| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 基因名称缩略表（Gene name abbreviations） | 第9-12页 |
| 1 胚胎发育生物学简介 | 第12-22页 |
| 1.1 胚胎发育生物学发展 | 第12-14页 |
| 1.2 高通量基因组学研究技术在胚胎发育中的应用 | 第14-16页 |
| 1.2.1 生物芯片技术 | 第14-15页 |
| 1.2.2 高通量测序技术 | 第15-16页 |
| 1.3 大黄鱼胚胎发育研究进展 | 第16-22页 |
| 1.3.1 形态学研究 | 第17-18页 |
| 1.3.2 分子学研究 | 第18-20页 |
| 1.3.3 高通量基因表达谱的研究 | 第20-22页 |
| 2 研究目的及意义 | 第22-23页 |
| 3 实验材料和方法 | 第23-31页 |
| 3.1 实验材料 | 第23-25页 |
| 3.1.1 胚胎材料的获取 | 第23-24页 |
| 3.1.2 主要仪器 | 第24页 |
| 3.1.3 主要引物 | 第24-25页 |
| 3.2 实验方法 | 第25-31页 |
| 3.2.1 总RNA提取 | 第25页 |
| 3.2.2 去除RNA中残留的基因组 | 第25-26页 |
| 3.2.3 m RNA的浓度及质量检测 | 第26页 |
| 3.2.4 转录组测序 | 第26-27页 |
| 3.2.5 转录组信息分析 | 第27-28页 |
| 3.2.6 转录本的表达丰度 | 第28-29页 |
| 3.2.7 反转录反应 | 第29页 |
| 3.2.8 Real time PCR反应 | 第29-30页 |
| 3.2.9 样本层次聚类树及主成分分析（PCA） | 第30页 |
| 3.2.10 共表达模块划分 | 第30-31页 |
| 4 结果与分析 | 第31-49页 |
| 4.1 胚胎收集结果 | 第31页 |
| 4.2 RNA提取结果 | 第31-32页 |
| 4.3 转录组概况 | 第32-38页 |
| 4.3.1 转录本打断随机性 | 第32页 |
| 4.3.2 样品测序分析 | 第32-33页 |
| 4.3.3 样本关系分析 | 第33-35页 |
| 4.3.4 显著差异表达基因统计 | 第35-37页 |
| 4.3.5 基因共表达网络分析 | 第37-38页 |
| 4.4 特定时期功能基因分析 | 第38-47页 |
| 4.4.1 母源基因 | 第38-42页 |
| 4.4.2 能量代谢 | 第42-45页 |
| 4.4.3 器官的发生 | 第45-47页 |
| 4.5 RT-PCR验证 | 第47-49页 |
| 5. 结论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-60页 |
| 在学期间发表论文 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |