摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5页 |
第一章 引言 | 第7-9页 |
第二章 猪骨骼肌miRNA的鉴定及功能分析 | 第9-19页 |
2.1 材料与方法 | 第9-11页 |
2.1.1 实验动物及RNA的提取 | 第9页 |
2.1.2 Small RNA(sRNA)测序及数据分析 | 第9页 |
2.1.3 定量PCR | 第9-10页 |
2.1.4 生物信息学分析 | 第10-11页 |
2.2 结果 | 第11-15页 |
2.2.1 测序结果概述 | 第11-12页 |
2.2.2 高丰度及差异表达miRNA | 第12-13页 |
2.2.3 测序数据的验证 | 第13-14页 |
2.2.4 差异miRNA靶标基因筛选及整合分析 | 第14-15页 |
2.3 讨论 | 第15-18页 |
2.4 小结 | 第18-19页 |
第三章 小鼠骨骼肌miRNA的鉴定及功能分析 | 第19-33页 |
3.1 材料与方法 | 第19页 |
3.1.1 实验动物及RNA提取 | 第19页 |
3.1.2 sRNA测序及数据分析 | 第19页 |
3.1.3 miRNA芯片分析 | 第19页 |
3.1.4 生物信息学分析 | 第19页 |
3.2 结果 | 第19-29页 |
3.2.1 测序数据质量及长度分布 | 第19-20页 |
3.2.2 sRNA在基因组中的定位 | 第20-22页 |
3.2.3 sRNA的注释 | 第22页 |
3.2.4 sRNA-seq高丰度及差异表达miRNA | 第22-24页 |
3.2.5 miRNA的芯片验证 | 第24-25页 |
3.2.6 靶标预测 | 第25-26页 |
3.2.7 靶标基因的GO及Pathway分析 | 第26-29页 |
3.2.8 骨骼肌生长发育调控网络图 | 第29页 |
3.3 讨论 | 第29-32页 |
3.4 小结 | 第32-33页 |
全文结论 | 第33-35页 |
参考文献 | 第35-41页 |
附录 | 第41-61页 |
致谢 | 第61-63页 |
个人简历 | 第63页 |