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β-葡聚糖酶的定向进化及热稳定性研究

目录第1-12页
摘要第12-14页
ABSTRACT第14-17页
第一章 文献综述第17-48页
 1 β-葡聚糖酶的研究概况第17-21页
   ·β-葡聚糖酶的分布第17页
   ·β-葡聚糖酶的酶学性质第17-18页
   ·β-葡聚糖酶的结构与功能研究第18-19页
     ·β-葡聚糖酶的三级结构和折叠第18页
     ·β-葡聚糖酶催化水解机理和催化氨基酸残基第18-19页
   ·β-葡聚糖酶的分子生物学研究第19-20页
   ·β-葡聚糖酶的蛋白质工程第20-21页
     ·杂合酶和热稳定性第20页
     ·循环重排第20-21页
 2 体外分子定向进化研究进展第21-36页
   ·体外分子定向进化的基本思路和策略第21页
   ·体外分子定向进化技术的演变和发展第21-30页
     ·以寡核苷酸为基础的最大随机化过程第21-23页
     ·整个基因的随机突变第23页
     ·依赖于序列同源的重组第23-28页
     ·不依赖于序列同源的重组第28-30页
     ·用计算机数值模拟进行定向进化第30页
   ·蛋白质进化方法的优、缺点第30-33页
   ·突变体文库筛选技术第33-34页
   ·体外分子定向进化的应用和发展前景第34-36页
 3 嗜热酶的研究进展第36-46页
   ·嗜热酶的生物化学和分子生物学特性第36-37页
   ·嗜热酶基因的克隆与表达第37页
   ·蛋白质的热稳定性机制第37-42页
     ·氨基酸组成及其内在倾向性对蛋白质热稳定性的影响第38-39页
     ·蛋白质分子内作用力对蛋白质热稳定性的影响第39-40页
     ·蛋白质构型对蛋白质热稳定性的影响第40-42页
   ·提高蛋白质稳定性的策略第42-46页
     ·蛋白质工程策略第42-44页
     ·计算机数值模拟方法第44页
     ·化学修饰法第44-45页
     ·保护剂的添加第45-46页
 4 选题背景及研究内容第46-48页
第二章 枯草芽孢杆菌ZJF-1A5 B-葡聚糖酶基因的克隆与表达第48-69页
 0 前言第48页
 1 材料与方法第48-58页
   ·菌株、质粒和酶第48页
   ·培养基第48-49页
   ·主要仪器和设备第49页
   ·实验方法第49-58页
     ·引物的设计和合成第49-50页
     ·基因组提取第50页
     ·β-葡聚糖酶基因的扩增第50页
     ·PCR产物的纯化和回收第50页
     ·PCR产物的克隆第50页
     ·感受态细胞的制备和转化第50-51页
     ·质粒提取第51-52页
     ·琼脂糖凝胶电泳第52-53页
     ·平衡酚的制备第53页
     ·双酶切大片断的低熔点胶回收第53-54页
     ·重组质粒pUCmT-bgls的筛选和鉴定第54页
     ·重组质粒pET28 a(+)-bgls的构建第54页
     ·表达载体pET28(+)-bgls的筛选和鉴定第54-55页
     ·表达产物的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测第55-56页
     ·β葡聚糖酶基因的诱导表达第56页
     ·胞外、胞内和周质空间的β葡聚糖酶的提取第56-57页
     ·β-葡聚糖酶的酶活测定第57页
     ·β-葡聚糖酶的纯化第57-58页
     ·蛋白质含量测定第58页
     ·β-葡聚糖酶的最适反应温度第58页
     ·β-葡聚糖酶的热稳定性第58页
 2 结果与分析第58-68页
   ·β-葡聚糖酶基因的扩增第58-59页
   ·β-葡聚糖酶基因的克隆与鉴定第59-61页
     ·阳性重组质粒pUCmT-bgls的PCR鉴定第59页
     ·阳性重组质粒pUCmT-bgls的双酶切鉴定第59页
     ·β-葡聚糖酶基因的序列测定第59-61页
   ·重组表达载体的构建第61-63页
     ·表达载体和宿主的选择第61页
