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基于组学技术研究仔鹅饲粮中添加甜菜碱替代蛋氨酸和缓解其中毒的影响机制

中文摘要第3-7页
Abstract第7-11页
符号说明第17-18页
第一章 文献综述第18-34页
    1 蛋氨酸第18-20页
        1.1 蛋氨酸的合成、吸收与代谢第18页
        1.2 蛋氨酸的生物学功能第18-20页
    2 甜菜碱第20-21页
        2.1 甜菜碱的理化特性第20页
        2.2 甜菜碱的甲基供体作用第20-21页
        2.3 甜菜碱参与脂肪代谢作用第21页
        2.4 甜菜碱替代蛋氨酸的研究进展第21页
    3 高同型半胱氨酸血症第21-25页
        3.1 高同型半胱氨酸血症的发病因素第22-23页
        3.2 高同型半胱氨酸血症的发病机制第23-24页
        3.3 甜菜碱对蛋氨酸诱导的仔鹅高同型半胱氨酸血症的缓解作用第24-25页
    4 DNA甲基化及DNA甲基化检测方法的研究进展第25-26页
        4.1 DNA甲基化概述第25页
        4.2 单基因甲基化检测方法第25-26页
        4.3 全基因组甲基化检测方法第26页
    5 本研究的内容与意义第26-29页
    参考文献第29-34页
第二章 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅生长和蛋白质代谢的影响第34-70页
    1 前言第34页
    2 材料与方法第34-38页
        2.1 试验材料与动物第34页
        2.2 试验设计与饲粮第34-36页
        2.3 饲养管理第36页
        2.4 检测指标和方法第36-38页
        2.5 数据统计分析第38页
    3 结果与分析第38-58页
        3.1 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅生长性能的影响第38-39页
        3.2 甜菜碱替代蛋氨酸对70日龄仔鹅体尺性状的影响第39-41页
        3.3 甜菜碱替代蛋氨酸对70日龄仔鹅屠宰性能的影响第41页
        3.4 甜菜碱替代蛋氨酸对70日龄仔鹅脏器指数的影响第41页
        3.5 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅血清生化指标的影响第41页
        3.6 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅养分利用率的影响第41-46页
        3.7 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅氨基酸利用率的影响第46页
        3.8 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅肝脏组分的影响第46页
        3.9 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅胸肌、腿肌组分的影响第46-58页
    4 讨论第58-63页
        4.1 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅生长性能的影响第58页
        4.2 甜菜碱替代蛋氨酸对70日龄仔鹅体尺性状的影响第58-59页
        4.3 甜菜碱替代蛋氨酸对70日龄仔鹅屠宰性能的影响第59-60页
        4.4 甜菜碱替代蛋氨酸对70日龄仔鹅脏器指数的影响第60页
        4.5 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅血清生化指标的影响第60-61页
        4.6 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅养分利用率的影响第61页
        4.7 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅氨基酸利用率的影响第61-62页
        4.8 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅肝脏组分的影响第62-63页
        4.9 甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅胸肌、腿肌组分的影响第63页
    本章小结第63-64页
    参考文献第64-70页
第三章 转录组学研究甜菜碱替代蛋氨酸对仔鹅肝脏基因组表达的影响第70-94页
    1 前言第70页
    2 材料与方法第70-76页
        2.1 原始数据统计分析及差异表达基因的筛选第70-71页
        2.2 差异表达分析第71页
        2.3 实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证第71-72页
        2.4 DNA亚硫酸氢钠修饰法检测基因启动子区域DNA甲基化水平第72-76页
    3 结果与分析第76-89页
        3.1 样品RNA质量检测第76-77页
        3.2 差异表达基因的筛选与鉴定第77-87页
        3.3 候选基因RNA-seq结果及荧光定量结果对比第87页
        3.4 饲粮添加蛋氨酸和甜菜碱对IL4I1和LOC106032502基因启动子区域DNA甲基化水平的影响第87-89页
    4 讨论第89-91页
    数据存储第91页
    本章小结第91-92页
    参考文献第92-94页
第四章 蛋氨酸诱导的高同型半胱氨酸血症仔鹅模型的构建第94-103页
    1 前言第94页
    2 试验设计与材料第94-97页
        2.1 试验材料与动物第94页
        2.2 试验饲粮第94页
        2.3 饲养管理第94-96页
        2.4 检测指标第96-97页
