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嗜酸性喜温硫杆菌渗透压调节子ompR的无痕敲除及其相关性质的研究

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
第一章 研究背景第11-19页
    1.1 嗜酸硫杆菌属简介第11-12页
        1.1.1 嗜酸硫杆菌属及其分类第11页
        1.1.2 嗜酸硫杆菌属在生物冶金中的作用第11-12页
    1.2 嗜酸性喜温硫杆菌的简介第12-13页
    1.3 渗透压调节子ompR的研究进展第13-15页
    1.4 本论文的研究目的、内容及意义第15-19页
        1.4.1 本论文的研究目的第15-16页
        1.4.2 本论文的研究内容第16页
        1.4.3 本论文的科学意义第16-19页
第二章 渗透压调节子ompR基因的无痕敲除第19-43页
    2.1 引言第19-22页
    2.2 材料与方法第22-31页
        2.2.1 菌株与质粒第22页
        2.2.2 培养基和培养条件第22-23页
        2.2.3 菌株培养条件第23-24页
        2.2.4 试剂和仪器第24页
        2.2.5 分子生物学相关操作技术第24-31页
    2.3 结果与讨论第31-42页
        2.3.1 orf1207的无痕敲除第31-36页
        2.3.2 orf2590的无痕敲除第36-40页
        2.3.3 在A.caldus(△orf2590)基础上对orfl207进行无痕敲除第40-42页
    2.4 小结第42-43页
第三章 野生菌株与ompR突变体的表型分析第43-51页
    3.1 引言第43页
    3.2 材料与方法第43-45页
        3.2.1 菌株第43页
        3.2.2 培养基和培养条件第43-44页
        3.2.3 试剂和仪器第44页
        3.2.4 A.caldus生长曲线的测定第44页
        3.2.5 细胞膜通透性的检测第44-45页
    3.3 结果与讨论第45-49页
        3.3.1 野生型菌株与突变型菌株在高渗透压条件下以S~0为硫能源培养时的生长曲线第45-46页
        3.3.2 细胞膜通透性的检测第46-49页
    3.4 小结第49-51页
第四章 突变株与野生株的转录组测序分析第51-69页
    4.1 引言第51页
    4.2 材料与方法第51-57页
        4.2.1 菌株第51页
        4.2.2 培养基和培养条件第51-52页
        4.2.3 试剂和仪器第52页
        4.2.4 分子生物学相关操作技术第52-55页
        4.2.5 转录组测序建库测序流程第55-56页
        4.2.6 信息分析流程第56-57页
        4.2.7 差异比较方案设计第57页
    4.3 结果与讨论第57-68页
        4.3.1 RNA样品的检测结果第57-58页
        4.3.2 参考序列比对分析第58-59页
        4.3.3 显著差异表达基因筛选第59-60页
        4.3.4 显著差异表达基因Pathway富集及分析第60-67页
        4.3.5 测序结果的验证第67-68页
    4.4 小结第68-69页
第五章 受渗透压调节子OmpR直接调控的靶基因探究第69-87页
    5.1 引言第69页
    5.2 材料与方法第69-74页
        5.2.1 菌株与质粒第69页
        5.2.2 培养基和培养条件第69-70页
        5.2.3 试剂和仪器第70-71页
        5.2.4 生物信息学和分子生物学相关操作技术第71-74页
    5.3 结果与讨论第74-85页
        5.3.1 可能受OmpR直接调控的靶基因的筛选第74-75页
        5.3.2 OmpR(orf1207)的表达纯化及与靶基因相互作用探究第75-81页
        5.3.3 OmpR(orf2590)的表达纯化及与靶基因相互作用探究第81-85页
    5.4 小结第85-87页
第六章 全文总结与展望第87-89页
    6.1 本论文的主要创新点第87-88页
    6.2 研究中存在的不足及展望第88-89页
参考文献第89-93页
致谢第93-95页
附件第95页

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