| 摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第12-22页 |
| 1.1 隐孢子虫基因分型和亚型分型 | 第13-15页 |
| 1.2 隐孢子虫多位点序列分型和群体遗传学 | 第15-17页 |
| 1.3 隐孢子虫比较基因组学 | 第17页 |
| 1.4 毕氏肠微孢子虫的基因分型 | 第17-18页 |
| 1.5 毕氏肠微孢子虫多位点序列分型和群体遗传学 | 第18-20页 |
| 1.6 芽囊原虫基因分型 | 第20页 |
| 1.7 研究目的与意义 | 第20-22页 |
| 2 材料和方法 | 第22-28页 |
| 2.1 材料 | 第22-23页 |
| 2.1.1 临床粪便样本采集和流行病学资料收集 | 第22页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第22-23页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第23页 |
| 2.2 方法 | 第23-28页 |
| 2.2.1 DNA提取 | 第23页 |
| 2.2.2 三种原虫虫种或基因型的鉴定 | 第23-24页 |
| 2.2.3 微小隐孢子虫亚型分型和多位点序列分型 | 第24-25页 |
| 2.2.4 毕氏肠微孢子虫多位点序列分型 | 第25-26页 |
| 2.2.5 PCR产物测序 | 第26页 |
| 2.2.6 测序结果分析 | 第26页 |
| 2.2.7 统计学分析和风险因素分析 | 第26-27页 |
| 2.2.8 系统进化分析 | 第27-28页 |
| 3 结果 | 第28-43页 |
| 3.1 不同群体奶牛三种肠道原虫的感染情况 | 第28-31页 |
| 3.2 隐孢子虫的虫种鉴定 | 第31-32页 |
| 3.3 微小隐孢子虫亚型鉴定及多位点序列分型结果 | 第32-33页 |
| 3.4 毕氏肠微孢子虫基因型鉴定及系统进化分析结果 | 第33-35页 |
| 3.5 毕氏肠微孢子虫多位点序列分型及系统进化分析结果 | 第35-40页 |
| 3.6 芽囊原虫的基因型鉴定及系统进化分析 | 第40页 |
| 3.7 影响隐孢子虫感染率的风险因素 | 第40-43页 |
| 4 讨论 | 第43-50页 |
| 4.1 黑龙江省奶牛隐孢子虫的感染情况和虫种分布 | 第43-44页 |
| 4.2 微小隐孢子虫的亚型分布和多位点序列分型 | 第44-45页 |
| 4.3 毕氏肠微孢子虫的感染情况、基因型分布及多位点序列分型 | 第45-47页 |
| 4.4 芽囊原虫的感染情况和基因型分布 | 第47-48页 |
| 4.5 隐孢子虫感染的风险因素 | 第48-50页 |
| 5 结论 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-66页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第66页 |
