中文摘要 | 第3-6页 |
英文摘要 | 第6-9页 |
缩略词 | 第13-15页 |
1 绪论 | 第15-33页 |
1.1 引言 | 第15-16页 |
1.2 国内外研究现状 | 第16-30页 |
1.2.1 葱蝇生物学特性 | 第16页 |
1.2.2 夏滞育及其相关研究 | 第16-17页 |
1.2.3 滞育的生理阶段 | 第17-21页 |
1.2.4 滞育调控机理研究 | 第21-28页 |
1.2.5 蛹滞育昆虫滞育诱导的敏感期 | 第28-29页 |
1.2.6 昆虫滞育相关转录组研究 | 第29-30页 |
1.3 本研究的目的、意义及主要研究内容 | 第30-33页 |
1.3.1 研究的目的、意义 | 第30页 |
1.3.2 主要研究内容 | 第30-31页 |
1.3.3 本研究技术路线图 | 第31页 |
1.3.4 论文创新性 | 第31-33页 |
2 光周期和温度对葱蝇滞育诱导效应研究 | 第33-41页 |
2.1 引言 | 第33页 |
2.2 材料与方法 | 第33-35页 |
2.2.1 葱蝇的人工饲养(图2.1) | 第33-34页 |
2.2.2 葱蝇的光周期反应 | 第34页 |
2.2.3 葱蝇的龄期确定 | 第34-35页 |
2.2.4 滞育与非滞育蛹判断标准 | 第35页 |
2.3 结果与分析 | 第35-39页 |
2.3.1 葱蝇的光周期反应 | 第35-36页 |
2.3.2 葱蝇的非滞育、冬滞育和夏滞育诱导 | 第36页 |
2.3.3 葱蝇的龄期 | 第36-39页 |
2.4 本章小结 | 第39-41页 |
3 葱蝇夏滞育诱导敏感期的研究 | 第41-45页 |
3.1 引言 | 第41页 |
3.2 材料与方法 | 第41-42页 |
3.2.1 实验材料 | 第41页 |
3.2.2 转移实验 | 第41-42页 |
3.2.3 数据统计方法 | 第42页 |
3.3 结果与分析 | 第42-43页 |
3.3.1 夏滞育诱导的敏感期 | 第42-43页 |
3.3.2 夏滞育诱导敏感期的形态及行为特征 | 第43页 |
3.4 本章小结 | 第43-45页 |
4 葱蝇转录组DENOVO测序及数字基因表达谱分析 | 第45-69页 |
4.1 引言 | 第45页 |
4.2 材料与方法 | 第45-48页 |
4.2.1 昆虫饲养、滞育诱导和取样 | 第45-46页 |
4.2.2 RNA分离、文库构建和Illumina测序 | 第46-47页 |
4.2.3 原始数据收集,组装和注释 | 第47页 |
4.2.4 差异表达基因(DEG)分析 | 第47页 |
4.2.5 功能和通路富集分析 | 第47页 |
4.2.6 RNAseq结果验证 | 第47页 |
4.2.7 数据提交 | 第47-48页 |
4.3 结果与分析 | 第48-66页 |
4.3.1 组装的转录本的特征、功能注释和分类 | 第48-50页 |
4.3.2 差异表达基因DEG的查找和GO功能分类 | 第50-51页 |
4.3.3 UnigeneCOG和KEGGpathway分布 | 第51-54页 |
4.3.4 与夏滞育诱导相关的差异表达的转录本 | 第54页 |
4.3.5 重要的信号通路 | 第54-58页 |
4.3.6 滞育诱导敏感期重要的代谢通路 | 第58页 |
4.3.7 脂肪代谢 | 第58-64页 |
4.3.8 三羧酸循环、氨基糖和核苷酸糖代谢 | 第64页 |
4.3.9 热激蛋白(HSPs) | 第64页 |
4.3.10 生物钟基因 | 第64-66页 |
4.3.11 压力反应 | 第66页 |
4.4 本章小结 | 第66-69页 |
5 葱蝇夏滞育诱导相关基因表达模式分析 | 第69-73页 |
5.1 引言 | 第69页 |
5.2 材料与方法 | 第69-70页 |
5.2.1 蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络构建 | 第69页 |
5.2.2 基因序列 | 第69页 |
5.2.3 基因表达模式分析 | 第69-70页 |
5.3 结果与分析 | 第70-72页 |
5.3.1 PPI网络重要基因的鉴定 | 第70-71页 |
5.3.2 钟基因昼夜及夏滞育诱导相关表达模式 | 第71页 |
5.3.3 hsp23昼夜及夏滞育诱导相关表达模式 | 第71-72页 |
5.4 本章小结 | 第72-73页 |
6 全文讨论 | 第73-75页 |
7 结论与展望 | 第75-77页 |
7.1 主要结论 | 第75页 |
7.2 未来的研究方向 | 第75-77页 |
致谢 | 第77-79页 |
参考文献 | 第79-105页 |
附录 | 第105-129页 |
A.作者在攻读博士学位期间主持或参加科研项目(课题) | 第105页 |
B.作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第105-107页 |
C.附表 | 第107-127页 |
D.附图 | 第127-129页 |