| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 本文研究目的及意义 | 第11-12页 |
| 1.2 环形RNA的研究历程 | 第12-13页 |
| 1.3 本文的研究方案及拟解决的关键问题 | 第13-15页 |
| 1.4 本文的研究内容与安排 | 第15-16页 |
| 1.5 本章小结 | 第16-17页 |
| 第二章 环形RNA及其研究背景介绍 | 第17-25页 |
| 2.1 引言 | 第17页 |
| 2.2 RNA剪接与可变剪接、非传统剪接 | 第17-19页 |
| 2.3 环形RNA的特性 | 第19-21页 |
| 2.3.1 环形RNA的全基因组识别 | 第19-20页 |
| 2.3.2 环形RNA的基因组长度 | 第20-21页 |
| 2.3.3 环形RNA在细胞内的分布 | 第21页 |
| 2.4 环形RNA的潜在生物学功能 | 第21-23页 |
| 2.4.1 miRNA分子海绵 | 第21-22页 |
| 2.4.2 环形RNA其它潜在的生物学作用 | 第22-23页 |
| 2.5 环形RNA与疾病的联系 | 第23页 |
| 2.6 环形RNA与类病毒 | 第23页 |
| 2.7 环形RNA分子数据库 | 第23-24页 |
| 2.8 本章小结 | 第24-25页 |
| 第三章 人类环形RNA分子的数据集及生物学分析 | 第25-40页 |
| 3.1 引言 | 第25页 |
| 3.2 人类环形RNA分子数据集来源 | 第25-26页 |
| 3.3 人类环形RNA分子数据集预处理 | 第26-30页 |
| 3.4 人类环形RNA分子的生物学统计分析 | 第30-39页 |
| 3.4.1 人类环形RNA分子的基因组特征分析 | 第30-34页 |
| 3.4.2 转录环形RNA基因的富集分析 | 第34-39页 |
| 3.5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 人类环形RNA分子的编码潜能分析 | 第40-55页 |
| 4.1 引言 | 第40页 |
| 4.2 环形RNA编码蛋白质的工作机制 | 第40-41页 |
| 4.2.1 IRES的特征及作用机理 | 第40页 |
| 4.2.2 ORF的特征及预测 | 第40-41页 |
| 4.2.3 环形RNA编码蛋白的工作机制 | 第41页 |
| 4.3 内部核糖体进入位点的识别 | 第41-52页 |
| 4.3.1 RNALfold预测局部稳定的二级结构 | 第42-44页 |
| 4.3.2 RNA Align RNA二级结构比较 | 第44-50页 |
| 4.3.2.1 RNA二级结构比对 | 第44-45页 |
| 4.3.2.2 线性判别分析LDA | 第45-47页 |
| 4.3.2.3 LDA在R阈值判定中的应用 | 第47-50页 |
| 4.3.3 pknotsRG假结结构计算 | 第50-51页 |
| 4.3.4 IRES识别结果分析 | 第51-52页 |
| 4.4 开放阅读框的预测 | 第52-54页 |
| 4.5 环形RNA编码潜能预测分析 | 第54页 |
| 4.6 本章小结 | 第54-55页 |
| 第五章 人类环形RNA分子的数据库构建 | 第55-65页 |
| 5.1 引言 | 第55页 |
| 5.2 人类环形RNA分子数据库circRNADb简介 | 第55-56页 |
| 5.3 人类环形RNA分子数据库circRNADb功能 | 第56-64页 |
| 5.4 本章小结 | 第64-65页 |
| 第六章 总结与展望 | 第65-67页 |
| 6.1 总结 | 第65页 |
| 6.2 展望 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 在学期间的研究成果及学术论文情况 | 第75页 |