     ·重组表达载体pET28a(+)-bgls的构建思路第61-62页
     ·重组表达载体pET28a(+)-bgls的PCR鉴定第62-63页
     ·重组表达载体pET28a(+)-bgls的双酶切鉴定第63页
     ·重组表达载体pET28a(+)-bgls中目的序列的测定第63页
   ·重组表达载体pET28a(+)-bgls的诱导表达第63-64页
   ·胞外、胞内和周质空间的β-葡聚糖酶分布第64-66页
   ·β-葡聚糖酶的纯化第66页
   ·β-葡聚糖酶的热学性质第66-68页
 3 讨论第68页
 4 小结第68-69页
第三章 高通量筛选耐高温β-葡聚糖酶方法第69-80页
 0 前言第69页
 1 材料和方法第69-71页
   ·菌株、试剂第69-70页
   ·培养基和鉴定平板第70页
   ·主要仪器和设备第70页
   ·实验方法第70-71页
     ·IPTG用量和加入方式对平板上的菌落生长和β-葡聚糖酶表达的影响第70页
     ·平板上的菌落密度对筛选的影响第70页
     ·细菌培养时间对筛选的影响第70-71页
     ·定位膜转印第71页
     ·筛选平板的制作和显色反应第71页
     ·β-葡聚糖酶酶活测定第71页
 2 结果第71-78页
   ·IPTG用量对平板上菌落生长和β-葡聚糖酶表达的影响第71-72页
   ·细菌培养时间对筛选的影响第72-73页
   ·菌落密度对筛选的影响第73-75页
   ·膜片处理温度对筛选的影响第75-76页
   ·耐高温β-葡聚糖酶菌株筛选方法的建立第76页
   ·以滤膜为基础的高通量筛选方法的稳定性考察第76-78页
   ·以滤膜为基础的高通量筛选方法与其它平板筛选方法的比较第78页
 3 讨论第78-79页
 4 结论第79-80页
第四章 热稳定性β-葡聚糖酶的定向进化第80-106页
 0 前言第80页
 1 材料与方法第80-88页
   ·实验材料第80-81页
   ·培养基第81页
   ·主要仪器和设备第81页
   ·实验方法第81-88页
     ·大肠杆菌质粒的提取第81页
     ·易错PCR扩增β-葡聚糖酶基因第81-82页
     ·随机突变酶的突变第82页
     ·DNA改组(DNA shuffling)第82-84页
     ·DEAE-纤维素膜电泳回收DNA小片段第84-85页
     ·回收双酶切的质粒载体第85-86页
     ·突变库的构建第86页
     ·含突变基因的表达文库的构建第86页
     ·突变文库的筛选第86-87页
     ·β-葡聚糖酶的纯化第87页
     ·β-葡聚糖酶活力测定第87页
     ·蛋白质的SDS-PAGE电泳第87页
     ·蛋白质浓度测定第87页
     ·DNA测序和序列比对第87页
     ·野生型酶和突变酶的催化动力学研究第87-88页
     ·野生型酶和突变酶的热稳定性第88页
     ·野生型酶和突变酶的最适反应温度第88页
     ·野生型酶和突变酶的最适pH值第88页
     ·野生型酶和突变酶的pH值稳定性第88页
     ·碱基和氨基酸序列比较分析第88页
 2 结果和分析第88-103页
   ·β-葡聚糖酶体外定向进化实验设计第88-89页
   ·β-葡聚糖酶基因的易错PCR第89-94页
     ·易错PCR条件的确定第89-93页
     ·突变文库中突变子产生透明圈的情况第93-94页
     ·随机突变文库的构建和筛选第94页
     ·热稳定性突变体的测序第94页
   ·第一代突变体基因的DNA改组第94-100页
     ·DNA改组的设计思路第94-96页
     ·DNA改组文库的构建第96-100页
     ·热稳定性酶的耐热机制分析第100页
   ·突变酶和野生酶的纯化鉴定第100-101页
   ·野生酶和突变酶的酶学性质第101-103页
     ·野生酶和突变酶的催化动力学第101页
     ·野生酶和突变酶的热稳定性和最适反应温度第101-102页
     ·野生酶和突变酶的最适pH值和pH值稳定性第102-103页
 3 讨论第103-104页
