| 摘要 | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-24页 |
| 1 黄花菜生物学特性与育种现状 | 第10-14页 |
| 1.1 黄花菜生物学特性 | 第10页 |
| 1.2 黄花菜育种现状 | 第10-14页 |
| 2 植物转录组学研究进展 | 第14-16页 |
| 2.1 转录组学的概念 | 第14页 |
| 2.2 转录组学的研究方法 | 第14-15页 |
| 2.3 转录组测序在植物中的应用 | 第15-16页 |
| 3 基于转录组测序技术的植物次生代谢物生物合成研究进展 | 第16-18页 |
| 3.1 植物次生代谢物概述 | 第16页 |
| 3.2 植物次生代谢物生物合成途径 | 第16-17页 |
| 3.3 转录组学在植物次生代谢物生物合成中的应用 | 第17-18页 |
| 4 植物遗传图谱构建 | 第18-23页 |
| 4.1 构建遗传图谱的意义 | 第18页 |
| 4.2 构建遗传图谱的原理 | 第18-19页 |
| 4.3 构建遗传图谱的方法 | 第19-21页 |
| 4.4 多年生植物遗传图谱构建 | 第21-23页 |
| 5 本研究目的及意义 | 第23-24页 |
| 第二章 黄花菜秋水仙碱生物合成相关基因筛选 | 第24-41页 |
| 1 材料与方法 | 第24-28页 |
| 1.1 测序材料采集 | 第24页 |
| 1.2 样品测序 | 第24-25页 |
| 1.3 测序质量控制及数据组装 | 第25页 |
| 1.4 基因功能注释 | 第25-26页 |
| 1.5 差异表达基因筛选 | 第26页 |
| 1.6 RT-qPCR验证 | 第26-28页 |
| 2 结果与分析 | 第28-37页 |
| 2.1 测序质量及数据组装 | 第28-29页 |
| 2.2 基因功能注释 | 第29-31页 |
| 2.3 秋水仙碱生物合成途径分析 | 第31-32页 |
| 2.4 差异表达基因分析 | 第32-36页 |
| 2.5 RT-qPCR验证 | 第36-37页 |
| 3 讨论 | 第37-40页 |
| 4 本章结论 | 第40-41页 |
| 第三章 黄花菜RT-qPCR内参基因的筛选 | 第41-57页 |
| 1 材料与方法 | 第41-45页 |
| 1.1 材料采集 | 第41页 |
| 1.2 总RNA提取及cDNA合成 | 第41-43页 |
| 1.3 黄花菜内参基因引物设计 | 第43页 |
| 1.4 RT-qPCR | 第43-44页 |
| 1.5 内参基因表达稳定性分析 | 第44页 |
| 1.6 内参基因稳定性验证 | 第44-45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-53页 |
| 2.1 RNA提取与质量检测 | 第45-46页 |
| 2.2 引物特异性分析 | 第46页 |
| 2.3 引物扩增效率分析 | 第46页 |
| 2.4 内参基因Ct值变化情况 | 第46-49页 |
| 2.5 内参基因稳定性评价 | 第49-52页 |
| 2.6 内参基因稳定性验证 | 第52-53页 |
| 3 讨论 | 第53-55页 |
| 3.1 内参基因的通用性 | 第53-54页 |
| 3.2 内参基因稳定性的不同分析手段 | 第54-55页 |
| 3.3 内参基因评价结果的验证 | 第55页 |
| 4 本章结论 | 第55-57页 |
| 第四章 黄花菜种内遗传图谱构建 | 第57-79页 |
| 1 材料与方法 | 第57-62页 |
| 1.1 作图群体建立 | 第57-59页 |
| 1.2 DNA提取 | 第59-60页 |
| 1.3 EST-SSR分析 | 第60-61页 |
| 1.4 黄花菜种内遗传图谱构建 | 第61-62页 |
| 1.5 基因组长度估计 | 第62页 |
| 2 结果与分析 | 第62-75页 |
| 2.1 黄花菜基因组DNA提取 | 第62页 |
| 2.2 EST-SSR引物筛选及多态性分析 | 第62-68页 |
| 2.3 EST-SSR标记分型 | 第68-70页 |
| 2.4 黄花菜种内遗传图谱构建 | 第70-74页 |
| 2.5 基因组长度及图谱覆盖率 | 第74-75页 |
| 3 讨论 | 第75-77页 |
| 3.1 亲本选配与杂交 | 第75-76页 |
| 3.2 “拟测交”策略与作图群体 | 第76页 |
| 3.3 偏分离标记 | 第76-77页 |
| 4 本章结论 | 第77-79页 |
| 第五章 黄花菜种间遗传图谱构建及与种内遗传图谱比较分析 | 第79-103页 |
| 1 材料与方法 | 第79-82页 |
| 1.1 种间杂交及作图群体建立 | 第79-81页 |
| 1.2 DNA提取 | 第81页 |
| 1.3 EST-SSR分析 | 第81页 |
| 1.4 黄花菜种间遗传图谱构建 | 第81页 |
| 1.5 基因组长度估计 | 第81-82页 |
| 1.6 黄花菜种间遗传图谱与种内遗传图谱比较 | 第82页 |
| 2 结果与分析 | 第82-98页 |
| 2.1 黄花菜种间杂交亲和力测定 | 第82-83页 |
| 2.2 黄花菜种间杂交种子萌发力测定 | 第83页 |
| 2.3 黄花菜与萱草基因组DNA提取 | 第83页 |
| 2.4 EST-SSR引物筛选及多态性分析 | 第83-90页 |
| 2.5 EST-SSR标记分型 | 第90页 |
| 2.6 黄花菜种间遗传图谱构建 | 第90-94页 |
| 2.7 基因组长度及图谱覆盖率 | 第94页 |
| 2.8 黄花菜种间遗传图谱与种内遗传图谱比较分析 | 第94-98页 |
| 3 讨论 | 第98-101页 |
| 3.1 黄花菜与萱草种间杂交 | 第98-99页 |
| 3.2 多态性引物与偏分离标记 | 第99页 |
| 3.3 黄花菜种间与种内遗传图谱比较分析 | 第99-101页 |
| 4 本章结论 | 第101-103页 |
| 研究结论、创新点和展望 | 第103-106页 |
| 参考文献 | 第106-112页 |
| Abstract | 第112-113页 |
| 附录 | 第114-126页 |
| 缩略词 | 第126-127页 |
| 攻读博士期间发表的学术论文 | 第127-128页 |
| 致谢 | 第128-129页 |