| 摘要 | 第5-6页 |
| 英文摘要 | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 DNA 数据压缩研究背景及意义 | 第10-11页 |
| 1.2 DNA 及压缩相关研究现状 | 第11-16页 |
| 1.2.1 DNA 分子的结构 | 第11页 |
| 1.2.2 DNA 序列中的 k-mer 研究及应用现状 | 第11-12页 |
| 1.2.3 DNA 数据压缩常用基准测试序列 | 第12-13页 |
| 1.2.4 DNA 数据压缩性能评价标准 | 第13-14页 |
| 1.2.5 国内外经典 DNA 数据压缩算法 | 第14-16页 |
| 1.3 论文的主要工作和章节安排 | 第16-18页 |
| 1.3.1 主要工作 | 第16-17页 |
| 1.3.2 章节安排 | 第17-18页 |
| 第二章 DNA序列数据的重复性及k-mer分布统计分析 | 第18-29页 |
| 2.1 DNA 序列数据的特征 | 第18-19页 |
| 2.2 DNA 序列中的 k - me r | 第19-20页 |
| 2.3 k-mer 频数分布分析 | 第20-27页 |
| 2.3.1 KL 散度法 | 第20页 |
| 2.3.2 Hao 方法分形图像表示 | 第20-23页 |
| 2.3.3 k-mer 分布的对数频谱图 | 第23-27页 |
| 2.4 DNA 序列中的 k-mer 分布特点 | 第27-28页 |
| 2.5 本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 基于分段编码的DNA数据压缩算法 | 第29-40页 |
| 3.1 k-mer 最高频数统计及区域分布特点分析 | 第29-31页 |
| 3.2 分段长度及 k-mer 长度确定 | 第31-32页 |
| 3.3 算法实现 | 第32-38页 |
| 3.3.1 分段编码规则 | 第32-36页 |
| 3.3.2 DNA 序列编码 | 第36-37页 |
| 3.3.3 完整算法流程 | 第37-38页 |
| 3.4 实验结果 | 第38-39页 |
| 3.5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 基于GA-PSO 混合优化的DNA数据压缩算法 | 第40-59页 |
| 4.1 k-mer 长度确定及编码规则 | 第40-42页 |
| 4.2 GA 算法和 PSO 算法 | 第42-46页 |
| 4.2.1 GA 算法 | 第43-44页 |
| 4.2.2 PSO 算法 | 第44-46页 |
| 4.3 基于 SVM 分组 GA-PSO 混合优化的 DNA 数据压缩算法 | 第46-53页 |
| 4.3.1 SVM 算法 | 第46-51页 |
| 4.3.2 基于 SBGSO 优化的 DNA 数据压缩算法实现 | 第51-53页 |
| 4.4 实验结果及分析 | 第53-58页 |
| 4.4.1 实验参数设置 | 第53-54页 |
| 4.4.2 SBGSO 算法在标准测试函数上的实验结果 | 第54-57页 |
| 4.4.3 基于 SBGSO 优化的基准 DNA 数据压缩实验结果 | 第57-58页 |
| 4.5 本章小结 | 第58-59页 |
| 总结与展望 | 第59-61页 |
| 内容总结 | 第59页 |
| 主要贡献及创新点 | 第59-60页 |
| 后续工作与展望 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 附件 | 第67页 |
