比较基因组学信息可视化系统(CGVS系统)开发与应用
| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第8-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 图目录 | 第11-12页 |
| 表目录 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-17页 |
| ·研究背景 | 第13页 |
| ·比较基因组学 | 第13-14页 |
| ·信息可视化 | 第14页 |
| ·比较基因组学可视化分析工具 | 第14-16页 |
| ·本章小结 | 第16-17页 |
| 第二章 比较基因组学研究 | 第17-25页 |
| ·序列比对 | 第17-19页 |
| ·双序列比对 | 第17-18页 |
| ·多序列比对 | 第18-19页 |
| ·直系同源基因鉴定 | 第19-20页 |
| ·同源基因 | 第19页 |
| ·直系同源基因鉴定 | 第19-20页 |
| ·基因保守性和共线性 | 第20页 |
| ·基因组变异分析 | 第20-21页 |
| ·泛基因组分析 | 第21-23页 |
| ·细菌基因组与细菌比较基因组学 | 第21-22页 |
| ·泛基因组分析 | 第22-23页 |
| ·本章小结 | 第23-25页 |
| 第三章 比较基因组学信息可视化 | 第25-41页 |
| ·总体设计 | 第25-28页 |
| ·基本架构及功能设计 | 第25-26页 |
| ·系统运行环境和开发工具 | 第26-27页 |
| ·系统功能模块 | 第27-28页 |
| ·样本和分析 | 第28-30页 |
| ·研究对象和数据准备 | 第28页 |
| ·构建局部多序列比对结果 | 第28-29页 |
| ·构建直系同源基因类 | 第29页 |
| ·分析基因组变异 | 第29-30页 |
| ·分析泛基因组特征 | 第30页 |
| ·多序列比对结果的可视化 | 第30-35页 |
| ·直系同源基因鉴定和基因保守性可视化 | 第35-37页 |
| ·基因组变异分析可视化 | 第37-39页 |
| ·基因组区域变异分析可视化 | 第37-38页 |
| ·基因变异分析可视化 | 第38-39页 |
| ·泛基因组分析可视化 | 第39-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 总结和展望 | 第41-43页 |
| 参考文献 | 第43-49页 |
| 附录 | 第49-53页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第53页 |