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苹果MdMYB1启动子甲基化对套袋果实着色的调控研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
第一章 引言第15-27页
    1.1 苹果色泽及其影响因子第15-17页
        1.1.1 苹果品种间的色泽差异第15页
        1.1.2 光照和套袋对苹果色泽的影响第15-17页
    1.2 苹果花青苷的合成及其调控第17-24页
        1.2.1 花青苷的组成及功能第17-19页
        1.2.2 花青苷的生物合成途径第19-20页
        1.2.3 调控花青苷合成的转录因子第20-24页
    1.3 果实色泽变异的分子机理第24-26页
        1.3.1 基因结构的突变第24页
        1.3.2 反转录转座子的变化第24-25页
        1.3.3 DNA序列的甲基化第25-26页
    1.4 本研究的目的与意义第26-27页
第二章 不同色泽类型苹果套袋处理后的着色差异第27-45页
    2.1 材料与方法第27-29页
        2.1.1 试验材料和处理第27-28页
        2.1.2 主要试验仪器和试剂第28页
        2.1.3 试验方法第28-29页
    2.2 结果与分析第29-43页
        2.2.1 苹果解袋后果皮色泽参数的变化第30-35页
        2.2.2 苹果解袋后花青苷含量的变化第35-36页
        2.2.3 苹果解袋后叶绿素含量的变化第36-37页
        2.2.4 苹果解袋后类胡萝卜素含量的变化第37-38页
        2.2.5 苹果解袋后花青苷合成相关结构基因的表达分析第38-40页
        2.2.6 苹果解袋后花青苷合成相关调节基因的表达分析第40-41页
        2.2.7 苹果解袋后类黄酮相关基因FLS、LAR和ANR的表达分析第41-43页
    2.3 讨论第43-45页
        2.3.1 套袋处理对不同色泽类型苹果中色素含量的影响第43页
        2.3.2 不同色泽类型苹果花青苷合成相关基因的差异表达第43-45页
第三章 ‘澳洲青苹’套袋处理后果皮的转录组测序与分析第45-79页
    3.1 材料与方法第45-47页
        3.1.1 试验材料及处理第45页
        3.1.2 试验方法第45-46页
        3.1.3 差异表达基因分析第46页
        3.1.4 差异基因的富集分析第46页
        3.1.5 WGCNA共表达网络的构建第46-47页
    3.2 结果与分析第47-76页
        3.2.1 解袋后‘澳洲青苹’果皮的着色变化第47页
        3.2.2 RNA-Seq数据分析第47-49页
        3.2.3 差异基因的筛选及表达第49-51页
        3.2.4 差异基因的功能富集分析第51-64页
        3.2.5 各处理组中差异基因的表达模式第64-67页
        3.2.6 光信号的接收和转导第67-68页
        3.2.7 植物激素信号转导第68-70页
        3.2.8 氧化胁迫第70页
        3.2.9 花青苷合成相关的WGCNA模块第70-72页
        3.2.10 花青苷生物合成通路基因的表达分析第72-73页
        3.2.11 qRT-PCR验证转录组测序结果第73-76页
    3.3 讨论第76-79页
        3.3.1 光诱导‘澳洲青苹’花青苷合成的信号转导途径第76页
        3.3.2 参与套袋诱导果实着色的植物激素第76-77页
        3.3.3 解袋后苹果果皮中活性氧清除酶系统第77-78页
        3.3.4 WGCNA模型与花青苷合成高度相关第78-79页
第四章 苹果解袋处理后MdMYB1基因启动子的克隆与甲基化分析第79-88页
    4.1 材料与方法第79-81页
        4.1.1 试验材料和处理第79页
        4.1.2 主要试验仪器和试剂第79页
        4.1.3 试验方法第79-81页
    4.2 结果与分析第81-84页
        4.2.1 苹果叶片和果皮的DNA样品质量检测第81-82页
        4.2.2 MdMYB1基因组序列的扩增第82页
        4.2.3 不同色泽类型苹果MdMYB1启动子的克隆与差异分析第82-83页
        4.2.4 ‘澳洲青苹’及‘金冠’解袋处理后果皮MdMYB1启动子甲基化水平的对比第83-84页
    4.3 讨论第84-88页
        4.3.1 非红色苹果果皮中MdMYB1转录水平的上调与花青苷合成的关系第84-86页
        4.3.2 苹果MdMYB1启动子甲基化对解袋处理后果皮花青苷积累的影响第86页
        4.3.3 ‘澳洲青苹’和‘金冠’果实着色的模式示意图第86-88页
第五章 去甲基化试剂处理对苹果着色的影响第88-111页
    5.1 材料与方法第88-89页
        5.1.1 试验材料和处理第88页
        5.1.2 主要试验仪器和试剂第88-89页
        5.1.3 试验方法第89页
    5.2 结果与分析第89-108页
        5.2.1 不同浓度的去甲基化试剂对果实a~*值的影响第89-91页
        5.2.2 5-Aza-dC处理解袋后苹果的色泽变化第91页
        5.2.3 去甲基化试剂对苹果花青苷、叶绿素及类胡萝卜素含量的影响第91-93页
        5.2.4 去甲基化试剂对花青苷合成相关结构基因的表达分析第93-94页
        5.2.5 去甲基化试剂对花青苷合成相关调节基因的表达分析第94-95页
        5.2.6 去甲基化试剂对类黄酮相关基因FLS、LAR和ANR基因的表达分析第95-96页
        5.2.7 5-Aza-dC处理后‘澳洲青苹’和‘金冠’果皮中MdMYB1启动子甲基化水平的变化第96-97页
        5.2.8 RNA-Seq数据分析和基因统计第97-98页
        5.2.9 样品间基因表达量相关性分析第98-99页
        5.2.10 差异基因的筛选及表达第99-100页
        5.2.11 差异表达基因的GO功能富集第100-102页
        5.2.12 差异基因的KEGG pathway分析第102-104页
        5.2.13 花青苷生物合成通路基因的表达分析第104-105页
        5.2.14 转录因子的差异表达第105-106页
        5.2.15 甲基化酶基因的差异表达第106页
        5.2.16 qRT-PCR验证转录组测序结果第106-108页
    5.3 讨论第108-111页
        5.3.1 去甲基化试剂5-aza-dC处理对解袋后苹果果皮花青苷积累的影响第108页
        5.3.2 去甲基化试剂5-aza-dC处理对‘澳洲青苹’果皮中MdMYB1的表观调控第108-109页
        5.3.3 5-Aza-dC影响‘澳洲青苹’果皮中花青苷的合成第109页
        5.3.4 5-Aza-dC处理后与花青苷合成相关的其他转录因子第109-111页
第六章 结论与展望第111-112页
    6.1 结论第111页
    6.2 展望第111-112页
参考文献第112-127页
附录第127-139页
缩略词第139-141页
致谢第141-142页
个人简历第142-143页

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