 4 结论第104-106页
第五章 突变株EGS1和EGS2的遗传稳定性第106-111页
 0 前言第106页
 1 材料与方法第106-107页
   ·菌株、质粒、酶及试剂第106页
   ·培养基第106页
   ·主要仪器和设备第106-107页
  1..4 实验方法第107页
     ·菌种传代方法第107页
     ·质粒对宿主的传代稳定性第107页
     ·β-葡聚糖酶活性测定第107页
 2 结果与分析第107-109页
   ·质粒稳定性测定第107-108页
     ·EGs1突变株的质粒稳定性测定第107-108页
     ·EGs2突变株的质粒稳定性测定第108页
   ·突变株各代细胞表达目的产物的稳定性第108-109页
     ·EGs1突变株的表达稳定性第109页
     ·EGs2突变株的表达稳定性第109页
 3 讨论第109-110页
 4 结论第110-111页
第六章 热稳定性突变体EGS2的发酵工艺研究第111-125页
 0 前言第111页
 1 材料与方法第111-112页
   ·试剂、材料第111页
   ·主要仪器和设备第111页
   ·实验方法第111-112页
     ·菌种活化第112页
     ·装液量、接种量和初始pH值的优化第112页
     ·IPTG对目的产物表达的影响第112页
     ·乳糖对目的产物表达的影响第112页
     ·诱导温度对目的产物表达的影响第112页
     ·菌株EGs2的生物量测定第112页
 2 结果与分析第112-123页
   ·最佳装液量、接种量和初始pH的确定第112-116页
   ·目的产物表达和菌体生长的条件优化第116-123页
     ·IPTG和乳糖浓度对菌体生长和目的产物表达的影响第116-118页
     ·诱导时间对菌体生长和目的产物表达的影响第118-120页
     ·诱导温度对菌体生长和目的产物表达的影响第120-123页
 3 讨论第123-124页
 4 结论第124-125页
第七章 保护剂对β-葡聚糖酶稳定性影响的研究第125-132页
 0 前言第125页
 1 实验材料、仪器和方法第125-126页
   ·实验材料第125页
   ·主要仪器和设备第125-126页
   ·实验方法第126页
     ·β-葡聚糖酶活力测定第126页
     ·保护剂的筛选第126页
     ·β-葡聚糖酶的热稳定性实验第126页
     ·β-葡聚糖酶的加速实验第126页
 2 结果与分析第126-131页
   ·不同物质对β-葡聚糖酶热稳定性的影响第126-127页
   ·保护剂浓度对β-葡聚糖酶热稳定性的影响第127-129页
   ·复合保护剂配方的优化第129-130页
   ·复合保护剂对β-葡聚糖酶热稳定性的影响第130页
   ·复合保护剂对β-葡聚糖酶储存稳定性的影响第130-131页
 3 讨论第131页
 4 结论第131-132页
第八章 β-葡聚糖酶的储存寿命估算第132-138页
 0 前言第132页
 1 材料和方法第132-133页
   ·实验材料第132页
   ·主要仪器和设备第132-133页
   ·实验方法第133页
     ·β-葡聚糖酶活力测定第133页
     ·蛋白质含量测定第133页
     ·β-葡聚糖酶的加速实验第133页
     ·实验数据的处理第133页
 2 结果与分析第133-136页
   ·β-葡聚糖酶加速稳定性实验测定结果第133-134页
   ·β-葡聚糖酶在28℃、36.2℃和45℃下的热降解速度第134页
   ·β-葡聚糖酶在不同温度下的热降解速度第134-135页
   ·β-葡聚糖酶储存寿命的估算第135-136页
 3 讨论第136-137页
 4 结论第137-138页
第九章 结论与后续研究展望第138-140页
 1 结论第138-139页
 2 后续研究展望第139-140页
参考文献第140-162页
致谢第162-163页
附:个人简历及攻读博士学位期间发表的论文第163页

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