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猪ATF4基因遗传多态性及启动子区域研究

摘要第1-10页
Abstract第10-12页
前言第12-16页
 1 与脂肪组织代谢调节相关的基因第12-14页
   ·PPAR第12-13页
   ·PGC1第13页
   ·SREBPs第13-14页
   ·LEPTIN第14页
 2 ATF4基因的研究进展第14-16页
第一部分:猪ATF4基因表达分析及其与生产性状的关联分析第16-29页
 1 实验目的第16页
 2 材料和方法第16-23页
   ·试验材料第16-17页
     ·实验猪种第16-17页
     ·相关组织样品第17页
   ·实验方法第17-23页
     ·猪血液基因组DNA提取及检测第17-18页
     ·猪各组织总RNA的提取第18-19页
     ·提取总RNA检测及浓度测定第19页
     ·提取总RNA的处理及反转录成cDNA的步骤第19-20页
     ·目的基因ATF4的获取第20-21页
     ·PCR扩增及序列分析第21页
     ·PCR-RFLP分型第21-22页
     ·数据统计分析第22页
     ·表达谱分析第22-23页
 3 结果与分析第23-27页
   ·猪ATF4基因的克隆及序列分析第23-24页
   ·猪ATF4基因的SNP研究第24-25页
   ·猪ATF4基因AluI-RFLP基因型与生产性状的关联分析第25-26页
   ·猪ATF4基因在大白猪和梅山猪背最长肌的表达分析第26页
   ·猪ATF4基因在大白猪和梅山猪不同组织中的表达分析第26-27页
 4 讨论第27-29页
第二部分:猪ATF4基因启动子区域分析及活性鉴定第29-41页
 1 实验目的第29页
 2 实验材料与方法第29-32页
   ·实验材料第29页
   ·引物的设计及启动子的克隆第29-30页
   ·猪ATF4启动子缺失片段报告基因载体的构建第30-31页
   ·细胞的培养前准备工作及细胞的培养第31-32页
   ·猪ATF4启动子报告基因的转染第32页
   ·猪ATF4启动子报告基因的活性检测第32页
 3. 结果与分析第32-39页
   ·猪ATF4启动子的生物信息学分析及预测第32-34页
     ·猪ATF4基因CpG岛的预测第32-33页
     ·猪ATF4基因转录因子结合位点及转录起始位点的预测第33-34页
   ·猪ATF4启动子的克隆鉴定第34-37页
   ·猪ATF4启动子缺失片段报告基因的检测第37-38页
   ·猪ATF4启动子活性的检测第38-39页
 4 讨论第39-41页
第三部分:猪ATF4基因真核表达载体的构建第41-51页
 1 实验目的第41页
 2 材料和方法第41-45页
   ·试验材料第41-42页
     ·实验样品第41页
     ·主要试剂和试剂盒第41-42页
     ·菌种、载体和细胞第42页
     ·主要的试验仪器与设备第42页
     ·常用的生物学网站及相关软件第42页
   ·实验方法第42-45页
     ·猪ATF4全长cDNA的获得第42-43页
     ·猪ATF4克隆及鉴定第43页
     ·pcDNA3.1(+)-ATF4真核超表达载体的构建及酶切鉴定第43-44页
     ·pcDNA3.1(+)-ATF4重组质粒转染细胞第44页
     ·细胞RNA的提取及反转录第44-45页
     ·实时荧光定量PCR检测第45页
 3 实验结果与分析第45-49页
   ·mRNA分离与cDNA合成第45-46页
   ·pcDNA3.1(+)-ATF4重组体酶切鉴定第46-47页
   ·pcDNA3.1(+)-ATF4重组质粒转染细胞第47-48页
   ·转染细胞RNA的提取及反转录第48-49页
   ·实时荧光定量PCR第49页
 4 讨论第49-51页
第四部分:全文讨论及总结第51-55页
 1 讨论第51-54页
   ·关于基因功能研究方法第51-52页
   ·关于SNP和性状关联分析第52页
   ·关于ATF4基因的表达分析第52-53页
   ·关于研究启动子的作用及研究的意义第53-54页
   ·关于真核表达载体的构建及验证第54页
 2 下一步的工作第54-55页
参考文献第55-60页
附录第60-62页
致谢第62页

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