摘要 | 第7-9页 |
Abstract | 第9-10页 |
第一章 研究背景 | 第11-19页 |
1.1 嗜酸硫杆菌属简介 | 第11-12页 |
1.1.1 嗜酸硫杆菌属及其分类 | 第11页 |
1.1.2 嗜酸硫杆菌属在生物冶金中的作用 | 第11-12页 |
1.2 嗜酸性喜温硫杆菌的简介 | 第12-13页 |
1.3 渗透压调节子ompR的研究进展 | 第13-15页 |
1.4 本论文的研究目的、内容及意义 | 第15-19页 |
1.4.1 本论文的研究目的 | 第15-16页 |
1.4.2 本论文的研究内容 | 第16页 |
1.4.3 本论文的科学意义 | 第16-19页 |
第二章 渗透压调节子ompR基因的无痕敲除 | 第19-43页 |
2.1 引言 | 第19-22页 |
2.2 材料与方法 | 第22-31页 |
2.2.1 菌株与质粒 | 第22页 |
2.2.2 培养基和培养条件 | 第22-23页 |
2.2.3 菌株培养条件 | 第23-24页 |
2.2.4 试剂和仪器 | 第24页 |
2.2.5 分子生物学相关操作技术 | 第24-31页 |
2.3 结果与讨论 | 第31-42页 |
2.3.1 orf1207的无痕敲除 | 第31-36页 |
2.3.2 orf2590的无痕敲除 | 第36-40页 |
2.3.3 在A.caldus(△orf2590)基础上对orfl207进行无痕敲除 | 第40-42页 |
2.4 小结 | 第42-43页 |
第三章 野生菌株与ompR突变体的表型分析 | 第43-51页 |
3.1 引言 | 第43页 |
3.2 材料与方法 | 第43-45页 |
3.2.1 菌株 | 第43页 |
3.2.2 培养基和培养条件 | 第43-44页 |
3.2.3 试剂和仪器 | 第44页 |
3.2.4 A.caldus生长曲线的测定 | 第44页 |
3.2.5 细胞膜通透性的检测 | 第44-45页 |
3.3 结果与讨论 | 第45-49页 |
3.3.1 野生型菌株与突变型菌株在高渗透压条件下以S~0为硫能源培养时的生长曲线 | 第45-46页 |
3.3.2 细胞膜通透性的检测 | 第46-49页 |
3.4 小结 | 第49-51页 |
第四章 突变株与野生株的转录组测序分析 | 第51-69页 |
4.1 引言 | 第51页 |
4.2 材料与方法 | 第51-57页 |
4.2.1 菌株 | 第51页 |
4.2.2 培养基和培养条件 | 第51-52页 |
4.2.3 试剂和仪器 | 第52页 |
4.2.4 分子生物学相关操作技术 | 第52-55页 |
4.2.5 转录组测序建库测序流程 | 第55-56页 |
4.2.6 信息分析流程 | 第56-57页 |
4.2.7 差异比较方案设计 | 第57页 |
4.3 结果与讨论 | 第57-68页 |
4.3.1 RNA样品的检测结果 | 第57-58页 |
4.3.2 参考序列比对分析 | 第58-59页 |
4.3.3 显著差异表达基因筛选 | 第59-60页 |
4.3.4 显著差异表达基因Pathway富集及分析 | 第60-67页 |
4.3.5 测序结果的验证 | 第67-68页 |
4.4 小结 | 第68-69页 |
第五章 受渗透压调节子OmpR直接调控的靶基因探究 | 第69-87页 |
5.1 引言 | 第69页 |
5.2 材料与方法 | 第69-74页 |
5.2.1 菌株与质粒 | 第69页 |
5.2.2 培养基和培养条件 | 第69-70页 |
5.2.3 试剂和仪器 | 第70-71页 |
5.2.4 生物信息学和分子生物学相关操作技术 | 第71-74页 |
5.3 结果与讨论 | 第74-85页 |
5.3.1 可能受OmpR直接调控的靶基因的筛选 | 第74-75页 |
5.3.2 OmpR(orf1207)的表达纯化及与靶基因相互作用探究 | 第75-81页 |
5.3.3 OmpR(orf2590)的表达纯化及与靶基因相互作用探究 | 第81-85页 |
5.4 小结 | 第85-87页 |
第六章 全文总结与展望 | 第87-89页 |
6.1 本论文的主要创新点 | 第87-88页 |
6.2 研究中存在的不足及展望 | 第88-89页 |
参考文献 | 第89-93页 |
致谢 | 第93-95页 |
附件 | 第95页 |