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桑树扦插生根的转录组分析及MaSAUR2和MaHO-1基因的表达分析

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
目录第10-16页
注释表第16-17页
第1章 绪论第17-27页
   ·研究背景第17-24页
     ·桑树的概述第17-18页
     ·桑树的繁殖培育第18-19页
     ·桑树的扦插繁育第19-20页
     ·扦插生根的分子机理第20页
     ·转录组测序第20-22页
     ·SAUR 家族基因的研究现状第22-23页
     ·HO-1 基因的研究现状第23-24页
   ·研究的目的及意义第24页
   ·研究内容第24-27页
     ·桑树两种扦插方式生根过程转录组数据分析第24页
     ·MaSAUR2 基因的初步分析第24-25页
     ·MaHO-1 基因的初步分析第25-27页
第2章 桑树两种扦插方式生根过程转录组测序结果分析第27-51页
   ·植物材料第27-28页
   ·试验方法第28-29页
     ·转录组数据库的获得第28页
     ·转录组数据分析方法第28-29页
   ·RNA-seq 数据的检测与分析第29-47页
     ·测序质量的检测第29-31页
     ·Contig 的长度频数统计分析第31-32页
     ·蛋白功能注释第32-33页
     ·GO 功能分类第33-35页
     ·KEGG 代谢途径分析第35-38页
     ·差异基因的筛选和初步分析第38-43页
     ·差异基因的 GO 和 KEGG 功能富集第43-47页
   ·讨论第47-51页
第3章 桑树 MaSAUR2 基因的克隆、序列特征及表达特异性分析第51-69页
   ·材料与试剂第52-53页
     ·植物材料、菌种、载体第52页
     ·酶和试剂第52页
     ·基本溶液的配置第52-53页
     ·引物的设计与合成第53页
   ·方法第53-60页
     ·桑树 SAUR2 基因克隆第53-57页
     ·桑树 MaSAUR2 基因及其编码蛋白质序列的生物信息学分析第57-58页
     ·检测桑树 MaSAUR2 基因在不同组织中的表达情况第58-59页
     ·检测 IAA 诱导桑树 MaSAUR2 基因的表达变化第59-60页
     ·检测桑树 MaSAUR2 基因在绿枝扦插生根过程中的表达变化第60页
   ·结果与分析第60-66页
     ·桑树 MaSAUR2 基因的克隆与测序鉴定第60-61页
     ·桑树 MaSAUR2 基因及其编码蛋白质的序列特征第61-62页
     ·桑树 MaSAUR2 基因编码氨基酸的同源性与系统进化分析第62-64页
     ·桑树 MaSAUR2 基因在不同组织中的表达情况第64-65页
     ·IAA 诱导桑树 MaSAUR2 基因的表达变化第65-66页
     ·桑树 MaSAUR2 基因在绿枝扦插生根过程中的表达变化第66页
   ·讨论第66-69页
第4章 桑树 MaHO-1 基因的克隆、序列特征及表达特异性分析第69-85页
   ·材料与试剂第70-71页
     ·植物材料、菌种、载体第70页
     ·酶和试剂第70页
     ·基本溶液的配置第70页
     ·引物的设计与合成第70-71页
   ·方法第71-74页
     ·桑树 HO-1 基因的克隆第71-72页
     ·桑树 HO-1 基因及其编码蛋白质序列的生物信息学分析第72页
     ·检测桑树 MaHO-1 基因在不同组织中的表达情况第72-73页
     ·检测 IAA 诱导桑树 MaHO-1 基因的表达变化第73页
     ·检测桑树 MaHO-1 基因在绿枝扦插生根过程中的表达变化第73-74页
     ·绿枝扦插生根过程中 HO 酶活性变化检测第74页
   ·结果与分析第74-82页
     ·桑树 MaHO-1 基因的克隆与测序鉴定第74-75页
     ·桑树 MaHO-1 基因及其编码蛋白质的序列特征第75-77页
     ·桑树 MaHO-1 基因编码氨基酸的同源性与系统进化分析第77-79页
     ·桑树 MaHO-1 基因在不同组织中的表达情况第79-80页
     ·IAA 诱导桑树 MaHO-1 基因的表达变化第80-81页
     ·桑树 MaHO-1 基因在期绿枝扦插生根过程中的表达变化第81页
     ·桑树 MaHO-1 在绿枝扦插生根过程中的酶活性变化第81-82页
   ·讨论第82-85页
结论第85-89页
参考文献第89-95页
附录第95-97页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第97-99页
致谢第99页

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