| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 1 引言 | 第12-24页 |
| 1.1 肠道菌群的概述 | 第12-13页 |
| 1.2 影响肠道菌群的因素 | 第13-15页 |
| 1.2.1 宿主基因 | 第13页 |
| 1.2.2 年龄 | 第13-14页 |
| 1.2.3 疾病 | 第14页 |
| 1.2.4 药物 | 第14-15页 |
| 1.3 膳食对肠道菌群的影响 | 第15-21页 |
| 1.3.1 膳食蛋白质与肠道菌群 | 第15-16页 |
| 1.3.2 膳食脂肪与肠道菌群 | 第16页 |
| 1.3.3 膳食碳水化合物与肠道菌群 | 第16-21页 |
| 1.4 高通量技术在肠道菌群中应用的研究进展 | 第21-22页 |
| 1.5 蒙古族膳食特点及肠道菌群的研究现状 | 第22-23页 |
| 1.6 立题意义与研究内容 | 第23-24页 |
| 1.6.1 立题目的与意义 | 第23页 |
| 1.6.2 主要研究内容 | 第23-24页 |
| 2 材料和方法 | 第24-32页 |
| 2.1 试验设计 | 第24页 |
| 2.2 试验材料 | 第24-26页 |
| 2.2.1 志愿者信息 | 第24-25页 |
| 2.2.2 仪器和试剂 | 第25-26页 |
| 2.3 试验方法 | 第26-32页 |
| 2.3.1 样品采集及保存 | 第26页 |
| 2.3.2 样品宏基因组DNA的提取 | 第26页 |
| 2.3.3 细菌16S rRNA序列扩增及纯化 | 第26-27页 |
| 2.3.4 基因测序文库构建及测序 | 第27-28页 |
| 2.3.5 测序数据质量控制 | 第28页 |
| 2.3.6 测序结果生物信息学分析 | 第28-30页 |
| 2.3.7 肠道菌群的荧光定量(q-PCR) | 第30-31页 |
| 2.3.8 统计学分析 | 第31页 |
| 2.3.9 测序数据登录号 | 第31-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-82页 |
| 3.1 膳食中营养素含量分析 | 第32-39页 |
| 3.2 基于16S rRNA的测序结果分析主食变换对志愿者肠道菌群结构的影响 | 第39-63页 |
| 3.2.1 主食变换对志愿者肠道菌群α多样性的影响 | 第39-41页 |
| 3.2.2 主食变换对志愿者肠道菌群β多样性的影响 | 第41-43页 |
| 3.2.3 OTUs水平上主食变换对志愿者肠道菌群结构的影响 | 第43-45页 |
| 3.2.4 主食变换对志愿者肠道菌群相对含量的影响 | 第45-56页 |
| 3.2.5 肠道菌群的定量分析 | 第56-59页 |
| 3.2.6 主食变换过程中志愿者肠道菌群的PAM聚类分析 | 第59-63页 |
| 3.3 基于shotgun宏基因组测序结果分析主食变换对志愿者肠道菌群功能的影响 | 第63-82页 |
| 3.3.1 基于宏基因组测序结果主食变换对志愿者肠道菌群结构的影响 | 第63-68页 |
| 3.3.2 主食变换对志愿者肠道菌群功能的影响 | 第68-73页 |
| 3.3.3 主食变换对肠道菌群中碳水化合物活性酶的影响 | 第73-77页 |
| 3.3.4 肠道菌群与功能相关性分析 | 第77-78页 |
| 3.3.5 肠道菌群与噬菌体的协同作用 | 第78-79页 |
| 3.3.6 主食变换对肠道菌群影响程度分析 | 第79-80页 |
| 3.3.7 肠道菌群与膳食中主要营养素的线性关系 | 第80-82页 |
| 4 讨论 | 第82-87页 |
| 5 结论 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88-89页 |
| 参考文献 | 第89-102页 |
| 附录 | 第102-110页 |
| 作者简介 | 第110-111页 |
