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OsRopGEF7在水稻发育中的功能研究

摘要第3-5页
abstract第5-6页
第1章 前言第15-29页
    1.1 水稻根发育的简介第15页
    1.2 水稻根发育的分子调控研究进展第15-20页
        1.2.1 生长素参与调控水稻根的发育过程第16-17页
        1.2.2 细胞分裂素在水稻的根发育过程中也起重要作用第17-20页
    1.3 细胞分裂素调控茎尖分生组织的研究进展第20-23页
        1.3.1 细胞分裂素对茎尖分生组织的调控第20-22页
        1.3.2 细胞分裂素对种子发育的影响第22-23页
    1.4 植物小G蛋白和相关基因的调控网络第23-26页
        1.4.1 植物小G蛋白的种类和生物学功能第23-25页
        1.4.2 RopGEF的结构及生物学功能研究第25-26页
    1.5 本研究的目的和意义第26-27页
    1.6 本研究的技术路线第27-29页
第2章 OsRopGEF7A的时空表达模式分析第29-61页
    2.1 引言第29页
    2.2 材料和方法第29-56页
        2.2.1 水稻材料第29页
        2.2.2 菌株和载体第29-30页
        2.2.3 主要仪器设备第30页
        2.2.4 目的片段的PCR扩增以及与载体的连接第30-35页
            2.2.4.1 水稻总RNA的提取第30-31页
            2.2.4.2 cDNA的反转录合成第31-32页
            2.2.4.3 目的片段的PCR扩增第32-33页
            2.2.4.4 PCR产物的电泳检测第33页
            2.2.4.5 目的PCR片断的回收第33-34页
            2.2.4.6 目的PCR片段与载体的连接第34-35页
        2.2.5 质粒的提取和转化细菌第35-38页
            2.2.5.1 质粒提取所要的主要试剂第35页
            2.2.5.2 大肠杆菌质粒的小量提取第35-36页
            3.2.5.3 大肠杆菌感受态的制备第36-37页
            2.2.5.4 大肠杆菌热击转化质粒第37页
            2.2.5.5 EHA105农杆菌感受态的制备第37-38页
            2.2.5.6 EHA105农杆菌电击转化质粒第38页
        2.2.6 OsRopGEF7APro::GUS融合表达载体和UbiPro::pOX超量表达载体的构建第38-39页
        2.2.7 水稻愈伤的转化以及阳性转基因苗的筛选第39-46页
            2.2.7.1 水稻愈伤转化所要的培养基第39-41页
            2.2.7.2 水稻NB培养基第41-42页
            2.2.7.3 木村B水稻营养液第42页
            2.2.7.4 常用抗生素的配制方法第42-44页
            2.2.7.5 水稻愈伤的诱导和农杆菌的遗传转化第44-46页
            2.2.7.6 水稻转基因苗的鉴定第46页
        2.2.8 水稻苗的培养和qRT-PCR检测基因表达水平第46-48页
            2.2.8.11/2 MS植物培养基第46-47页
            2.2.8.2 水稻种子的消毒和生长第47-48页
            2.2.8.3 qRT-PCR实验第48页
        2.2.9 GUS组织化学染色第48-49页
            2.2.9.1 GUS组织化学染色试剂第48-49页
            2.2.9.2 幼苗透明液(HCG Solution)第49页
            2.2.9.3 水稻材料的GUS组织化学染色第49页
        2.2.10 水稻组织的石蜡切片以及显微镜观察第49-51页
            2.2.10.1 石蜡切片试剂的配制第49-50页
            2.2.10.2 水稻石蜡切片的主要步骤第50-51页
        2.2.11 水稻原位杂交实验第51-55页
            2.2.11.1 原位杂交试剂的配制第51-53页
            2.2.11.2 原位杂交探针的设计第53页
            2.2.11.3 原位杂交探针的转录与纯化第53-54页
            2.2.11.4 原位杂交探针的半定量第54页
            2.2.11.5 水稻组织的原位杂交和显色反应第54-55页
        2.2.12 本章所用的引物第55-56页
    2.3 结果和分析第56-59页
        2.3.1 OsRopGEF7A在水稻不同组织表达的qRT-PCR分析第56-57页
        2.3.2 OsRopGEF7APro::GUS报告基因的表达分析第57-58页
        2.3.3 原位杂交分析OsRopGEF7A在冠根原基和顶端分生组织处表达第58-59页
    2.4 小结第59-61页
第3章 OsRopGEF7A调控水稻冠根的发育第61-88页
    3.1 引言第61页
    3.2 材料和方法第61-71页
        3.2.1 实验材料第61页
        3.2.2 本章的菌株和载体第61-63页
        3.2.3 水稻基因组DNA的提取和T-DNA插入突变体的鉴定第63-65页
            3.2.3.1 CTAB法提取水稻基因组DNA第63页
            3.2.3.2 水稻T-DNA插入突变体的鉴定第63-65页
            3.2.3.3 Osropgef7-1 的表达水平分析第65页
        3.2.4 构建载体和转化愈伤第65-66页
            3.2.4.1 UbiPro::OsRopGEF7A过量表达载体的构建和转化水稻愈伤第65页
            3.2.4.2 功能互补实验第65-66页
        3.2.5 OsRopGEF7A打靶点的设计和PCR扩增sgRNA表达盒第66-69页
