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野生香蕉(Musa spp., AB group)抗寒相关基因的克隆与表达分析

缩写词第1-13页
摘要第13-16页
Abstract第16-20页
第一章 前言第20-42页
 1 植物抗寒分子生物学研究进展第20-23页
   ·植物抗寒相关基因第20-22页
     ·冷诱导基因第21页
     ·膜稳定性相关基因第21页
     ·LEA蛋白基因第21-22页
   ·植物抗寒的分子机制第22-23页
     ·转录水平的调控第22-23页
     ·转录后水平的调控第23页
 2 抗冻蛋白研究进展第23-34页
   ·抗冻蛋白的特性第23-24页
   ·抗冻蛋白的作用机制第24页
   ·抗冻蛋白的应用第24-25页
     ·抗冻蛋白在农业上的应用第24-25页
     ·AFPs在医学研究中的应用第25页
     ·AFPs在食品加工上的应用第25页
     ·AFPs在工业上的应用第25页
   ·鱼类抗冻蛋白第25-27页
   ·昆虫抗冻蛋白第27-28页
   ·细菌抗冻蛋白第28-29页
   ·植物抗冻蛋白第29-34页
     ·植物AFPs的分离及特性第29-32页
     ·抗冻蛋白转化植物研究进展第32-34页
 3 香蕉生物技术研究进展第34-40页
   ·香蕉细胞工程研究进展第35-36页
     ·香蕉悬浮细胞培养第35-36页
     ·香蕉原生质体培养第36页
   ·香蕉基因工程研究进展第36-40页
     ·香蕉有益基因的克隆第36-39页
       ·与果实成熟有关的基因第36-38页
       ·香蕉抗病相关基因的克隆第38页
       ·香蕉抗寒相关基因的克隆第38页
       ·其他有益功能基因的克隆第38-39页
     ·香蕉的遗传转化第39-40页
 4 本研究的意义及主要内容第40-42页
   ·意义第40-41页
   ·主要内容第41-42页
第二章 野生香蕉低温胁迫下几丁质酶基因的cDNA全长克隆及生物信息学分析第42-80页
 第一节 三明野生香蕉低温胁迫下几丁质酶基因克隆第42-56页
  1 材料与方法第43-46页
   ·材料第43页
   ·主要试剂第43页
   ·方法第43-46页
     ·三明野生香蕉叶片总RNA的提取方法和浓度检测第43-44页
     ·三明野生香蕉叶片几丁质酶基因cDNA保守区的克隆第44页
     ·三明野生香蕉几丁质酶基因3’端序列克隆第44-45页
     ·三明野生香蕉几丁质酶基因5’端序列克隆第45页
     ·三明野生香蕉叶片几丁质酶基因全长开放阅读框(ORF)的克隆第45页
     ·PCR产物回收与测序第45页
     ·序列拼接第45-46页
     ·全长序列分析第46页
  2 结果与分析第46-54页
   ·三明野生香蕉叶片总RNA提取纯度与浓度检测第46页
   ·三明野生香蕉几丁质酶基因cDNA全长序列的获得第46-49页
   ·三明野生香蕉叶片几丁质酶基因测序结果与序列分析第49-53页
   ·三明野生香蕉ChⅠ2基因与冬黑麦几丁质酶抗冻蛋白基因的比较分析第53-54页
  3 讨论第54-56页
   ·野生香蕉叶片总RNA提取方法的探讨第54-55页
   ·三明野生香蕉ChⅠ2基因可能是几丁质酶抗冻蛋白基因第55页
   ·3'UTR与基因的抗冻活性第55页
   ·三明野生香蕉几丁质酶抗冻蛋白基因的克隆在香蕉抗寒育种中的意义第55-56页
 第二节 三明野生香蕉低温胁迫下几丁质酶基因的生物信息学分析第56-80页
  1 材料与方法第56-57页
   ·材料第56页
   ·方法第56-57页
     ·蛋白质基本理化性质预测第56页
     ·蛋白的亲疏水特性预测第56页
     ·与同源蛋白质家族比较第56页
     ·信号肽的预测第56页
     ·亚细胞定位预测第56页
     ·蛋白的跨膜结构预测第56页
     ·蛋白卷曲螺旋结构的预测第56页
     ·蛋白质二级结构预测第56页
     ·磷酸化位点预测第56页
     ·保守结构域与功能域预测第56-57页
     ·其他功能点预测第57页
     ·三维结构的预测第57页
     ·氨基酸序列的分子系统进化预测第57页
     ·基因功能的预测第57页
  2 结果与分析第57-78页
   ·蛋白质的基本理化性质第57-60页
   ·亲疏水特性预测与分析第60-61页
   ·与同源蛋白质家族比较分析第61-63页
   ·信号肽的预测和分析第63页
   ·亚细胞定位预测与分析第63-64页
   ·蛋白的跨膜结构预测与分析第64-65页
   ·蛋白卷曲螺旋结构预测与分析第65-66页
   ·蛋白的二级结构预测第66-68页
   ·磷酸化位点预测与分析第68-70页
   ·保守结构域与功能域分析第70-71页
   ·其他功能点预测和分析第71-74页
   ·三维结构预测与分析第74-75页
   ·氨基酸序列的分子系统进化预测与分析第75-77页
   ·基因功能的预测与分析第77-78页
  3 讨论第78-80页
