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广西猪繁殖与呼吸综合征病毒部分Nsp2、ORF5~7基因的克隆、序列分析及分子流行病学调查研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-8页
目录第8-12页
第一章 综述第12-25页
 1 病毒分子生物学特点第13页
 2 病毒基因组特点第13-14页
 3 Nsp2及ORF5、ORF6、ORF7基因的功能与遗传变异第14-21页
   ·Nsp2基因的功能与遗传变异第14-16页
   ·ORF5基因的功能与遗传变异第16-19页
   ·ORF6基因的功能与遗传变异第19-20页
   ·ORF7基因的功能与遗传变异第20-21页
 4 高致病性猪繁殖与呼吸综合症的流行病学调查第21-23页
   ·PRRSV在Marc-145细胞的适应性第21页
   ·PRRSV的抗原性第21页
   ·流行特点第21-22页
   ·临床症状第22页
   ·病理变化第22-23页
   ·防治措施第23页
 5 研究遗传变异和分子流行病学调查对控制PRRSV的意义第23-25页
第二章 材料与方法第25-37页
 1 材料第25-30页
   ·标本第25页
   ·载体与菌株第25页
   ·分子生物学试剂第25页
   ·试剂的配制第25-26页
   ·主要仪器第26-27页
   ·参考的PRRSV毒株核苷酸序列第27-30页
     ·Genbank下载毒株序列第27-28页
     ·本实验室毒株序列第28-30页
 2 方法第30-37页
   ·实验路线第30页
   ·病料的收集和处理第30-31页
   ·病料阳性鉴定第31页
   ·病毒RNA的提取第31页
   ·反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)第31-32页
   ·PCR产物胶回收第32-33页
   ·感受态细胞的制备第33-34页
   ·基因克隆第34-35页
   ·基因测序第35页
   ·序列比较第35页
   ·遗传演化分析第35-36页
   ·推导氨基酸的基本特性比较第36-37页
第三章 结果与分析第37-77页
 1 病料的采集第37-38页
 2 部分Nsp2基因的扩增、克隆与序列分析第38-47页
   ·部分Nsp2基因的扩增结果第38页
   ·重组质粒的酶切鉴定第38页
   ·部分Nsp2基因核苷酸和推导的氨基酸序列的同源性比较第38-39页
     ·与广西分离株GXA、国内代表毒株的序列比较第38-39页
     ·与国外代表毒株的序列比较第39页
   ·部分Nsp2基因推导的氨基酸比较第39-45页
   ·本研究毒株与国内外毒株遗传进化树分析第45-47页
 3 ORF5基因的扩增、克隆与序列分析第47-59页
   ·ORF5基因的扩增结果第47页
   ·重组质粒的酶切鉴定第47页
   ·ORF5基因核苷酸和推导的氨基酸序列的同源性比较第47-49页
     ·与以前广西流行毒株的序列比较第47-48页
     ·与国内代表毒株的序列比较第48页
     ·与国外代表毒株的序列比较第48-49页
   ·ORF5基因推导编码GP5的氨基酸的比较第49-55页
     ·推导氨基酸序列的保守区/变异区和糖基化位点的变异分析第49-54页
     ·推导氨基酸序列的毒力、准种相关氨基酸位点及抗原表位的变异分析第54-55页
   ·ORF5基因遗传进化树分析第55-59页
     ·本研究毒株与国内外代表毒株遗传进化树分析第55-58页
     ·本研究毒株与2003-2006年的广西毒株的遗传进化分析第58-59页
 4 ORF6基因的扩增、克隆与序列分析第59-68页
   ·ORF6基因的扩增结果第59页
   ·重组质粒的酶切鉴定第59页
   ·ORF6基因核苷酸和推导的氨基酸序列的同源性比较分析第59-64页
     ·与以前广西流行毒株序列比较第59-60页
     ·与国内外代表毒株序列比较第60页
     ·与国外代表毒株的序列比较第60-64页
   ·推导氨基酸序列的保守区/变异区、毒力相关位点和糖基化位点的变异第64-65页
   ·ORF6基因遗传进化树分析第65-68页
     ·本研究毒株与国内外代表毒株遗传进化树分析第65-67页
     ·本研究毒株与2005年的广西毒株的遗传进化分析第67-68页
 5 ORF7基因的扩增、克隆与序列分析第68-77页
   ·ORF6基因的扩增结果第68页
   ·重组质粒的酶切鉴定第68页
   ·ORF7基因核苷酸和推导的氨基酸序列的同源性比较分析第68-73页
     ·与2005年的广西流行毒株序列比较第68-69页
     ·与国内外代表毒株序列比较第69页
     ·与国外代表毒株的序列比较第69-73页
   ·ORF7基因推导编码的N蛋白氨基酸比较第73-74页
     ·推导氨基酸序列的保守区/变异区和糖基化位点的变异分析第73页
     ·N蛋白抗原位点氨基酸的比较第73-74页
   ·ORF7基因遗传进化树分析第74-77页
     ·本研究毒株与国内外代表毒株遗传进化树分析第74-76页
     ·本研究毒株与2005年的广西毒株的遗传进化分析第76-77页
第四章 讨论第77-87页
 1 PRRSV的传播途径分析第77页
 2 Nsp2基因序列分析第77-79页
 3 ORF5基因序列分析第79-82页
 4 ORF6基因序列分析第82-84页
 5 ORF7基因序列分析第84-85页
 6 Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因遗传变异对疫苗产生和使用的影响第85-87页
第五章 结论第87-88页
参考文献第88-96页
附录:英文缩写对照表第96-97页
致谢第97-98页
发表文章第98页

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