    3 试验结果与分析第97-101页
        3.1 生长性能第97-98页
        3.2 羽毛发育第98页
        3.3 心肌形态第98-100页
        3.4 TUNEL法检测心肌细胞凋亡第100-101页
        3.5 血清同型半胱氨酸水平第101页
    4 讨论第101-102页
    本章小结第102页
    参考文献第102-103页
第五章 全基因组甲基化与LncRNA转录组测序分析高同型半胱氨酸血症对仔鹅心脏组织的影响第103-138页
    1 前言第103页
    2 材料与方法第103-106页
        2.1 试验动物及样品采集第103页
        2.2 全基因组甲基化试验方法第103-104页
        2.3 LncRNA转录组测试验方法第104-106页
        2.4 全基因组与转录组测序联合分析方法第106页
    3 结果与分析第106-130页
        3.1 鹅全基因组甲基化测序数据分析第106-107页
        3.2 甲基化C位点的鉴定及分布特征第107-109页
        3.3 对照组和蛋氨酸中毒组差异甲基化区域的筛选与分析第109-112页
        3.4 差异甲基化基因功能富集分析第112-118页
        3.5 LncRNA转录组测序原始数据统计分析及差异表达基因的筛选第118页
        3.6 筛选LncRNA分类情况第118页
        3.7 不同类型转录本表达水平比较第118-120页
        3.8 差异表达分析第120-121页
        3.9 LncRNA -mRNA联合分析第121页
        3.10 COG功能分析第121-124页
        3.11 全基因组DNA甲基化与LncRNA转录组测序联合分析结果第124-130页
    4 讨论第130-134页
        4.1 全基因组甲基化分析高同型半胱氨酸血症对仔鹅心脏组织的影响第130-131页
        4.2 LncRNA转录组测序分析高同型半胱氨酸血症对仔鹅心脏组织的影响第131-132页
        4.3 全基因组DNA甲基化与LncRNA转录组测序联合分析第132-134页
    本章小结第134-135页
    参考文献第135-138页
第六章 甜菜碱对蛋氨酸诱导的高同型半胱氨酸血症仔鹅的缓解作用第138-156页
    1 前言第138页
    2 试验设计与材料第138-141页
        2.1 试验材料与动物第138页
        2.2 试验饲粮第138页
        2.3 饲养管理第138页
        2.4 检测指标第138-141页
        2.5 数据处理第141页
    3 结果与分析第141-148页
        3.1 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅生长性能的影响第141-142页
        3.2 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅屠宰性能的影响第142页
        3.3 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅血清生化指标的影响第142-143页
        3.4 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅养分利用率的影响第143页
        3.5 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅主翼羽长度的影响第143-145页
        3.6 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅绒羽理化性质的影响第145页
        3.7 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅肝脏基因表达量的影响第145-148页
    4 讨论第148-152页
        4.1 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅生长性能的影响第148-149页
        4.2 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅屠宰性能的影响第149页
        4.3 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅血清生化指标的影响第149-150页
        4.4 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅养分利用率的影响第150-151页
        4.5 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅绒羽理化性质的影响第151页
        4.6 甜菜碱对高同型半胱氨酸血症仔鹅肝脏基因表达量的影响第151-152页
    本章小结第152-153页
    参考文献第153-156页
第七章 高同型半胱氨酸血症候选基因功能的初步验证第156-166页
    1 前言第156页
    2 材料与方法第156-160页
        2.1 试验方法与动物:第156页
        2.2 试验饲粮第156页
        2.3 检测指标第156-160页
    3 试验结果第160页
        3.1 TUNEL法检测高同型半胱氨酸血症仔鹅心肌细胞凋亡的影响第160页
        3.2 免疫组化法检测高同型半胱氨酸血症仔鹅心肌细胞p53表达第160页
        3.3 WB法检测高同型半胱氨酸血症仔鹅心肌组织Bax和Bcl-2表达第160页
    4 讨论第160-164页
    本章小结第164页
    参考文献第164-166页
全文结论第166-167页
本文创新点第167-168页
致谢第168-169页
攻读博士期间发表论文、出版著作申请专利情况第169-171页

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