摘要 | 第4-7页 |
Summary | 第7-9页 |
第一章 文献综述 | 第12-24页 |
1. 藏绵羊研究概述 | 第12-14页 |
1.1 藏绵羊 | 第12页 |
1.2 藏绵羊的主要研究进展 | 第12-14页 |
2. MHC简介 | 第14-20页 |
2.1 MHC基因的分类、结构和功能 | 第14-16页 |
2.2 MHC多态性及维持机制 | 第16-17页 |
2.3 MHC选择作用的检测 | 第17-20页 |
3. MHC在保护遗传学中的应用 | 第20页 |
4. 绵羊MHC | 第20-22页 |
5. 本研究的立项依据、研究目的及内容 | 第22-24页 |
第二章 试验材料与研究方法 | 第24-37页 |
1. 试验材料 | 第24-25页 |
1.1 样品采集 | 第24页 |
1.2 主要仪器设备和试剂 | 第24-25页 |
2. 试验方法 | 第25-34页 |
2.1 血液基因组DNA提取和检测 | 第25-26页 |
2.2 总RNA的提取、检测和cDNA合成 | 第26-27页 |
2.3 PCR引物设计与扩增 | 第27-31页 |
2.4 SSCP检测 | 第31-32页 |
2.5 藏绵羊DQA和DQB座位基因克隆与测序 | 第32-34页 |
3. 数据分析 | 第34-37页 |
3.1 生物信息学分析 | 第34-35页 |
3.2 ΔCt值法 | 第35页 |
3.3 适应性进化分析 | 第35-37页 |
第三章 结果与分析 | 第37-105页 |
1. 藏绵羊DQA和DQB座位基因克隆测序及序列分析 | 第37-44页 |
1.1 藏绵羊DQA和DQB座位基因克隆 | 第37-39页 |
1.2 藏绵羊DQA和DQB座位基因序列拼接和一级结构分析 | 第39-41页 |
1.3 藏绵羊DQA和DQB座位基因核苷酸序列分析 | 第41-43页 |
1.4 藏绵羊DQA和DQB座位基因氨基酸序列分析 | 第43-44页 |
2. 藏绵羊DQA和DQB座位基因生物信息学分析 | 第44-73页 |
2.1 藏绵羊DQA和DQB蛋白理化性质分析 | 第44-46页 |
2.2 藏绵羊DQA和DQB蛋白亚细胞定位 | 第46-49页 |
2.3 藏绵羊DQA和DQB蛋白信号肽剪切位点预测 | 第49-52页 |
2.4 藏绵羊DQA和DQB蛋白跨膜螺旋结构预测 | 第52-56页 |
2.5 藏绵羊DQA和DQB蛋白磷酸化和糖基化位点预测 | 第56-59页 |
2.6 藏绵羊DQA和DQB蛋白保守结构域预测 | 第59-62页 |
2.7 藏绵羊DQA和DQB蛋白亲疏水性分析 | 第62-64页 |
2.8 藏绵羊DQA和DQB蛋白功能预测与分析 | 第64-66页 |
2.9 藏绵羊DQA和DQB蛋白二级结构预测 | 第66-68页 |
2.10 藏绵羊DQA和DQB蛋白三级结构预测 | 第68-70页 |
2.11 藏绵羊DQA和DQB蛋白同源性及系统进化分析 | 第70-73页 |
3. DQA和DQB座位基因mRNA在藏绵羊各组织中的表达量 | 第73-80页 |
3.1 藏绵羊总RNA提取质量检测 | 第74页 |
3.2 DQA和DQB基因荧光定量PCR的电泳检测 | 第74-75页 |
3.3 DQA和DQB基因RT-qPCR动力学曲线 | 第75-76页 |
3.4 DQA和DQB基因的RT-qPCR熔解曲线 | 第76-77页 |
3.5 DQA和DQB座位基因在藏绵羊不同组织中的表达量 | 第77-80页 |
4. 藏绵羊的适应性进化研究 | 第80-105页 |
4.1 藏绵羊DQA和DQB座位基因的PCR-SSCP分析 | 第80-83页 |
4.2 藏绵羊DQA和DQB座位基因的序列分析 | 第83-89页 |
4.3 藏绵羊DQA和DQB座位基因的选择作用分析 | 第89-90页 |
4.4 藏绵羊DQA和DQB基因等位基因的进化及重组分析 | 第90-99页 |
4.5 藏绵羊DQA和DQB基因种群结构和种群分化 | 第99-105页 |
第四章 讨论 | 第105-113页 |
1. 藏绵羊DQA和DQB蛋白结构 | 第105-108页 |
1.1 藏绵羊DQA蛋白结构特征 | 第105-107页 |
1.2 藏绵羊DQB蛋白结构特征 | 第107-108页 |
2. 藏绵羊DQA和DQB基因mRNA表达差异 | 第108-109页 |
3. 藏绵羊DQA和DQB座位基因遗传变异水平 | 第109-110页 |
4. 藏绵羊DQA和DQB座位基因的平衡选择 | 第110-111页 |
5. 藏绵羊DQA和DQB座位基因重组 | 第111页 |
6. 藏绵羊MHC的遗传分化及种群结构 | 第111-113页 |
第五章 结论 | 第113-114页 |
创新点 | 第114-115页 |
参考文献 | 第115-124页 |
致谢 | 第124-125页 |
作者简介 | 第125-126页 |
导师简介 | 第126-127页 |