            3.2.5.1 靶点的设计和接头制备第66页
            3.2.5.2 PCR扩增sgRNA-OsU3和sgRNA-OsU6a表达盒第66-68页
            3.2.5.3 sgRNA-U3/U6表达盒和pYLCRISPR/Cas9Pubi-H的连接第68页
            3.2.5.4 酶切连接产物的转化和PCR检测第68-69页
            3.2.5.5 获得阳性克隆农杆菌以及水稻愈伤的转化第69页
            3.2.5.6 检测转基因植株的打靶效果第69页
        3.2.6 OsRopGEF7A的激素敏感性实验第69-70页
            3.2.6.1 水稻种子的萌发和激素处理第69-70页
            3.2.6.2 幼苗冠根数目的统计分析第70页
        3.2.7 本章所用的引物第70-71页
    3.3 结果和分析第71-86页
        3.3.1 水稻T-DNA插入突变体的鉴定第71-73页
        3.3.2 OsRopGEF7A突变影响冠根的正常发育第73-74页
        3.3.3 ActinPro::OsRopGEF7A功能互补分析第74-75页
        3.3.4 OsRopGEF7A突变体的获得和打靶效果分析第75-79页
        3.3.5 OsRopGEF7A-Cas9后代的表型分析第79-81页
        3.3.6 Osropgef7-1 和UbiPro::OsRopGEF7A过表达植株激素敏感性实验第81-86页
            3.3.6.1 OsRopGEF7A表达下调与上调对细胞分裂素的响应第81-84页
            3.3.6.2 OsRopGEF7A表达下调与上调不影响冠根对NAA的敏感性第84-86页
    3.4 小结第86-88页
第4章 OsRopGEF7A调控细胞分裂素信号途径基因的表达第88-96页
    4.1 引言第88页
    4.2 材料和方法第88-91页
        4.2.1 实验材料第88页
        4.2.2 实验所用的菌株和载体第88-89页
        4.2.3 激素处理和基因表达水平的检测第89页
            4.2.3.1 NAA和 6-BA诱导OsRopGEF7A的表达第89页
            4.2.3.2 qRT-PCR检测OsRopGEF7A表达水平的变化第89页
            4.2.3.3 OSIAA和OSRR基因的qRT-PCR分析第89页
        4.2.4 水稻幼苗的石蜡切片和OsRR6的原位杂交第89-90页
            4.2.4.1 水稻幼苗顶端分生组织和冠根的石蜡切片第89-90页
            4.2.4.2 OsRR6的原位杂交第90页
        4.2.5 本章所用的引物第90-91页
    4.3 结果和分析第91-95页
        4.3.1 生长素与细胞分裂素诱导OsRopGEF7A的表达第91-92页
        4.3.2 OsRopGEF7A突变体与过表达植株中OSIAA和OSRR基因表达的变化第92-93页
        4.3.3 原位杂交分析显示OsRopGEF7A与OsRR6在茎尖与根表达模型相似,并且OsRopGEF7A影响OsRR6的表达第93-95页
    4.4 小结第95-96页
第5章 OsRopGEF7A调控茎尖分生组织和种子的发育第96-103页
    5.1 引言第96页
    5.2 材料和方法第96-97页
        5.2.1 实验材料第96页
        5.2.2 水稻幼苗的表型观察和农艺性状的统计分析第96页
        5.2.3 幼苗顶端分生组织和胚胎的石醋切片以及表型分析第96-97页
    5.3 结果和分析第97-101页
        5.3.1 过表达OsRopGEF7A影响茎端分生组织的正常发育第97-99页
        5.3.2 OsRopGEF7A调控籽粒的大小第99-101页
    5.4 小结第101-103页
第6章 OsRopGEF7B调控水稻花的发育第103-113页
    6.1 引言第103页
    6.2 材料和方法第103-105页
        6.2.1 水稻材料第103页
        6.2.2 菌株和载体第103页
        6.2.3 qRT-PCR实验第103页
        6.2.4 Os Rop GEF7BPro::GUS 融合表达载体的构建第103-104页
        6.2.5 GUS组织化学染色检测第104页
        6.2.6 T-DNA插入突变体的鉴定第104页
        6.2.7 Osropgef7b-1 花粉粒的KI/I2染色第104页
        6.2.8 Osropgef7b-1 花的石蜡切片和甲苯胺蓝染色第104页
        6.2.9 Osropgef7b-1 花的统计分析第104-105页
        6.2.10 本章所用的引物第105页
    6.3 结果和分析第105-112页
        6.3.1 OsRopGEF7B的q RT-PCR分析第105-106页
        6.3.2 OsRopGEF7B的时空表达模式第106-108页
        6.3.3 T-DNA插入突变体的鉴定第108-109页
        6.3.4 OsRopGEF7B突变影响水稻苗的正常发育第109-110页
        6.3.5 OsRopGEF7B突变影响水稻花的发育第110-112页
        6.3.6 Osropgef7b-1 花表型的统计分析第112页
    6.4 小结第112-113页
第7章 总讨论和结论第113-117页
    7.1 全文的讨论第113-115页
        7.1.1 OsRopGEF7A通过细胞分裂素信号途径调控水稻冠根的发育第113-114页
        7.1.2 OsRopGEF7A通过细胞分裂素信号途径调控水稻地上部分的发育第114-115页
    7.2 全文的结论第115-116页
    7.3 进一步研究设想第116页
    7.4 本研究的创新之处第116-117页
致谢第117-118页
参考文献第118-133页

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