| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 综述 | 第11-22页 |
| 1.1 珊瑚礁的概况及面临的问题 | 第11-13页 |
| 1.1.1 造礁石珊瑚 | 第11页 |
| 1.1.2 海南省造礁石珊瑚的资源分布 | 第11-12页 |
| 1.1.3 珊瑚礁的生态意义 | 第12页 |
| 1.1.4 珊瑚礁的退化 | 第12-13页 |
| 1.2 珊瑚礁的保护修复策略 | 第13-14页 |
| 1.2.1 人工移栽 | 第13-14页 |
| 1.2.2 珊瑚幼虫的补充及供应 | 第14页 |
| 1.3 微卫星标记的开发 | 第14-16页 |
| 1.3.1 微卫星标记的概述 | 第14-15页 |
| 1.3.2 微卫星标记的特点 | 第15页 |
| 1.3.3 微卫星的获得途径 | 第15-16页 |
| 1.4 纯化宿主珊瑚DNA遇到的难题 | 第16-19页 |
| 1.4.1 虫黄藻与珊瑚的共生 | 第17页 |
| 1.4.2 不同繁殖模式的珊瑚,宿主珊瑚与虫黄藻分离的方法 | 第17-19页 |
| 1.5 人工白化 | 第19页 |
| 1.6 造礁石珊瑚遗传结构及群体连通性的国内外研究现状 | 第19-20页 |
| 1.7 丛生盔形珊瑚概况 | 第20-22页 |
| 丛生盔形珊瑚微卫星标记的开发 | 第22-33页 |
| 2.1 实验的主要器材 | 第22-23页 |
| 2.2 实验试剂 | 第23-24页 |
| 2.3 人工白化 | 第24页 |
| 2.3.1 升温白化 | 第24页 |
| 2.3.2 纯虫黄藻DNA和对照与白化珊瑚的共生体DNA的获取 | 第24页 |
| 2.3.3 纯虫黄藻DNA的鉴定 | 第24页 |
| 2.4 微卫星富集文库 | 第24-27页 |
| 2.4.1 基因组DNA酶切 | 第24页 |
| 2.4.2 接头的制备 | 第24-25页 |
| 2.4.3 片段与切头的连接 | 第25页 |
| 2.4.4 构建部分基因组文库 | 第25页 |
| 2.4.5 杂交 | 第25页 |
| 2.4.6 磁珠富集 | 第25-26页 |
| 2.4.7 PCR扩增含有微卫星序列的DNA片段 | 第26页 |
| 2.4.8 连接载体 | 第26页 |
| 2.4.9 克隆和转化 | 第26-27页 |
| 2.4.10 菌落PCR检测与测序 | 第27页 |
| 2.4.11 序列分析与引物设计 | 第27页 |
| 2.5 珊瑚微卫星引物的筛选 | 第27-29页 |
| 2.5.1 引物的处理 | 第27-28页 |
| 2.5.2 引物的初筛与鉴别 | 第28页 |
| 2.5.3 引物的群体扩增与检测 | 第28-29页 |
| 2.6 数据分析方法 | 第29页 |
| 2.6.1 种群克隆结构分析 | 第29页 |
| 2.6.2 遗传参数分析 | 第29页 |
| 2.7 实验结果 | 第29-32页 |
| 2.7.1 基因组微卫星标记 | 第29页 |
| 2.7.2 稳定的扩增标记 | 第29-30页 |
| 2.7.3 微卫星标记的鉴定 | 第30-31页 |
| 2.7.4 微卫星位点的评价 | 第31-32页 |
| 2.8 讨论 | 第32-33页 |
| 2.8.1 宿主珊瑚和虫黄藻微卫星标记的鉴定 | 第32页 |
| 2.8.2 微卫星位点的多态性 | 第32-33页 |
| 群体的遗传结构和遗传连通性分析 | 第33-44页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第33-36页 |
| 3.1.1 引物 | 第33页 |
| 3.1.2 样品的信息采集介绍 | 第33-34页 |
| 3.1.3 引物的群体扩增与检测 | 第34-35页 |
| 3.1.4 数据分析方法 | 第35-36页 |
| 3.2 结果 | 第36-40页 |
| 3.2.1 哈迪温伯格平衡 | 第37页 |
| 3.2.2 近交系数 | 第37页 |
| 3.2.3 遗传多样性分析 | 第37页 |
| 3.2.4 瓶颈效应分析 | 第37-38页 |
| 3.2.5 聚类分析 | 第38-39页 |
| 3.2.6 遗传分化和基因流 | 第39-40页 |
| 3.3 讨论 | 第40-44页 |
| 3.3.1 珊瑚的克隆 | 第40页 |
| 3.3.2 哈迪温伯格平衡 | 第40-41页 |
| 3.3.3 近交系数 | 第41页 |
| 3.3.4 遗传多样性分析 | 第41页 |
| 3.3.5 海流影响了海洋生物群体的分化 | 第41-42页 |
| 3.3.6 群体的遗传分化与连通性分析 | 第42-44页 |
| 结论 | 第44-46页 |
| 附录 | 第46-50页 |
| 参考文献 | 第50-61页 |
| 作者攻读学位期间论文发表情况 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
