| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 符号说明 | 第9-12页 |
| 1 前言 | 第12-15页 |
| 1.1 抗生素种类 | 第12-13页 |
| 1.2 饲用抗生素 | 第13-14页 |
| 1.2.1 饲用抗生素概述 | 第13页 |
| 1.2.2 饲用抗生素在畜牧生产中的应用 | 第13-14页 |
| 1.3 饲用抗生素对肠道菌群的影响 | 第14-15页 |
| 2 目的和意义 | 第15-16页 |
| 3 材料与方法 | 第16-28页 |
| 3.1 试验材料 | 第16-18页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第16-17页 |
| 3.1.2 饲用抗生素 | 第17页 |
| 3.1.3 主要试剂和药物 | 第17-18页 |
| 3.1.4 试验菌株 | 第18页 |
| 3.1.5 主要培养基 | 第18页 |
| 3.1.6 主要仪器 | 第18页 |
| 3.2 试验方法 | 第18-27页 |
| 3.2.1 样品收集 | 第18-19页 |
| 3.2.2 耐药性大肠杆菌的分离鉴定 | 第19-20页 |
| 3.2.3 药物敏感性测定 | 第20页 |
| 3.2.4 最低抑菌浓度(MIC值)测定 | 第20页 |
| 3.2.5 大肠杆菌耐药基因检测 | 第20-21页 |
| 3.2.6 接合试验 | 第21-22页 |
| 3.2.7 接合子耐药基因检测 | 第22页 |
| 3.2.8 盲肠内容物细菌总DNA的提取 | 第22页 |
| 3.2.9 PCR-DGGE分析盲肠菌群结构 | 第22-23页 |
| 3.2.10 Illumina MiSeq技术平台分析盲肠微生物结构 | 第23-24页 |
| 3.2.11 Q-PCR检测盲肠主要菌群 | 第24-26页 |
| 3.2.12 脏器指数和血清中细胞因子的测定 | 第26页 |
| 3.2.13 Q-PCR分析肠段及脏器组织TLR2/4 mRNA相对表达量 | 第26-27页 |
| 3.3 数据分析 | 第27-28页 |
| 4 结果与分析 | 第28-47页 |
| 4.1 抗生素对獭兔日增重的影响 | 第28页 |
| 4.2 大肠杆菌耐药特点及耐药基因水平传播结果分析 | 第28-34页 |
| 4.2.1 耐药性大肠杆菌的分离鉴定 | 第28-30页 |
| 4.2.2 大肠杆菌耐药表型测试结果 | 第30-32页 |
| 4.2.3 大肠杆菌耐药基因检测结果 | 第32-33页 |
| 4.2.4 接合子耐药表型和耐药基因检测结果 | 第33-34页 |
| 4.3 獭兔盲肠内容物PCR-DGGE指纹图谱分析结果 | 第34-36页 |
| 4.4 獭兔盲肠样品菌群结构Illumina MiSeq测序结果 | 第36-44页 |
| 4.4.1 测序OTUs数据 | 第36页 |
| 4.4.2 獭兔盲肠微生物多样性分析 | 第36-39页 |
| 4.4.3 獭兔盲肠微生物组成差异分析 | 第39-44页 |
| 4.5 獭兔盲肠样品主要菌群Q-PCR分析结果 | 第44页 |
| 4.6 獭兔脏器指数和血清细胞因子表达水平变化 | 第44-46页 |
| 4.7 獭兔TLR2和TLR4 mRNA表达水平变化 | 第46-47页 |
| 5 讨论 | 第47-55页 |
| 5.1 大肠杆菌耐药特点及耐药基因水平传播分析 | 第47-49页 |
| 5.2 獭兔盲肠内容物PCR-DGGE指纹图谱分析 | 第49-50页 |
| 5.3 獭兔盲肠样品菌群结构Illumina MiSeq结果分析 | 第50-52页 |
| 5.4 獭兔盲肠样品主要菌群Q-PCR分析 | 第52-53页 |
| 5.5 獭兔脏器指数、细胞因子和Toll样受体表达水平变化分析 | 第53-55页 |
| 6 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第69页 |
