| 摘要 | 第8-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-21页 |
| 1. 植物抗病机制 | 第10-13页 |
| 1.1 植物抗病性 | 第10页 |
| 1.2 抗病基因的作用机理 | 第10-13页 |
| 1.2.1 抗病基因的特征和分类 | 第10-12页 |
| 1.2.2 植物抗病的分子机制 | 第12-13页 |
| 2. NBS类型抗病基因家族 | 第13-16页 |
| 2.1 NBS类型基因的起源和进化 | 第13-14页 |
| 2.2 NBS类型基因的结构和功能 | 第14-15页 |
| 2.3 NBS类型基因的特征和分类 | 第15-16页 |
| 2.4 禾本科作物NBS类型基因的研究进展 | 第16页 |
| 3. 晋谷21和晋汾52概述 | 第16-17页 |
| 4. 全基因组重测序技术 | 第17-18页 |
| 4.1 高通量测序技术简介 | 第17-18页 |
| 4.2 重测序技术研究进展 | 第18页 |
| 5. 本研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 6. 本研究的创新性及技术路线 | 第19-21页 |
| 第二章 谷子NBS基因家族的鉴定、定位及系统发育关系 | 第21-35页 |
| 1. 晋谷21和晋汾52全基因组重测序 | 第21-29页 |
| 1.1 材料与方法 | 第21-23页 |
| 1.1.1 试验材料与数据来源 | 第21页 |
| 1.1.2 晋谷21与晋汾52基因组DNA的提取 | 第21-22页 |
| 1.1.3 DNA质量检测 | 第22页 |
| 1.1.4 基因组DNA的重测序 | 第22-23页 |
| 1.1.5 晋谷21和晋汾52重测序数据分析 | 第23页 |
| 1.2 结果与分析 | 第23-29页 |
| 1.2.1 DNA质量检测 | 第23页 |
| 1.2.2 基因组DNA完整性及纯度重检测 | 第23-24页 |
| 1.2.3 晋谷21和晋汾52全基因组重测序分析 | 第24-29页 |
| 2. 谷子NBS类型基因的进化分析 | 第29-33页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-30页 |
| 2.1.1 NBS类型基因的鉴定 | 第29页 |
| 2.1.2 NBS类型基因的定位 | 第29页 |
| 2.1.3 NBS类型基因系统进化树的构建 | 第29-30页 |
| 2.2 结果与分析 | 第30-33页 |
| 2.2.1 NBS类型基因的确定 | 第30页 |
| 2.2.2 晋谷21和晋汾52在NBS保守结构域上的差异 | 第30-31页 |
| 2.2.3 NBS类型基因的定位 | 第31-32页 |
| 2.2.4 NBS类型基因的系统发育关系分析 | 第32-33页 |
| 3. 讨论 | 第33-35页 |
| 第三章 基于全基因组重测序对NBS家族基因差异的分析 | 第35-42页 |
| 1. 材料与方法 | 第35-38页 |
| 1.1 晋谷21和晋汾52NBS基因SNP位点的分析 | 第35-36页 |
| 1.1.1 SNP的概念及特点 | 第35页 |
| 1.1.2 SNP的检测方法 | 第35-36页 |
| 1.1.3 核苷酸序列及其多态性分析 | 第36页 |
| 1.2 晋谷21和晋汾52 NBS基因InDel位点的分析 | 第36-37页 |
| 1.2.1 InDel的概念及特点 | 第36页 |
| 1.2.2 InDel位点分析 | 第36-37页 |
| 1.3 晋谷21和晋汾52 NBS基因CNV位点的分析 | 第37页 |
| 1.3.1 CNV的概念及特点 | 第37页 |
| 1.3.2 CNV位点分析 | 第37页 |
| 1.4 晋谷21和晋汾52 NBS基因SV位点的分析 | 第37-38页 |
| 1.4.1 SV的概念及特点 | 第37-38页 |
| 1.4.2 SV位点分析 | 第38页 |
| 2. 结果与分析 | 第38-41页 |
| 2.1 晋谷21和晋汾52 NBS基因SNP位点的分析 | 第38-39页 |
| 2.2 晋谷21和晋汾52 NBS基因InDel位点的分析 | 第39页 |
| 2.3 晋谷21和晋汾52 NBS基因CNV位点的分析 | 第39-40页 |
| 2.4 晋谷21和晋汾52 NBS基因SV位点的分析 | 第40-41页 |
| 3. 讨论 | 第41-42页 |
| 第四章 晋谷21和晋汾52 NBS差异基因的鉴定与分析 | 第42-54页 |
| 1. 材料与方法 | 第42-44页 |
| 1.1 晋谷21和晋汾52 NBS类型差异基因的鉴定 | 第42-44页 |
| 1.1.1 谷子基因组DNA的提取及质量检测 | 第42页 |
| 1.1.2 NBS目的基因的选择及PCR扩增 | 第42-44页 |
| 1.1.3 NBS目的基因的测序 | 第44页 |
| 1.2 NBS类型差异基因的序列分析 | 第44页 |
| 2. 结果与分析 | 第44-52页 |
| 2.1 晋谷21和晋汾52NBS类型差异基因的鉴定 | 第44-45页 |
| 2.1.1 基因组DNA的提取 | 第44-45页 |
| 2.1.2 NBS目的基因的PCR扩增 | 第45页 |
| 2.2 NBS类型差异基因核苷酸序列分析 | 第45-46页 |
| 2.3 NBS类型差异蛋白结构分析 | 第46-49页 |
| 2.3.1 NBS基因编码的氨基酸序列 | 第46-48页 |
| 2.3.2 谷子NBS蛋白特性、二级结构分析及三级结构的预测 | 第48-49页 |
| 2.4 目的基因在禾本科植物中的进化分析 | 第49-52页 |
| 3. 讨论 | 第52-54页 |
| 全文总结 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| Abstract | 第60-61页 |
| 致谢 | 第62页 |
