛋白的生物信息学分析第49页
    2.3 结果与讨论第49-62页
        2.3.1 高丰度蛋白去除方法的条件优化第49-52页
        2.3.2 新方法对唾液内微泡富集效率的评价第52-56页
        2.3.3 探讨唾液淀粉酶对唾液微泡提取效率影响的机制第56-58页
        2.3.4 肺癌病人唾液微泡蛋白组学分析第58-62页
    2.4 本章总结第62页
    参考文献第62-64页
第三章 唾液内微泡和外泌体蛋白组的比较分析第64-90页
    3.1 前言第64-65页
    3.2 实验材料和方法第65-70页
        3.2.1 试剂和仪器第65-66页
        3.2.2 唾液的收集第66页
        3.2.3 唾液微泡和外泌体的提取第66页
        3.2.4 唾液微泡和外泌体蛋白的提取第66-67页
        3.2.5 唾液微泡和外泌体的表征第67-68页
            3.2.5.1 微泡和外泌体的电镜测试第67-68页
            3.2.5.2 微泡和外泌体的粒径测试第68页
            3.2.5.3 微泡和外泌体的标志性蛋白的免疫印迹检测第68页
        3.2.6 唾液微泡和外泌体蛋白的鉴定第68-70页
            3.2.6.1 微泡和外泌体蛋白的SDS-PAGE分离第68页
            3.2.6.2 微泡和外泌体蛋白的质谱鉴定第68-69页
            3.2.6.3 唾液内微泡和外泌体蛋白Label free分析及验证第69-70页
    3.3 结果与讨论第70-86页
        3.3.1 唾液微泡和外泌体的富集离心条件优化结果第70-71页
        3.3.2 唾液微泡和外泌体的表征结果第71-76页
        3.3.3 唾液微泡和外泌体的蛋白组比较结果第76-78页
        3.3.4 肺癌患者唾液胞外囊泡的蛋白组分析结果第78-81页
        3.3.5 Western blot验证第81-86页
    3.4 本章总结第86-87页
    参考文献第87-90页
第四章 唾液和血液中外泌体蛋白组的比较分析第90-110页
    4.1 前言第90-91页
    4.2 实验部分第91-95页
        4.2.1 试剂和仪器第91-92页
        4.2.2 唾液的收集第92页
        4.2.3 血液的收集第92页
        4.2.4 血液和唾液样本的前处理第92-93页
        4.2.5 唾液和血液外泌体的提取第93-94页
        4.2.6 唾液和血液外泌体的表征第94-95页
            4.2.6.1 唾液和血液外泌体的电镜测试第94页
            4.2.6.2 唾液和血液外泌体的粒径测试第94页
            4.2.6.3 唾液和血液外泌体的标志性蛋白的免疫印迹检测第94-95页
        4.2.7 肺癌患者唾液和血液外泌体的蛋白组学分析第95页
            4.2.7.1 唾液和血液外泌体蛋白的SDS-PAGE分离第95页
            4.2.7.2 唾液和血液外泌体蛋白的质谱鉴定第95页
    4.3 结果与讨论第95-107页
        4.3.1 唾液外泌体和血液外泌体的富集第95-98页
        4.3.2 唾液外泌体和血液外泌体的表征结果第98-100页
        4.3.3 唾液外泌体和血液外泌体蛋白组学的比较结果第100-103页
        4.3.4 肺癌外泌体蛋白组学分析第103-107页
    4.4 本章总结第107-108页
    参考文献第108-110页
第五章 唾液中细胞外囊泡蛋白的基因注释分析第110-118页
    5.1 前言第110-111页
    5.2 唾液内细胞外囊泡的比较蛋白组学分析第111-114页
        5.2.1 唾液内微泡蛋白组学分析第112-113页
        5.2.2 唾液内外泌体蛋白组学分析第113-114页
    5.3 正常组和癌症组唾液细胞外囊泡蛋白成分对比结果第114-116页
    5.4 本章总结第116页
    参考文献第116-118页
第六章 总结与展望第118-120页
附录第120-150页
致谢第150-151页
攻读博士学位期间已发表或录用的论文第151-153页

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