   ·几丁质酶基因的多样性第78-79页
   ·三明野生香蕉ChiⅠ2蛋白是几丁质酶在低温下的功能类似蛋白第79页
   ·几丁质酶基因的二级结构与抗冻蛋白功能第79-80页
第三章 三明野生香蕉ChiⅠ1与ChiⅠ2基因DNA克隆及内含子分析第80-90页
 1 材料与方法第80-81页
   ·材料第80页
   ·主要试剂第80页
   ·方法第80-81页
     ·基因组DNA的提取第80页
     ·基因组DNA的检测第80页
     ·三明野生香蕉叶片ChiⅠ1、ChiⅠ2基因DNA序列的(ORF)PCR扩增第80-81页
 2 结果与分析第81-88页
   ·三明野生香蕉叶片基因组DNA的提取第81页
   ·三明野生香蕉叶片基因组DNA ChiⅠ1与ChiⅠ2基因的克隆第81-82页
   ·三明野生香蕉叶片ChiⅠ1与ChiⅠ2基因的内含子分析第82-88页
 3 讨论第88-90页
   ·几丁质酶基因内含子的功能第88-89页
   ·几丁质酶抗冻蛋白基因DNA序列获得的意义第89-90页
第四章 三明野生香蕉ChiⅠ1与ChiⅠ2基因启动子的克隆及功能预测第90-102页
 1. 材料与方法第90-92页
   ·材料第90页
   ·主要试剂第90页
   ·方法第90-92页
     ·三明野生香蕉叶片基因组DNA的提取第90页
     ·交错式热不对称PCR染色体步移第90-92页
     ·产物回收与测序第92页
     ·序列分析第92页
 2 结果与分析第92-100页
   ·启动子PCR扩增第92页
   ·三明野生香蕉ChiⅠ1与ChiⅠ2基因启动子PCR扩增产物的克隆与测序第92-94页
   ·启动子的调控元件预测第94-100页
     ·三明野生香蕉ChiⅠ1基因启动子的调控元件预测第94-95页
     ·三明野生香蕉ChiⅠ2基因启动子的调控元件预测第95-100页
 3 讨论第100-102页
   ·启动子序列中的调控元件在基因表达调控中的作用第100-101页
   ·几丁质酶抗冻蛋白基因启动子获得的意义第101-102页
第五章 三明野生香蕉低温胁迫下几丁质酶基因的表达分析第102-115页
 第一节 三明野生香蕉低温胁迫下几丁质酶基因的荧光定量PCR分析第102-110页
  1 材料与方法第103-104页
   ·材料第103页
   ·试剂与仪器第103页
   ·方法第103-104页
     ·三明野生香蕉总RNA提取以及纯度、完整性鉴定第103页
     ·cDNA合成第103页
     ·引物设计第103-104页
     ·实时荧光定量PCR条件优化和实时定量分析第104页
  2 结果与分析第104-109页
   ·实时荧光定量PCR扩增参照基因和几丁质酶基因的参数分析第104-108页
   ·三明野生香蕉叶片不同处理条件ChiⅠ1与ChiⅠ2基因的相对定量表达分析第108-109页
  3 讨论第109-110页
   ·实时荧光定量PCR技术与其他基因表达差异方法的比较第109页
   ·不同低温处理条件下的三明野生香蕉几丁质酶基因的实时表达第109-110页
 第二节 三明野生香蕉低温胁迫下几丁质酶活性的测定及变化规律探讨第110-115页
  1 材料与方法第110-112页
   ·材料第110页
   ·方法第110-112页
     ·胶体几丁质的制备第110页
     ·酶液的提取第110-111页
     ·标准N-乙酰氨基葡萄糖的测定及标准曲线的制作第111页
     ·三明野生香蕉几丁质外切酶活性测定第111页
     ·三明野生香蕉几丁质内切酶活性测定第111-112页
  2 结果与分析第112-114页
   ·N-乙酰氨基葡萄糖标准曲线第112页
   ·三明野生香蕉外切几丁质酶活性的变化规律第112-113页
   ·三明野生香蕉内切几丁质酶活性的变化规律第113-114页
  3 讨论第114-115页
第六章 三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因的cDNA全长克隆及生物信息学分析第115-144页
 第一节 三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因克隆第115-123页
  1 材料与方法第116页
   ·材料第116页
   ·方法第116页
     ·三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因cDNA保守区的克隆第116页
     ·三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因cDNA开放阅读框(ORF)的克隆第116页
     ·PCR产物回收与测序第116页
  2 结果与分析第116-122页
   ·三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因cDNA全长序列的获得第116-118页
   ·三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因测序结果与序列分析第118-121页
