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A549细胞对外源金属离子刺激响应信号转导过程的蛋白质组学研究

中文摘要第10-13页
英文摘要第13-16页
第一章 绪论第17-58页
    1.1 前言第17-18页
    1.2 金属的分布和危害第18页
    1.3 锌(Zn)第18-28页
        1.3.1 锌的分布和来源第18-20页
        1.3.2 锌的生物必需性和生物毒性第20页
        1.3.3 锌的分子生物功能第20-21页
        1.3.4 锌的动态自平衡调节第21-22页
        1.3.5 锌自调节平衡相关的关键蛋白质第22-28页
            1.3.5.1 金属硫蛋白质(MT)第22-24页
            1.3.5.2 锌铁调控蛋白质(ZIPs)第24-25页
            1.3.5.3 锌铁调控蛋白质(ZnTs)第25-26页
            1.3.5.4 金属响应转录因子1(MTF-1)第26-28页
    1.4 镉(Cd)第28-33页
        1.4.1 镉的分布和来源第28页
        1.4.2 镉对人体健康的影响第28-29页
        1.4.3 镉毒性的分子机理第29-30页
        1.4.4 镉毒性相关主要生物分子第30-33页
            1.4.4.1 酶第30-31页
            1.4.4.2 谷胱甘肽第31-32页
            1.4.4.3 热应激蛋白质第32-33页
            1.4.4.4 金属硫蛋白第33页
    1.5 蛋白质组学第33-42页
        1.5.1 蛋白质组学的起源第33-34页
        1.5.2 蛋白质组学的分类第34-35页
        1.5.3 差异蛋白质组学第35页
        1.5.4 研究差异蛋白质组学的主要技术第35-40页
            1.5.4.1 二维凝胶电泳第36-37页
            1.5.4.2 样品的制备第37-38页
            1.5.4.3 等电聚焦第38-39页
            1.5.4.4 SDS-PAGE第39页
            1.5.4.5 凝胶图像的可视化第39-40页
        1.5.5 生物质谱技术第40-41页
        1.5.6 生物信息学分析第41-42页
    1.6 其它蛋白质组学研究技术与方法第42-46页
        1.6.1 荧光差异凝胶电泳(DIGE)第42-43页
        1.6.2 iTRAQ技术第43-44页
        1.6.3 蛋白质芯片第44-45页
        1.6.4 蛋白质组学的现状和发展第45-46页
    1.7 蛋白质组学在重金属毒性研究中的意义第46-48页
        1.7.1 蛋白质组学在重金属毒性研究中的优势第46页
        1.7.2 蛋白质组学在重金属毒性研究中的应用第46-48页
    1.8 选题思想和研究内容第48-49页
    参考文献第49-58页
第二章 杆菌肽锌的序列解析和光谱表征第58-76页
    摘要第58页
    2.1 前言第58-60页
    2.2 实验部分第60-61页
        2.2.1 材料和试剂第60页
        2.2.2 仪器和实验条件第60-61页
    2.3 结果和讨论第61-74页
        2.3.1 仪器条件的优化第61-62页
        2.3.2 杆菌肽锌的一级质谱第62-64页
        2.3.3 多肽序列离子和碎片离子的定义第64-65页
        2.3.4 杆菌肽A的MS/MS从头测序分析第65-70页
        2.3.5 杆菌肽锌的紫外光谱第70-71页
        2.3.6 杆菌肽锌的红外光谱第71-73页
        2.3.7 电感耦合等离子体发射光谱分析杆菌肽锌中的锌元素第73-74页
    2.4 结论第74页
    参考文献第74-76页
第三章 锌响应蛋白质组及其调控蛋白质的时间依赖性表达第76-97页
    摘要第76页
    3.1 前言第76-78页
    3.2 实验部分第78-84页
        3.2.1 实验材料和试剂第78-79页
        3.2.2 实验方法第79-84页
            3.2.2.1 细胞培养第79页
            3.2.2.2 外源锌对细胞的压力第79-80页
            3.2.2.3 细胞活性分析第80页
            3.2.2.4 2DE和Western blot蛋白质样品的制备第80-81页
