| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩略词 | 第12-13页 |
| 第一章 捕食性细菌研究进展及论文立题依据 | 第13-36页 |
| 1.1 捕食性细菌 | 第13页 |
| 1.2 捕食性细菌的系统发育分类 | 第13-31页 |
| 1.2.1 变形菌门 | 第13-22页 |
| 1.2.2 拟杆菌门 | 第22-26页 |
| 1.2.3 放线菌门 | 第26-28页 |
| 1.2.4 厚壁菌门 | 第28-29页 |
| 1.2.5 绿弯菌门 | 第29-30页 |
| 1.2.6 蓝藻门 | 第30-31页 |
| 1.3 捕食性细菌的比较基因组学分析 | 第31-33页 |
| 1.3.1 捕食性与非捕食性细菌的捕食蛋白组研究 | 第31-32页 |
| 1.3.2 附生型与寄生型蛭弧菌类群的比较基因组分析 | 第32页 |
| 1.3.3 海洋生境与陆地生境蛭弧菌类群的比较基因组分析 | 第32-33页 |
| 1.4 捕食性细菌的潜在应用 | 第33-34页 |
| 1.5 本论文的立题依据及研究内容 | 第34-36页 |
| 第二章 捕食性细菌的比较基因组分析 | 第36-49页 |
| 2.1 材料与方法 | 第36-40页 |
| 2.1.1 捕食性细菌基因组信息 | 第36-39页 |
| 2.1.2 基因组分析 | 第39-40页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第40-48页 |
| 2.3 本章小结 | 第48-49页 |
| 第三章 慢生单胞菌类群的猎物谱研究 | 第49-68页 |
| 3.1 材料与方法 | 第49-52页 |
| 3.1.1 猎物谱分析 | 第49-51页 |
| 3.1.2 比较基因组学分析 | 第51-52页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第52-66页 |
| 3.2.1 猎物谱实验 | 第52-59页 |
| 3.2.2 比较基因组分析 | 第59-66页 |
| 3.3 本章小结 | 第66-68页 |
| 第四章 慢生单胞菌类群的生物地理学分析 | 第68-82页 |
| 4.1 材料与方法 | 第68-70页 |
| 4.1.1 构建MetaTaxDB | 第68-69页 |
| 4.1.2 系统发育分析 | 第69-70页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第70-81页 |
| 4.3 本章小结 | 第81-82页 |
| 第五章 总结与展望 | 第82-85页 |
| 5.1 总结 | 第82-83页 |
| 5.2 展望 | 第83-85页 |
| 附表 | 第85-129页 |
| 附表一 三株兼性捕食性细菌的候选猎物菌株信息(放线菌门) | 第85-87页 |
| 附表二 三株兼性捕食性细菌的候选猎物菌株信息(拟杆菌门) | 第87-88页 |
| 附表三 三株兼性捕食性细菌的候选猎物菌株信息(厚壁菌门) | 第88-90页 |
| 附表四 三株兼性捕食性细菌的候选猎物菌株信息(变形菌门) | 第90-94页 |
| 附表五 兼性捕食性慢生单胞菌的猎物基因组信息 | 第94-101页 |
| 附表六 兼性捕食性慢生单胞菌的候选猎物型弧菌基因组信息 | 第101-106页 |
| 附表七 三株兼性捕食性细菌的猎物谱 | 第106-121页 |
| 附表八 兼性捕食性慢生单胞菌的猎物与非猎物直系同源蛋白组 | 第121-124页 |
| 附表九 慢生单胞菌类群的序列来源 | 第124-126页 |
| 附表十 慢生单胞菌类群GeneBank编号 | 第126-129页 |
| 附图 | 第129-159页 |
| 附图一 三株兼性捕食性细菌的猎物谱 | 第129-159页 |
| 放线菌门 | 第129-135页 |
| 拟杆菌门 | 第135-139页 |
| 厚壁菌门 | 第139-144页 |
| 变形菌门 | 第144-159页 |
| 参考文献 | 第159-164页 |
| 致谢 | 第164-165页 |
| 资助情况 | 第165-166页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第166-167页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第167页 |
