| 摘要 | 第4-5页 |
| abstract | 第5-6页 |
| 第1章 引言 | 第10-17页 |
| 1.1 转录组测序及其应用 | 第10-11页 |
| 1.2 微卫星标记的开发及其应用 | 第11-14页 |
| 1.2.1 微卫星的概念 | 第11页 |
| 1.2.2 微卫星在水产动物研究中的应用 | 第11-13页 |
| 1.2.3 高通量测序技术在开发微卫星标记开发的应用 | 第13-14页 |
| 1.3 黄姑鱼的遗传多样性研究概况 | 第14-15页 |
| 1.3.1 黄姑鱼概况 | 第14-15页 |
| 1.3.2 黄姑鱼的遗传多样性研究 | 第15页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第15-17页 |
| 第2章 基于转录组测序的黄姑鱼SSR标记的开发与验证 | 第17-33页 |
| 2.1 材料与方法 | 第17-20页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第17页 |
| 2.1.2 主要仪器和试剂 | 第17-18页 |
| 2.1.3 黄姑鱼总RNA提取与检测 | 第18页 |
| 2.1.4 微卫星序列的查找与分析 | 第18-19页 |
| 2.1.5 黄姑鱼基因组DNA的提取与检测 | 第19页 |
| 2.1.6 微卫星位点的初步筛选 | 第19页 |
| 2.1.7 PCR及多态性微卫星标记的筛选 | 第19页 |
| 2.1.8 微卫星验证结果分析 | 第19-20页 |
| 2.2 结果与分析 | 第20-30页 |
| 2.2.1 总RNA提取结果 | 第20页 |
| 2.2.2 转录组分析结果 | 第20-21页 |
| 2.2.3 微卫星标记位点的开发及多态验证 | 第21-30页 |
| 2.3 讨论 | 第30-33页 |
| 2.3.1 黄姑鱼转录组微卫星分布频率及碱基组成分析 | 第30-31页 |
| 2.3.2 微卫星的多态性分析 | 第31页 |
| 2.3.3 微卫星标记获取方法比较与分析 | 第31-32页 |
| 2.3.4 关于目的条带的判读 | 第32-33页 |
| 第3章 三个黄姑鱼群体遗传多样性研究 | 第33-43页 |
| 3.1 材料与方法 | 第33-35页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第33页 |
| 3.1.2 主要仪器和试剂 | 第33页 |
| 3.1.3 黄姑鱼基因组DNA的提取与检测 | 第33页 |
| 3.1.4 PCR扩增 | 第33-35页 |
| 3.1.5 琼脂糖电泳及毛细管电泳检测PCR产物 | 第35页 |
| 3.1.6 数据分析 | 第35页 |
| 3.2 结果与分析 | 第35-40页 |
| 3.2.1 PCR扩增结果 | 第35-37页 |
| 3.2.2 群体遗传多样性分析 | 第37-39页 |
| 3.2.3 群体变异分析 | 第39-40页 |
| 3.3 讨论 | 第40-43页 |
| 3.3.1 黄姑鱼群体遗传多样性分析 | 第40-41页 |
| 3.3.2 群体遗传结构分析 | 第41-43页 |
| 第4章 黄姑鱼两代雌核发育群体的纯合度分析 | 第43-51页 |
| 4.1 材料与方法 | 第43-45页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第43页 |
| 4.1.2 主要仪器和试剂 | 第43页 |
| 4.1.3 黄姑鱼基因组DNA的提取与检测 | 第43页 |
| 4.1.4 PCR扩增 | 第43-44页 |
| 4.1.5 琼脂糖电泳及毛细管电泳检测PCR产物 | 第44-45页 |
| 4.1.6 数据分析 | 第45页 |
| 4.2 结果与分析 | 第45-49页 |
| 4.2.1 PCR电泳结果 | 第45-46页 |
| 4.2.2 雌核发育群体的遗传多样性分析 | 第46-47页 |
| 4.2.3 两代雌核发育群体的纯合度 | 第47-49页 |
| 4.3 讨论 | 第49-51页 |
| 第5章 总结 | 第51-52页 |
| 5.1 结论 | 第51页 |
| 5.2 论文创新点 | 第51页 |
| 5.3 展望 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-60页 |
| 在学期间科研成果情况 | 第60页 |
