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基于计算机模拟、自组装和力谱技术的蛋白质分子间相互作用研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-12页
主要缩略词第12-14页
1 绪论第14-30页
   ·引言第14-15页
   ·常见的蛋白质相互作用研究方法第15页
   ·基于生物信息学的蛋白质相互作用的分子模拟第15-16页
   ·AFM 简介第16-17页
   ·AFM 与蛋白质研究第17-22页
     ·AFM 与蛋白质成像第17页
     ·AFM 与蛋白质吸附第17-18页
     ·AFM 与蛋白质折叠及展开第18-19页
     ·AFM 与蛋白质组装第19-20页
     ·AFM 与蛋白质单分子识别第20-21页
     ·AFM 与蛋白质其他研究第21页
     ·AFM 与蛋白质研究的展望第21-22页
   ·单分子力谱第22-24页
   ·蛋白质的固定连接第24-27页
   ·摩擦力显微镜第27-28页
   ·本文的主要研究内容第28-29页
   ·本文的创新之处第29-30页
2 胰岛素与胰岛素降解酶之间相互作用的分子模拟第30-44页
   ·引言第30-32页
   ·2D-GraLab 模拟方法与步骤第32-38页
     ·识别蛋白质结合界面第32-33页
     ·非成键相互作用第33-34页
     ·参数设置第34-38页
   ·结果与讨论第38-43页
     ·非成键相互作用的分析和2D 布局第38-39页
     ·INS 和IDE 相互作用中的溶剂化效应第39-40页
     ·INS 和IDE 相互作用的范德华力第40-42页
     ·INS 和IDE 相互作用的总结图第42-43页
   ·本章小结第43-44页
3 大鼠抗人 IgG 蛋白质单分子层的制备及其表征第44-64页
   ·引言第44-46页
   ·材料与仪器第46页
   ·实验方法与步骤第46-49页
     ·金衬底的制备第46页
     ·MHA 分子膜的制备第46页
     ·混合SAM 的制备第46-47页
     ·大鼠抗人IgG 蛋白质连接在MHA 膜上第47页
     ·AFM 成像第47页
     ·GIXRD 测试第47页
     ·XPS 测试第47-49页
     ·CA 测试第49页
   ·结果与讨论第49-62页
     ·金衬底的表面修饰第49-50页
     ·AFM 形貌第50-54页
     ·GIXRD第54-56页
     ·XPS第56-58页
     ·CA第58-62页
   ·本章小结第62-64页
4 人 IgG 与大鼠抗人 IgG 蛋白质分子间相互作用的成像学研究第64-80页
   ·引言第64-65页
   ·材料与仪器第65页
   ·实验方法与步骤第65-66页
     ·金衬底、SAM、蛋白质分子层的制备第65页
     ·探针的修饰第65页
     ·TM-AFM 成像第65页
     ·FFM 成像第65-66页
     ·封堵实验第66页
   ·结果与讨论第66-79页
     ·TM-AFM 研究人IgG 和大鼠抗人IgG 蛋白质分子间相互作用第66-70页
     ·FFM 研究人IgG 和大鼠抗人IgG 蛋白质分子间相互作用第70-73页
     ·成像分辨率第73页
     ·成像中的假相第73-79页
   ·本章小结第79-80页
5 人 IgG 与大鼠抗人 IgG 蛋白质分子间相互作用的力学研究第80-102页
   ·引言第80-81页
   ·材料与仪器第81-82页
   ·实验方法和步骤第82-84页
     ·金衬底、SAM、蛋白质分子层的制备第82页
     ·探针的修饰第82页
     ·AFM 粘附力测试第82页
     ·人IgG 与大鼠抗人IgG 蛋白质分子间断裂力的计算第82-83页
     ·摩擦力测试及计算第83-84页
     ·封堵实验第84页
     ·交换实验第84页
   ·结果与讨论第84-100页
     ·蛋白质分子间粘附力曲线的理论模型第84-89页
     ·人IgG 和大鼠抗人IgG 蛋白质分子间的粘附力第89-94页
     ·加载速率与粘附力之间的关系第94页
     ·泊松分布统计法计算人IgG 与大鼠抗人IgG 之间的断裂力第94-96页
     ·粘附力测试中的假相第96页
     ·人IgG 和大鼠抗人IgG 蛋白质分子间的摩擦力第96-100页
   ·本章小结第100-102页
6 主要结论及后续工作建议第102-104页
   ·主要结论第102页
   ·后续工作建议第102-104页
致谢第104-106页
参考文献第106-126页
附录1 INS 和IDE 计算机模拟结果图第126-140页
附录2 作者在攻读博士学位期间科研及发表论文情况第140-141页

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