            3.2.2.5 二维凝胶电泳和图像分析第81页
            3.2.2.6 蛋白质鉴定第81-82页
            3.2.2.7 Western blot第82-83页
            3.2.2.8 RT-PCR第83页
            3.2.2.9 统计分析第83-84页
    3.3 实验结果第84-91页
        3.3.1 细胞活性第84页
        3.3.2 二维凝胶电泳和蛋白质鉴定第84-86页
        3.3.3 差异蛋白质的功能分析第86-88页
        3.3.4 Western blot第88-89页
        3.3.5 RT-PCR第89-91页
    3.4 讨论第91-94页
    3.5 结论第94-95页
    参考文献第95-97页
第四章 A549细胞及其蛋白质组对外源锌刺激的动态响应第97-122页
    摘要第97页
    4.1 前言第97-100页
    4.2 实验部分第100-103页
        4.2.1 实验材料和试剂第100页
        4.2.2 实验方法第100-103页
            4.2.2.1 细胞培养第100页
            4.2.2.2 外源锌对细胞的压力第100页
            4.2.2.3 细胞活性分析第100-101页
            4.2.2.4 蛋白质样品的制备第101页
            4.2.2.5 二维凝胶电泳和图像分析第101页
            4.2.2.6 蛋白质鉴定第101-102页
            4.2.2.7 Western blot第102页
            4.2.2.8 锌含量的测定第102页
            4.2.2.9 细胞内自由Zn~(2+)的共聚焦成像第102-103页
            4.2.2.10 统计分析第103页
    4.3 实验结果第103-114页
        4.3.1 细胞活性第103页
        4.3.2 锌响应蛋白质的表达模式第103-109页
        4.3.3 差异表达蛋白质的鉴定和功能分组第109-111页
        4.3.4 蛋白质HSP90α和hnRNPA1的表达模式第111-112页
        4.3.5 差异蛋白质浓度的测定第112-113页
        4.3.6 差异Zn含量的测定第113-114页
        4.3.7 细胞内自由Zn~(2+)的观测第114页
    4.4 讨论第114-119页
    4.5 结论第119-120页
    参考文献第120-122页
第五章 A549细胞及其蛋白质组对外源镉刺激的动态响应第122-143页
    摘要第122页
    5.1 前言第122-124页
    5.2 实验部分第124-125页
        5.2.1 实验材料和试剂第124页
        5.2.2 实验方法第124-125页
            5.2.2.1 细胞培养第124页
            5.2.2.2 外源镉对细胞的压力第124页
            5.2.2.3 细胞活性分析第124-125页
            5.2.2.4 蛋白质样品的制备第125页
            5.2.2.5 二维凝胶电泳和图像分析第125页
            5.2.2.6 蛋白质鉴定第125页
            5.2.2.7 Western Blot第125页
            5.2.2.8 Cd、Zn、Cu、Co、Mn含量的测定第125页
            5.2.2.9 RT-PCR第125页
            5.2.2.10 统计分析第125页
    5.3 实验结果第125-137页
        5.3.1 细胞活性第125-127页
        5.3.2 镉响应蛋白质的表达模式第127-131页
        5.3.3 差异表达蛋白质的鉴定和功能分组第131-133页
        5.3.4 差异蛋白质浓度的测定第133页
        5.3.5 蛋白质HSP90α和hnRNPA1的表达模式第133-134页
        5.3.6 差异镉含量和必需金属含量的测定第134-135页
        5.3.7 MT-1和ZIP-8的差异表达第135-137页
    5.4 讨论第137-140页
    5.5 结论第140-141页
    参考文献第141-143页
结论第143-145页
致谢第145-146页
附录A第146-157页
附录B第157-160页

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