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利用同源模建对蛋白的抗原表位预测和抑制机理分析

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
引言第12-13页
1 文献综述第13-25页
    1.1 同源模建第13-14页
        1.1.1 同源模建简介第13页
        1.1.2 同源模建的基本步骤第13-14页
    1.2 分子对接第14-16页
        1.2.1 分子对接简介第14-15页
        1.2.2 分子对接的基本步骤第15-16页
    1.3 降纤酶及免疫原性第16-19页
        1.3.1 降纤酶的临床应用及主要问题第16页
        1.3.2 免疫原性第16-19页
    1.4 果胶甲基酯酶第19-21页
        1.4.1 果胶甲基酯酶概述第19-20页
        1.4.2 黄曲霉果胶甲基酯酶抑制剂的研究意义第20-21页
    1.5 趋化因子第21-23页
        1.5.1 趋化因子简介第21-22页
        1.5.2 趋化因子表达与纯化的研究进展第22-23页
        1.5.3 趋化因子及其受体抑制剂的研究进展第23页
    1.6 选题依据和研究内容第23-25页
        1.6.1 选题依据第23-24页
        1.6.2 研究内容第24-25页
2 白眉蝮蛇降纤酶的同源模建及B细胞抗原表位预测第25-36页
    2.1 引言第25-26页
    2.2 材料与方法第26-27页
        2.2.1 降纤酶氨基酸序列选择第26页
        2.2.2 白眉蝮蛇降纤酶的线性抗原表位预测第26-27页
        2.2.3 序列比对和基因树第27页
        2.2.4 白眉蝮蛇降纤酶的同源模建第27页
        2.2.5 白眉蝮蛇降纤酶的构象型抗原表位预测第27页
    2.3 结果与分析第27-35页
        2.3.1 白眉蝮蛇降纤酶的氨基酸序列第27-28页
        2.3.2 白眉蝮蛇降纤酶的二级结构及B细胞线性抗原表位的预测结果第28-31页
        2.3.3 白眉蝮蛇降纤酶的同源模建结果第31-33页
        2.3.4 白眉蝮蛇降纤酶的B细胞构象型抗原表位第33-35页
    2.4 小结第35-36页
3 黄曲霉果胶甲基酯酶的同源模建及其抑制机理分析第36-47页
    3.1 引言第36-37页
    3.2 材料与方法第37-39页
        3.2.1 黄曲霉果胶甲基酯酶的序列确定第37页
        3.2.2 多重序列比对第37页
        3.2.3 模型的能量最小化优化与评价第37页
        3.2.4 分子对接第37-39页
    3.3 结果与分析第39-46页
        3.3.1 Blastp序列比对结果第39-40页
        3.3.2 PROMAL 3D序列比对结果第40-42页
        3.3.3 同源模建第42页
        3.3.4 同源模建的评价第42-44页
        3.3.5 抑制剂的分子对接结果第44-46页
    3.4 小结第46-47页
4 人来源趋化因子CCL 1的重组制备、同源模建及抑制机理分析第47-57页
    4.1 引言第47页
    4.2 材料与方法第47-50页
        4.2.1 实验材料第47-48页
        4.2.2 pET-28a(+)-CCL1表达载体转化大肠杆菌BL21(DE3)第48-49页
        4.2.3 重组人来源趋化因子CCL1的表达第49页
        4.2.4 重组人来源趋化因子CCL1的分离纯化第49页
        4.2.5 Western blotting第49-50页
        4.2.6 重组人来源趋化因子CCL1的复性第50页
        4.2.7 酶活力检测和抑制剂的筛选第50页
        4.2.8 同源模建与分子对接第50页
    4.3 结果与分析第50-56页
        4.3.1 阳性克隆的筛选第50-51页
        4.3.2 CCL1在大肠杆菌细胞中的表达第51-52页
        4.3.3 人来源的趋化因子CCL1的分离纯化第52页
        4.3.4 人来源趋化因子CCL1的同源模建第52-53页
        4.3.5 人来源趋化因子CCL1抑制剂的筛选及抑制机理分析第53-56页
    4.4 小结第56-57页
结论第57-58页
参考文献第58-65页
附录A 常用仪器一览表第65-66页
附录B 大肠杆菌转化第66-67页
附录C Western Blotting第67-68页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第68-69页
致谢第69-70页

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