| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 主要缩略词表 | 第15-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-37页 |
| 1.1 研究目的及意义 | 第17-18页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第18-35页 |
| 1.2.1 空肠弯曲菌概述 | 第18-22页 |
| 1.2.2 空肠弯曲菌耐药现状 | 第22页 |
| 1.2.3 空肠弯曲菌耐药机制 | 第22-28页 |
| 1.2.4 转录组学概述 | 第28-31页 |
| 1.2.5 蛋白质组学概述 | 第31-33页 |
| 1.2.6 代谢组学概述 | 第33-34页 |
| 1.2.7 多组学联合运用 | 第34-35页 |
| 1.3 研究内容与方法 | 第35-37页 |
| 第二章 携带ermB基因空肠弯曲菌的转录组学研究 | 第37-77页 |
| 2.1 前言 | 第37页 |
| 2.2 材料与方法 | 第37-48页 |
| 2.2.1 材料 | 第37-40页 |
| 2.2.2 方法 | 第40-46页 |
| 2.2.3 qRT PCR验证 | 第46-48页 |
| 2.3 结果与分析 | 第48-69页 |
| 2.3.1 CJ-ermB中ermB基因的确证 | 第48-49页 |
| 2.3.2 MIC测定 | 第49-50页 |
| 2.3.3 RNA样本定量及质量检测 | 第50-53页 |
| 2.3.4 文库质检 | 第53-54页 |
| 2.3.5 测序结果质控情况 | 第54-55页 |
| 2.3.6 数据分析结果 | 第55-66页 |
| 2.3.7 qRT-PCR的结果 | 第66-69页 |
| 2.4 讨论 | 第69-76页 |
| 2.4.1 RNA-Seq筛选差异转录本 | 第69-71页 |
| 2.4.2 差异转录本的功能分析 | 第71-76页 |
| 2.5 小结 | 第76-77页 |
| 第三章 携带ermB基因空肠弯曲菌的蛋白组学研究 | 第77-141页 |
| 3.1 前言 | 第77页 |
| 3.2 材料与方法 | 第77-117页 |
| 3.2.1 材料 | 第77-80页 |
| 3.2.2 方法 | 第80-117页 |
| 3.3 结果与分析 | 第117-133页 |
| 3.3.1 蛋白定量结果 | 第117页 |
| 3.3.2 SDS-PAGE蛋白样品质量判断 | 第117-118页 |
| 3.3.3 质量控制 | 第118-119页 |
| 3.3.4 MRM定量 | 第119页 |
| 3.3.5 差异蛋白 | 第119-123页 |
| 3.3.6 GO及KEGG分析 | 第123-124页 |
| 3.3.7 蛋白相互作用分析 | 第124-125页 |
| 3.3.8 细菌运动能力检测 | 第125-126页 |
| 3.3.9 细菌自身凝集能力检测 | 第126页 |
| 3.3.10 透射电镜观察细菌鞭毛 | 第126-128页 |
| 3.3.11 细菌对细胞粘附力及侵袭力检测 | 第128页 |
| 3.3.12 细菌葡萄糖含量的检测 | 第128-129页 |
| 3.3.13 细菌ATP含量的检测 | 第129-130页 |
| 3.3.14 细菌精氨酸含量的检测 | 第130页 |
| 3.3.15 细菌组氨酸含量的检测 | 第130-131页 |
| 3.3.16 细菌组肌苷酸含量的检测 | 第131-132页 |
| 3.3.17 细菌组肌苷含量的检测 | 第132页 |
| 3.3.18 细菌次黄嘌呤含量的检测 | 第132-133页 |
| 3.4 讨论 | 第133-140页 |
| 3.4.1 蛋白前处理方法的选择 | 第133页 |
| 3.4.2 蛋白定量方法的选择 | 第133-134页 |
| 3.4.3 差异蛋白质与差异转录本关联分析 | 第134页 |
| 3.4.4 差异蛋白质的功能分析 | 第134-140页 |
| 3.5 小结 | 第140-141页 |
| 第四章 携带ermB基因空肠弯曲菌的代谢组学研究 | 第141-164页 |
| 4.1 前言 | 第141页 |
| 4.2 材料与方法 | 第141-147页 |
| 4.2.1 材料 | 第141-143页 |
| 4.2.2 方法 | 第143-147页 |
| 4.3 结果与分析 | 第147-158页 |
| 4.3.1 样品提取方法的优化 | 第147-148页 |
| 4.3.2 差异代谢物筛选和定量 | 第148-155页 |
| 4.3.3 差异代谢物确证 | 第155-156页 |
| 4.3.4 差异代谢物生物功能及通路分析 | 第156-157页 |
| 4.3.5 细菌生物膜形成能力检测 | 第157-158页 |
| 4.4 讨论 | 第158-163页 |
| 4.4.1 样本前处理方法的优化 | 第158-159页 |
| 4.4.2 差异代谢物与差异蛋白质关联分析 | 第159-160页 |
| 4.4.3 生物功能分析 | 第160-163页 |
| 4.5 小结 | 第163-164页 |
| 第五章 结论 | 第164-165页 |
| 5.1 转录组学分析揭示了ermB基因引起空肠弯曲菌中与鞭毛组装、组氨酸代谢、氨基糖和核苷糖代谢、乙醛酸盐和二元羧酸盐代谢相关的基因表达发生变化 | 第164页 |
| 5.2 蛋白组学分析表明ermB基因表达使空肠弯曲菌鞭毛丝缺失,运动性、自身凝集性、粘附力和侵袭力减弱,能量需求升高 | 第164页 |
| 5.3 非靶向代谢组学方法揭示ermB基因导致空肠弯曲菌生物膜形成能力减弱 | 第164-165页 |
| 创新点 | 第165-166页 |
| 参考文献 | 第166-182页 |
| 致谢 | 第182-183页 |
| 个人简介 | 第183-184页 |
