| 摘要 | 第3-6页 |
| abstract | 第6-8页 |
| 英文缩略词及英汉对照 | 第9-16页 |
| 第1章 前言 | 第16-24页 |
| 1.1 引言 | 第16页 |
| 1.2 漆酶的来源与生物学功能 | 第16-18页 |
| 1.2.1 细菌漆酶及其生物学功能 | 第17页 |
| 1.2.2 昆虫漆酶及其生物学功能 | 第17页 |
| 1.2.3 植物漆酶及其生物学功能 | 第17页 |
| 1.2.4 真菌漆酶及其生物学功能 | 第17-18页 |
| 1.3 真菌漆酶的酶学性质及结构特征 | 第18-19页 |
| 1.3.1 真菌漆酶的酶学性质 | 第18-19页 |
| 1.3.2 真菌漆酶的结构特征 | 第19页 |
| 1.4 真菌漆酶研究现状 | 第19-21页 |
| 1.5 真菌漆酶研究的发展趋势 | 第21-22页 |
| 1.6 本项目的研究目的与主要内容 | 第22-24页 |
| 第2章 粗毛革孔菌及其诱变株生理生化特性和形态比较 | 第24-44页 |
| 2.1 引言 | 第24-25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-31页 |
| 2.2.1 实验菌株 | 第25页 |
| 2.2.2 培养基 | 第25页 |
| 2.2.3 主要试剂及配制 | 第25-26页 |
| 2.2.4 主要仪器 | 第26页 |
| 2.2.5 实验方法 | 第26-31页 |
| 2.2.5.1 野生株TCK与诱变株T906产漆酶能力分析 | 第26-27页 |
| 2.2.5.2 野生株TCK与诱变株T906形态学观察 | 第27页 |
| 2.2.5.3 野生株TCK与诱变株T906生物量测定 | 第27-29页 |
| 2.2.5.4 粗毛革孔菌野生株TCK与诱变株T906 ITS鉴定 | 第29-31页 |
| 2.3 结果与分析 | 第31-40页 |
| 2.3.1 野生株TCK与诱变株T906产漆酶能力分析 | 第31-32页 |
| 2.3.2 野生株TCK与诱变株T906形态学观察 | 第32-34页 |
| 2.3.2.1 菌落形态观察 | 第32页 |
| 2.3.2.2 菌丝体生物扫描电镜形态比较 | 第32-33页 |
| 2.3.2.3 菌丝体生物透射电镜形态比较 | 第33-34页 |
| 2.3.3 野生株TCK与诱变株T906菌丝体生物量测定 | 第34-38页 |
| 2.3.3.1 TTC-DHA实验反应时间的确定 | 第34-35页 |
| 2.3.3.2 TTC-DHA实验反应温度的确定 | 第35页 |
| 2.3.3.3 TTC-DHA工作曲线绘制 | 第35-36页 |
| 2.3.3.4 菌体湿重与DHA标准曲线绘制 | 第36-37页 |
| 2.3.3.5 野生株TCK及诱变株T906不同生长阶段胞内脱氢酶比活力变化 | 第37-38页 |
| 2.3.4 粗毛革孔菌野生株TCK与诱变株T906 ITS鉴定结果 | 第38-40页 |
| 2.3.4.1 野生株及诱变株ITS的克隆及序列比对 | 第38-39页 |
| 2.3.4.2 野生株及诱变株ITS的系统进化分析 | 第39-40页 |
| 2.4 讨论 | 第40-43页 |
| 2.5 本章小结 | 第43-44页 |
| 第3章 粗毛革孔菌及其诱变株T906转录组学分析 | 第44-65页 |
| 3.1 引言 | 第44-45页 |
| 3.2 材料与方法 | 第45-51页 |
| 3.2.1 供试菌株 | 第45页 |
| 3.2.2 培养基 | 第45页 |
| 3.2.3 主要试剂 | 第45-46页 |
| 3.2.4 主要仪器 | 第46页 |
| 3.2.5 实验方法 | 第46-51页 |
| 3.2.5.1 RNA提取与纯化 | 第46页 |
| 3.2.5.2 Illumina测序 | 第46-47页 |
| 3.2.5.3 数据分析 | 第47-51页 |
| 3.2.5.4 粗毛革孔菌重要代谢通路基因鉴定及简图构建 | 第51页 |
| 3.3 结果与分析 | 第51-63页 |
