多色熔解曲线分析技术用于结核分枝杆菌二线药物耐药突变检测研究
摘要 | 第11-13页 |
Abstract | 第13-14页 |
第一章 绪论 | 第15-29页 |
第一节 结核病概况 | 第15-20页 |
1.1 结核病流行病学状况 | 第15-17页 |
1.2 结核病耐药情况 | 第17-18页 |
1.3 结核病耐药机制 | 第18-20页 |
第二节 结核病临床诊断技术 | 第20-23页 |
2.1 微生物学检测技术 | 第21-22页 |
2.2 免疫血清学检测技术 | 第22页 |
2.3 分子生物学方法 | 第22-23页 |
第三节 结核分枝杆菌异质性耐药 | 第23-24页 |
第四节 探针熔解曲线分析技术 | 第24-25页 |
参考文献 | 第25-29页 |
第二章 氟喹诺酮类药物耐药检测体系 | 第29-57页 |
第一节 引言 | 第29-31页 |
1.1 氟喹诺酮类药物 | 第29页 |
1.2 氟喹诺酮类药物耐药机制与基因突变研究 | 第29-30页 |
1.3 氟喹诺酮类药物耐药检测方法 | 第30页 |
1.4 体系检测方法建立 | 第30-31页 |
第二节 材料与方法 | 第31-37页 |
2.1 阳性质粒构建 | 第31-32页 |
2.2 异质性突变参考品制备 | 第32页 |
2.3 标本来源 | 第32页 |
2.4 提取标本DNA | 第32-33页 |
2.5 引物和探针设计 | 第33页 |
2.6 人工合成探针靶序列考察 | 第33-34页 |
2.7 体系构建和优化 | 第34页 |
2.8 体系灵敏度考察 | 第34页 |
2.9 体系特异性考察 | 第34-35页 |
2.10 异质性耐药检出能力分析 | 第35页 |
2.11 体系标本检测 | 第35页 |
2.12 标本测序验证分析 | 第35-37页 |
第三节 结果与分析 | 第37-49页 |
3.1 体系设计原理 | 第37页 |
3.2 靶序列考察 | 第37-39页 |
3.3 灵敏度考察 | 第39-40页 |
3.4 特异性考察 | 第40-41页 |
3.5 不同突变类型质粒考察 | 第41-42页 |
3.6 异质性耐药检出能力考察 | 第42-44页 |
3.7 体系标本检测 | 第44-45页 |
3.8 体系检测耐药标本分析 | 第45-46页 |
3.9 gyrB-QRDR区测序验证 | 第46-49页 |
第四节 讨论 | 第49-52页 |
参考文献 | 第52-57页 |
第三章 注射类二线药物耐药突变检测体系的建立 | 第57-85页 |
第一节 引言 | 第57-58页 |
1.1 注射类二线药物耐药机制与基因突变研究 | 第57页 |
1.2 注射类二线药物耐药检测方法 | 第57-58页 |
1.3 体系检测方法建立 | 第58页 |
第二节 材料与方法 | 第58-64页 |
2.1 异质性突变质粒参考品制备 | 第58-59页 |
2.2 标本来源 | 第59页 |
2.3 提取标本DNA | 第59页 |
2.4 引物和探针设计 | 第59-60页 |
2.5 体系突变能力区分 | 第60-61页 |
2.6 体系构建和优化 | 第61-62页 |
2.7 体系灵敏度考察 | 第62页 |
2.8 体系特异性考察 | 第62页 |
2.9 异质性耐药检出能力分析 | 第62页 |
2.10 体系标本检测 | 第62-63页 |
2.11 标本测序验证分析 | 第63-64页 |
第三节 结果与分析 | 第64-78页 |
3.1 体系设计原理 | 第64-65页 |
3.2 体系突变质粒区分能力考察 | 第65-67页 |
3.3 体系灵敏度考察 | 第67-68页 |
3.4 体系特异性考察 | 第68-69页 |
3.5 体系异质性检出能力考察 | 第69-70页 |
3.6 体系标本检测 | 第70-76页 |
3.7 不一致标本测序分析 | 第76-77页 |
3.8 7份耐药不一致标本测序其它基因的分析 | 第77-78页 |
第四节 讨论 | 第78-81页 |
参考文献 | 第81-85页 |
附录1 46种非结核分枝杆菌信息 | 第85-86页 |
英文缩写索引 | 第86-87页 |
致谢 | 第87页 |