摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
符号说明及缩写词 | 第11-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-30页 |
1.1 原核生物中信号转导和转录调控机制 | 第13-22页 |
1.1.1 单组分系统 | 第13-15页 |
1.1.2 双组份系统 | 第15-17页 |
1.1.3 ECF-σ因子参与的信号转导系统 | 第17-22页 |
1.2 粘细菌 | 第22-27页 |
1.2.1 粘细菌概述 | 第22-25页 |
1.2.2 粘细菌中的信号转导系统 | 第25页 |
1.2.3 粘细菌中ECF-σ因子参与的信号转导系统 | 第25-27页 |
1.3 本论文开展思路和研究内容 | 第27-30页 |
第二章 ECF-σ因子MXAN_3959/MXAN_7214的高温应答 | 第30-71页 |
2.1 引言 | 第30-31页 |
2.2 实验材料 | 第31-35页 |
2.2.1 菌株与质粒 | 第31-32页 |
2.2.2 培养基 | 第32-33页 |
2.2.3 试剂配制 | 第33-34页 |
2.2.4 试剂的购置 | 第34页 |
2.2.5 仪器设备 | 第34-35页 |
2.3 实验方法 | 第35-51页 |
2.3.1 生物信息学分析网站 | 第35-36页 |
2.3.2 回补突变株在设定条件下的生长检测 | 第36页 |
2.3.3 荧光定量PCR | 第36-38页 |
2.3.4 共转录分析 | 第38-39页 |
2.3.5 细菌双杂交系统筛选与ECF-σ因子相互作用的anti-σ因子 | 第39-43页 |
2.3.6 5'-RACE测定相关ECF-σ因子的转录起始位点 | 第43-46页 |
2.3.7 异源体内结合体系的建立及验证 | 第46页 |
2.3.8 ECF-σ因子蛋白异源表达 | 第46-51页 |
2.4 结果与讨论 | 第51-71页 |
2.4.1 基因缺失表型的回补验证 | 第51-53页 |
2.4.2 高温条件下MXAN_3959/MXAN_7214基因表达量的分析 | 第53-55页 |
2.4.3 基因MXAN_3959/MXAN_7214与其相邻基因的共转录分析 | 第55-57页 |
2.4.4 ECF-σ因子相互作用的anti-σ因子 | 第57-60页 |
2.4.5 ECF-σ因子转录起始位点的确定 | 第60-63页 |
2.4.6 ECF-σ因子下游调控基因启动子的预测分析 | 第63-66页 |
2.4.7 ECF-σ因子与其自身启动子的结合活性 | 第66-67页 |
2.4.8 ECF-σ因子pulldown调控基因 | 第67-71页 |
第三章 ECF-σ因子MXAN_4147的多信号刺激应答 | 第71-85页 |
3.1 引言 | 第71-72页 |
3.2 实验材料 | 第72-73页 |
3.2.1 菌株与质粒 | 第72页 |
3.2.2 培养基 | 第72页 |
3.2.3 试剂配制 | 第72-73页 |
3.2.4 试剂的购置 | 第73页 |
3.2.5 仪器设备 | 第73页 |
3.3 实验方法 | 第73页 |
3.3.1 生物信息学分析网站 | 第73页 |
3.3.2 荧光定量PCR | 第73页 |
3.3.3 共转录分析 | 第73页 |
3.3.4 细菌双杂交系统筛选与ECF-σ因子相互作用的anti-σ因子 | 第73页 |
3.3.5 ECF-σ因子蛋白异源表达 | 第73页 |
3.4 结果与讨论 | 第73-85页 |
3.4.1 特定条件下ECF-σ因子MXAN_4147和anti-σ因子MXAN_4148基因表达量的分析 | 第73-78页 |
3.4.2 基因MXAN_4147与其相邻基因的共转录分析 | 第78-80页 |
3.4.3 ECF-σ因子相互作用的anti-σ因子 | 第80-82页 |
3.4.4 ECF-σ因子pulldown调控基因 | 第82-85页 |
第四章 黄色粘球菌DZ2中次级代谢产物合成相关ECF-σ因子的筛选 | 第85-97页 |
4.1 引言 | 第85-86页 |
4.2 实验材料 | 第86-90页 |
4.2.1 菌株与质粒 | 第86-90页 |
4.2.2 培养基 | 第90页 |
4.2.3 试剂配制 | 第90页 |
4.2.4 试剂的购置 | 第90页 |
4.2.5 仪器设备 | 第90页 |
4.3 实验方法 | 第90-91页 |
4.3.1 利用指示菌株Acinetobacter baumannii 19606 COLR初筛实验 | 第90-91页 |
4.3.2 利用指示菌株E.coli K12 MG1655复筛实验 | 第91页 |
4.3.3 次级代谢产物合成相关ECF-σ因子的生物信息学分析 | 第91页 |
4.4 结果与讨论 | 第91-97页 |
4.4.1 利用Acinetobacter baumannii1 9606 COLR初筛实验结果 | 第91-93页 |
4.4.2 利用E. coli K12 MG1655复筛实验结果 | 第93-94页 |
4.4.3 次级代谢产物合成相关ECF-σ因子的生物信息学分析 | 第94-97页 |
总结和展望 | 第97-99页 |
附录 | 第99-103页 |
参考文献 | 第103-113页 |
致谢 | 第113-114页 |
学位论文评阅及答辩情况表 | 第114页 |