| 3.3.1 RNA提取及纯化 | 第51-52页 |
| 3.3.2 文库及测序数据质量分析 | 第52-53页 |
| 3.3.3 Contig组装结果 | 第53-54页 |
| 3.3.4 Unigene组装结果 | 第54-56页 |
| 3.3.5 Unigene功能注释 | 第56-58页 |
| 3.3.6 Unigene的GO分类 | 第58-59页 |
| 3.3.7 Unigene的COG聚类 | 第59-60页 |
| 3.3.8 Unigene的代谢通路分析 | 第60-62页 |
| 3.3.9 Unigene的开放读码框分析 | 第62-63页 |
| 3.4 讨论 | 第63-64页 |
| 3.5 本章小结 | 第64-65页 |
| 第4章 粗毛革孔菌及其诱变株差异表达基因分析 | 第65-105页 |
| 4.1 引言 | 第65页 |
| 4.2 材料与方法 | 第65-72页 |
| 4.2.1 数据来源 | 第65-66页 |
| 4.2.2 主要仪器 | 第66页 |
| 4.2.3 实验方法 | 第66-71页 |
| 4.2.3.1 Unigene的表达量注释 | 第66页 |
| 4.2.3.2 差异表达基因的筛选 | 第66-67页 |
| 4.2.3.3 差异表达基因的定量PCR验证 | 第67-70页 |
| 4.2.3.4 差异表达Unigene的GO功能富集分析 | 第70-71页 |
| 4.2.3.5 差异表达Unigene的Pathway功能富集分析 | 第71页 |
| 4.2.4 诱变株与原始菌株重要差异表达基因的筛选与分析 | 第71-72页 |
| 4.3 结果与分析 | 第72-102页 |
| 4.3.1 野生株TCK及诱变株T906差异表达基因分析 | 第72-74页 |
| 4.3.1.1 野生株TCK及诱变株T906差异表达基因分布 | 第72-73页 |
| 4.3.1.2 野生株TCK及诱变株T906差异表达基因分析 | 第73-74页 |
| 4.3.2 转录组测序丰度分析结果的定量RT PCR验证 | 第74-75页 |
| 4.3.3 野生菌株TCK及诱变菌株T906差异表达基因的GO功能分布 | 第75-78页 |
| 4.3.4 野生菌株TCK及诱变菌株T906差异表达基因的GO功能分布 | 第78-80页 |
| 4.3.5 野生株TCK与诱变株T906重要代谢途径基因差异表达分析 | 第80-96页 |
| 4.3.5.1 野生及诱变株重要物质合成的相关基因表达模式分析 | 第80-86页 |
| 4.3.5.2 野生菌株与诱变菌株糖代谢相关通路基因表达模式比较分析 | 第86-90页 |
| 4.3.5.3 野生及诱变株脂肪酸代谢相关通路基因表达模式分析 | 第90-92页 |
| 4.3.5.4 野生及诱变株次生代谢相关通路基因表达模式分析 | 第92-94页 |
| 4.3.5.5 野生及诱变株细胞周期相关通路基因表达模式分析 | 第94-95页 |
| 4.3.5.6 粗毛革孔菌抗氧化胁迫相关酶类的基因表达模式的研究 | 第95-96页 |
| 4.3.6 粗毛革孔菌重要代谢通路基因鉴定及简图构建 | 第96-102页 |
| 4.3.6.1 粗毛革孔菌糖酵解/糖异生代谢通路的构建及参与代谢的酶类 | 第96-98页 |
| 4.3.6.2 粗毛革孔菌其它糖类降解通路及其酶类 | 第98-100页 |
| 4.3.6.3 粗毛革孔菌氨酰tRNA生物合成相关酶类 | 第100-102页 |
| 4.4 讨论 | 第102-104页 |
| 4.5 本章小结 | 第104-105页 |
| 第5章粗毛革孔菌及其诱变株细胞周期、凋亡、自噬及胞内ROS水平的研究 | 第105-121页 |
| 5.1 引言 | 第105-106页 |
| 5.2 材料与方法 | 第106-108页 |
| 5.2.1 实验菌株 | 第106页 |
| 5.2.2 培养基 | 第106页 |
| 5.2.3 荧光染料 | 第106页 |
| 5.2.4 试剂配置 | 第106页 |
| 5.2.5 主要仪器 | 第106-107页 |
