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MicroRNA对铁观音茶树干旱胁迫响应机制研究

摘要第10-13页
Abstract第13-15页
第一章 引言第16-24页
    1 茶树抗性研究进展第16-18页
        1.1 茶树生物胁迫的研究进展第16-17页
        1.2 茶树非生物胁迫的研究进展第17-18页
    2 植物miRNA研究进展第18-22页
        2.1 植物miRNA的生物合成第18页
        2.2 植物miRNA的作用机理第18-19页
        2.3 植物miRNA的研究方法第19-20页
        2.4 MiRNA与植物抗性的应答调控第20-22页
            2.4.1 植物生物胁迫第20页
            2.4.2 植物非生物胁迫第20-22页
    3 MiR166家族的研究进展第22页
    4 本项目的意义及主要内容第22-24页
        4.1 本项目研究的意义第22-23页
        4.2 本项目研究的主要内容第23-24页
第二章 铁观音茶树干旱胁迫过程中主要生理生化成分变化第24-30页
    1 材料与方法第24-25页
        1.1 材料第24-25页
            1.1.1 试验材料第24页
            1.1.2 试验主要试剂第24页
            1.1.3 试验主要仪器第24-25页
        1.2 试验方法第25页
            1.2.1 叶片含水量及土壤含水量测定方法第25页
            1.2.2 叶片丙二醛含量测定方法第25页
            1.2.3 叶片叶绿素含量测定方法第25页
            1.2.4 叶片电导率测定方法第25页
    2 结果与分析第25-28页
        2.1 铁观音茶树干旱胁迫过程中叶片及土壤含水量变化第26页
        2.2 铁观音茶树干旱胁迫过程中叶片叶绿素含量变化第26-27页
        2.3 铁观音茶树干旱胁迫过程中叶片丙二醛含量变化第27页
        2.4 铁观音茶树干旱胁迫过程中叶片电导率变化第27-28页
    3 讨论第28-30页
第三章 Solexa测序技术鉴定铁观音茶树不同干旱胁迫过程中的sRNA第30-54页
    1 材料与方法第30-33页
        1.1 材料第30页
            1.1.1 试验材料第30页
            1.1.2 试验主要试剂第30页
            1.1.3 试验主要仪器第30页
        1.2 试验方法第30-33页
            1.2.1 铁观音茶树叶片总RNA的提取方法第30-31页
            1.2.2 铁观音茶树干旱胁迫过程中sRNA文库的构建及Solexa测序第31-32页
            1.2.3 铁观音茶树分水处理过程中sRNA的生物信息学分析第32-33页
    2 结果与分析第33-51页
        2.1 铁观音茶树叶片总RNA的质量检测第33页
        2.2 铁观音茶树干旱胁迫过程中sRNA的数据注释与分析第33-43页
            2.2.1 铁观音茶树干旱胁迫过程中sRNA的数据质量及长度分布第33-36页
            2.2.2 铁观音茶树干旱胁迫过程中sRNA公共及特有序列比对第36-37页
            2.2.3 铁观音茶树干旱胁迫过程中sRNA与分析数据库的比对第37-41页
            2.2.4 铁观音茶树干旱胁迫过程中sRNA的分类注释第41-43页
        2.3 铁观音茶树干旱胁迫过程中conserved miRNA数据分析第43-45页
            2.3.1 铁观音茶树干旱胁迫过程中conserved miRNA的差异分析第43-44页
            2.3.2 铁观音茶树干旱胁迫过程中conserved miRNA的靶基因预测第44-45页
            2.3.3 铁观音茶树干旱胁迫过程中conserved miRNA靶基因的GO功能预测第45页
        2.4 铁观音茶树干旱胁迫过程中novel miRNA的预测第45-50页
            2.4.1 铁观音茶树干旱胁迫过程中novel miRNA的首位碱基偏好性第46-48页
            2.4.2 铁观音茶树干旱胁迫过程中novel miRNA的差异分析第48-49页
            2.4.3 铁观音茶树干旱胁迫过程中novel miRNA的靶基因预测第49-50页
            2.4.4 铁观音茶树干旱胁迫过程中novel miRNA靶基因的GO功能预测第50页
        2.5 参考铁观音茶树转录组的sRNA数据分析第50-51页
    3 讨论第51-54页
        3.1 铁观音茶树与干旱胁迫相关miRNA数量较多第51-52页
        3.2 铁观音茶树与干旱胁迫相关的绝大部分miRNA为低丰度表达第52页
        3.3 铁观音茶树miRNA参与干旱胁迫的应答第52-54页
第四章 铁观音茶树干旱胁迫过程中相关miRNA的定量表达分析第54-65页
    1 材料与方法第54-56页
        1.1 材料第54-55页
            1.1.1 试验材料第54页
            1.1.2 试验主要试剂第54页
            1.1.3 试验主要仪器第54-55页
        1.2 试验方法第55-56页
            1.2.1 铁观音茶树叶片总RNA的提取与质量检测第55页
            1.2.2 铁观音茶树叶片sRNA的加尾与cDNA合成第55页
            1.2.3 铁观音茶树叶片miRNA qPCR引物设计第55页
            1.2.4 Roche LightCycler(?)480 qPCR扩增第55-56页
            1.2.5 数据分析第56页
    2 结果与分析第56-63页
        2.1 铁观音茶树叶片miRNA qPCR引物的特异性和扩增效率分析第56-57页
        2.2 铁观音茶树干旱胁迫过程中conserved miRNA的定量表达分析第57-60页
        2.3 铁观音茶树干旱胁迫过程中novel miRNA的定量表达分析第60-63页
    3 讨论第63-65页
        3.1 铁观音茶树中存在与干旱胁迫协同变化的miRNA第63页
        3.2 铁观音茶树novel miRNA与干旱胁迫具有相关性第63-65页
第五章 MiR166家族的靶基因克隆及定量表达分析第65-74页
    1 MiR166家族的靶基因克隆第65-69页
        1.1 材料与方法第65-66页
            1.1.1 材料第65页
            1.1.2 实验方法第65-66页
        1.2 结果与分析第66-69页
        1.3 讨论第69页
    2 MiR166家族靶基因的定量表达分析第69-74页
        2.1 材料与方法第69-71页
            2.1.1 材料第69页
            2.1.2 试验方法第69-71页
        2.2 结果与分析第71-72页
            2.2.1 MiR166家族靶基因的引物特异性与扩增效率第71页
            2.2.2 MiR166家族靶基因的定量表达分析第71-72页
        2.3 讨论第72-74页
            2.3.1 ATHN-14-like及ATHN-15-like与miR166家族存在协同表达第72-73页
            2.3.2 ATHN-15-like在铁观音茶树中度干旱胁迫时的响应最为显著第73-74页
第六章 总结第74-78页
    1 铁观音茶树干旱胁迫的主要生化成分变化第74页
    2 Solexa测序技术鉴定铁观音茶树干旱胁迫过程中的sRNA第74-75页
    3 铁观音茶树干旱胁迫过程中相关miRNA的定量表达分析第75-76页
    4 MiR166家族的靶基因克隆及定量表达分析第76-78页
参考文献第78-87页
附录第87-89页
攻读硕士期间发表的学术论文与参加的会议及项目情况第89-90页
致谢第90页

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