   ·三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因序列分析第121-122页
     ·核苷酸序列同源性比较分析第121页
     ·氨基酸序列比较分析第121-122页
  3 讨论第122-123页
   ·三明野生香蕉gsp基因可能是抗冻蛋白基因第122-123页
   ·β-1,3-葡聚糖酶基因在香蕉育种中的作用第123页
 第二节 三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因生物信息学分析第123-144页
  1 材料与方法第123-124页
   ·材料第123页
   ·方法第123-124页
  2 结果与分析第124-142页
   ·蛋白质基本理化性质第124-126页
   ·亲疏水特性预测与分析第126-127页
   ·与同源蛋白质家族比较分析第127-129页
   ·信号肽的预测和分析第129页
   ·亚细胞定位预测与分析第129-130页
   ·蛋白的跨膜结构预测与分析第130-132页
   ·蛋白卷曲螺旋结构预测与分析第132-133页
   ·蛋白二级结构的预测与分析第133-135页
   ·磷酸化位点预测与分析第135-136页
   ·其他功能点预测和分析第136-138页
   ·三维结构预测与分析第138-139页
   ·氨基酸序列的分子系统进化预测与分析第139-141页
   ·基因功能的预测与分析第141-142页
  3 讨论第142-144页
   ·三明野生香蕉β-1,3-葡聚糖酶基因的结构特点第142-143页
   ·三明野生香蕉gsp基因可能是β-1,3-葡聚糖酶抗冻蛋白基因第143-144页
第七章 三明野生香蕉gsp及gsp1基因DNA克隆及内含子分析第144-153页
 1 材料与方法第144页
   ·材料第144页
   ·方法第144页
     ·基因组DNA的提取第144页
     ·主要试剂第144页
     ·三明野生香蕉叶片gsp和gsp1基因DNA序列(ORF)的PCR扩增第144页
 2 结果与分析第144-152页
   ·三明野生香蕉叶片gsp和gsp1基因DNA序列的克隆第144-145页
   ·三明野生香蕉叶片gsp和gsp1基因的内含子分析第145-152页
 3 讨论第152-153页
   ·三明野生香蕉β-1,3-葡聚糖酶基因内含子的特殊性第152页
   ·三明野生香蕉β-1,3-葡聚糖酶基因内含子克隆的重要意义第152-153页
第八章 三明野生香蕉低温胁迫下β-1,3-葡聚糖酶基因的表达分析第153-160页
 1 材料与方法第153-160页
   ·材料第153页
   ·试剂与仪器第153页
   ·方法第153-154页
     ·总RNA提取以及纯度、完整性鉴定第153页
     ·cDNA合成第153页
     ·引物设计第153-154页
     ·实时荧光定量PCR条件优化和实时定量分析第154页
  2 结果与分析第154-159页
   ·实时荧光定量PCR扩增参照基因和β-1,3-葡聚糖酶基因的参数分析第154-158页
   ·三明野生香蕉叶片不同处理条件β-1,3-葡聚糖酶基因的相对定量表达分析第158-159页
  3 讨论第159-160页
   ·不同低温处理下三明野生香蕉β-1,3-葡聚糖酶基因的表达特点第159页
   ·三明野生香蕉gsp基因与ChiⅠ2基因可能都是抗冻蛋白基因第159-160页
第九章 小结第160-165页
 1 三明野生香蕉叶片ChiⅠ1基因、ChiⅠ2基因cDNA全长的获得及生物信息学分析第160页
 2 三明野生香蕉ChiⅠ1与ChiⅠ2基因DNA序列的克隆第160-161页
 3 三明野生香蕉ChiⅠ1与ChiⅠ2基因启动子的克隆第161页
 4 三明野生香蕉低温胁迫下几丁质酶基因的表达分析第161-163页
 5 三明野生香蕉叶片gsp基因、gsp1基因cDNA全长的获得及生物信息学分析第163页
 6 三明野生香蕉gsp及gsp1基因DNA序列的获得第163页
 7 三明野生香蕉gsp及gsp1基因的实时表达分析第163-165页
参考文献第165-179页
附录1 三明野生香蕉叶片ChiⅠ1基因(cDNA)序列登录GenBank信息第179-181页
附录2 三明野生香蕉叶片ChiⅠ2基因(cDNA)序列登录GenBank信息第181-183页
附录3 三明野生香蕉叶片ChiⅠ1基因(DNA)序列登录GenBank信息第183-186页
附录4 三明野生香蕉叶片ChiⅠ2基因(DNA)序列登录GenBank信息第186-189页
附录5 三明野生香蕉叶片gsp基因(cDNA)序列登录GenBank信息第189-191页
附录6 三明野生香蕉叶片gsp1基因(cDNA)序列登录GenBank信息第191-193页
附录7 三明野生香蕉叶片gsp基因(DNA)序列登录GenBank信息第193-195页
附录8 三明野生香蕉叶片gsp1基因(DNA)序列登录GenBank信息第195-197页
致谢第197页

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