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喹赛多对DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质结构的影响

摘要第9-12页
Abstract第12-15页
缩略语第16-19页
1 前言第19-27页
    1.1 立题依据第19-20页
    1.2 喹赛多促生长作用的研究进展第20-22页
        1.2.1 喹赛多促生长效果第20-21页
        1.2.2 喹赛多可能的促生长作用机制第21-22页
    1.3 表观遗传学主要内容第22-23页
    1.4 表观遗传学与机体生长发育的关系第23-25页
    1.5 研究内容和目标第25-27页
2 材料方法第27-53页
    2.1 细胞株第27页
    2.2 主要试剂第27-29页
    2.3 主要仪器第29-31页
    2.4 主要试剂的配制第31-33页
    2.5 细胞培养及冻存第33-34页
    2.6 MTT法筛选喹赛多作用下有利于BRL细胞生长的条件第34-35页
        2.6.1 MTT法检测喹赛多对BRL细胞生长状况的影响第34页
        2.6.2 MTT法检测对照药rGH对BRL细胞生长状况的影响第34-35页
    2.7 喹赛多对细胞内与生长相关基因、DNA甲基化相关基因和组蛋白修饰相关基因mRNA表达的影响第35-39页
        2.7.1 细胞处理第35页
        2.7.2 细胞总RNA的提取第35-36页
        2.7.4 总RNA的纯度及完整性检测第36页
        2.7.5 反转录合成cDNA第36-37页
        2.7.6 实时荧光定量PCR检测目的基因mRNA表达水平第37-39页
    2.8 喹赛多对DNA甲基化的影响第39-43页
        2.8.1 喹赛多对基因组DNA甲基化的影响第39-41页
        2.8.2 喹赛多对基因IGF-1 启动子区域DNA甲基化的影响第41-43页
    2.9 Western blot检测喹赛多对细胞中总体组蛋白修饰(H3K27ac和H3K4me3)的影响第43-47页
        2.9.1 细胞蛋白提取第43页
        2.9.2 蛋白浓度测定第43-44页
        2.9.3 SDS-PAGE电泳第44-46页
        2.9.4 转膜第46页
        2.9.5 免疫反应第46-47页
        2.9.6 化学发光、定影第47页
    2.10 ChIP-qPCR检测喹赛多对基因IGF-1启动子区域组蛋白修饰(H3K27ac和H3K4me3)的影响第47-51页
        2.10.1 细胞的处理第47页
        2.10.2 细胞交联和样品制备第47-48页
        2.10.3 细胞核处理和染色质剪切第48-49页
        2.10.4 染色质的浓度分析及酶切第49页
        2.10.5 染色质免疫共沉淀第49-50页
        2.10.6 将染色质从抗体/蛋白G微珠上洗脱并解交联第50页
        2.10.7 离心柱纯化DNA第50-51页
    2.11 用激光共聚焦显微镜观察喹赛多对染色质结构的影响第51-52页
        2.11.1 细胞爬片的制作及喹赛多对细胞的处理第51页
        2.11.2 免疫荧光实验观察喹赛多对染色质结构的影响第51-52页
    2.12 数据分析第52-53页
3 结果第53-88页
    3.1 BRL细胞生长形态第53-54页
    3.2 MTT实验筛选喹赛多作用下有利于细胞生长的条件第54-56页
    3.3 细胞总RNA浓度及完整性检验结果第56-57页
    3.4 引物可靠性验证结果第57-59页
        3.4.1 熔解曲线和扩增曲线结果第57页
        3.4.2 部分基因PCR产物验证结果第57-59页
    3.5 喹赛多对BRL细胞中生长相关的基因mRNA表达变化的影响第59-61页
    3.6 喹赛多与BRL细胞作用后提取基因组DNA第61-62页
    3.7 喹赛多作用下基因组DNA甲基化情况第62-65页
    3.8 喹赛多作用下IGF-1启动子区域DNA甲基化情况第65-67页
    3.9 喹赛多作用下细胞内与DNA甲基化相关基因mRNA的表达变化情况第67-69页
    3.10 喹赛多作用下对组蛋白修饰的影响第69-71页
        3.10.1 BCA工作曲线用于测定蛋白浓度第69页
        3.10.2 喹赛多对细胞中组蛋白H3K27ac的影响第69-70页
        3.10.3 喹赛多对细胞中组蛋白H3K4me3的影响第70-71页
    3.11 喹赛多对基因IGF-1启动子区域组蛋白修饰(H3K27ac和H3K4me3)的影响第71-78页
        3.11.1 ChIP实验中染色质酶切效果第71-72页
        3.11.2 ChIP实验验证实验的可靠性第72-73页
        3.11.3 喹赛多对IGF-1启动子区域组蛋白H3K4me3的影响第73-75页
        3.11.4 喹赛多对IGF-1启动子区域组蛋白H3K27ac的影响第75-78页
    3.12 药物作用下对细胞内组蛋白修饰相关基因mRNA表达变化的影响第78-82页
        3.12.1 喹赛多作用于BRL细胞后组蛋白甲基化相关基因mRNA表达变化情况第78-80页
        3.12.2 喹赛多作用于BRL细胞后组蛋白乙酰化相关基因mRNA表达变化情况第80-82页
    3.13 喹赛多对细胞内染色质结构的影响第82-88页
4 讨论第88-94页
    4.1 喹赛多作用下有利于BRL细胞生长的条件第88-89页
    4.2 喹赛多可以影响细胞中DNA甲基化水平促进生长第89-91页
    4.3 喹赛多可以影响细胞内的组蛋白修饰水平促进生长第91-93页
    4.4 喹赛多可以影响染色质的结构有利于基因的表达第93-94页
5 全文总结第94-97页
6 文献综述:表观遗传学及其研究方法第97-107页
    6.1 前言第97-98页
    6.2 DNA甲基化及其研究方法第98-102页
        6.2.1 DNA甲基化第98-99页
        6.2.2 DNA甲基化研究方法第99-102页
    6.3 组蛋白修饰及其研究方法第102-104页
        6.3.1 组蛋白修饰第102-103页
        6.3.2 组蛋白修饰的研究方法第103-104页
    6.4 非编码RNA及其检测技术第104-105页
        6.4.1 非编码RNA第104页
        6.4.2 非编码RNA检测技术第104-105页
    6.5 结语第105-107页
参考文献第107-119页
致谢第119-120页
附录第120-143页
    Ⅰ 个人简介第120-121页
    Ⅱ 实验的操作规程第121-128页
    Ш 大鼠的IGF-1启动子区域序列及用Meth Primer 2.0设计的用于BSP法的DNA甲基化引物第128-135页
    Ⅳ 实时荧光定量PCR各基因扩增曲线分析结果第135-141页
    Ⅴ 答辩主要问题的问答与论文修改第141-143页

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