| 5.2.6 实验方法 | 第107-108页 |
| 5.2.6.1 菌丝体培养和取样 | 第107页 |
| 5.2.6.2 原生质体游离 | 第107页 |
| 5.2.6.3 原生质体活细胞计数 | 第107-108页 |
| 5.2.6.4 细胞周期分析 | 第108页 |
| 5.2.6.5 细胞凋亡分析 | 第108页 |
| 5.2.6.6 ROS含量检测 | 第108页 |
| 5.2.6.7 细胞自噬水平检测 | 第108页 |
| 5.3 结果与分析 | 第108-116页 |
| 5.3.1 菌丝体的原生质体制备结果 | 第108-109页 |
| 5.3.2 粗毛革孔菌野生株及诱变株期细胞周期分析 | 第109-111页 |
| 5.3.3 粗毛革孔菌野生株及诱变株细胞凋亡分析 | 第111-113页 |
| 5.3.4 粗毛革孔菌野生株及诱变株ROS含量分析 | 第113-115页 |
| 5.3.5 粗毛革孔菌野生株及诱变株细胞自噬水平分析 | 第115-116页 |
| 5.4 讨论 | 第116-119页 |
| 5.5 本章小结 | 第119-121页 |
| 第6章 粗毛革孔菌漆酶同工酶基因克隆及表达分析 | 第121-146页 |
| 6.1 引言 | 第121-122页 |
| 6.2 材料与方法 | 第122-129页 |
| 6.2.1 供试菌株 | 第122页 |
| 6.2.2 宿主菌株和载体质粒 | 第122页 |
| 6.2.3 化学试剂 | 第122-123页 |
| 6.2.4 分生试剂 | 第123页 |
| 6.2.5 主要仪器 | 第123页 |
| 6.2.6 实验方法 | 第123-127页 |
| 6.2.6.1 转录组数据库中漆酶基因的筛选与序列分析 | 第123-124页 |
| 6.2.6.2 漆酶全长基因克隆 | 第124-126页 |
| 6.2.6.3 克隆漆酶基因的生物信息学分析 | 第126-127页 |
| 6.2.7 野生及诱变菌株漆酶基因的表达分析 | 第127-129页 |
| 6.2.7.1 定量PCR引物设计 | 第127页 |
| 6.2.7.2 菌种培养及RNA提取 | 第127-128页 |
| 6.2.7.3 Real time PCR反应 | 第128页 |
| 6.2.7.4 引物扩增质量分析 | 第128页 |
| 6.2.7.5 野生及诱变菌株漆酶基因的表达分析 | 第128-129页 |
| 6.2.7.6 结果计算 | 第129页 |
| 6.3 结果与分析 | 第129-143页 |
| 6.3.1 转录组数据中漆酶基因的筛选 | 第129-130页 |
| 6.3.2 筛选漆酶基因的实验验证及全长序列克隆 | 第130-140页 |
| 6.3.2.1 五种漆酶全长基因的RT PCR扩增 | 第130页 |
| 6.3.2.2 五种漆酶基因的克隆测序 | 第130-131页 |
| 6.3.2.3 五种漆酶基因的序列分析 | 第131-132页 |
| 6.3.2.4 五种漆酶基因的系统进化分析 | 第132-134页 |
| 6.3.2.5 五种漆酶基因编码蛋白序列特征分析 | 第134-137页 |
| 6.3.2.6 野生及诱变菌株主效漆酶基因Lcc1的比对分析 | 第137-140页 |
| 6.3.3 诱变及野生菌株漆酶基因定量分析 | 第140-143页 |
| 6.3.3.1 五种漆酶及内参定量引物溶解曲线分析 | 第140页 |
| 6.3.3.2 五种漆酶及内参引物扩增效率分析结果 | 第140-141页 |
| 6.3.3.3 五种漆酶的表达定量分析 | 第141-142页 |
| 6.3.3.4 主效漆酶Lcc1的表达谱分析 | 第142-143页 |
| 6.4 讨论 | 第143-145页 |
| 6.5 本章小结 | 第145-146页 |
| 全文总结 | 第146-148页 |
| 创新点 | 第146-147页 |
| 下一步工作建议 | 第147-148页 |
| 致谢 | 第148-149页 |
| 参考文献 | 第149-159页 |
| 攻读学位期间发表学位论文 | 第159-160页 |
