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嗜热毛壳菌AA9家族多糖单加氧酶区域选择性研究

符号说明第5-10页
中文摘要第10-12页
Abstract第12-14页
1 引言第15-34页
    1.1 生物质概述第15-18页
        1.1.1 纤维素第15-17页
        1.1.2 木质纤维素第17-18页
    1.2 生物质的酶降解第18-20页
    1.3 多糖单加氧酶研究进展第20-31页
        1.3.1 多糖单加氧酶概述第20-23页
        1.3.2 多糖单加氧酶结构第23-25页
        1.3.3 多糖单加氧酶作用机理第25-26页
        1.3.4 多糖单加氧酶的底物特异性第26-27页
        1.3.5 多糖单加氧酶的区域选择性第27-29页
        1.3.6 多糖单加氧酶研究方法第29-31页
    1.4 嗜热真菌概述第31-33页
    1.5 立题依据第33-34页
2 材料与方法第34-53页
    2.1 试验材料第34-37页
        2.1.1 供试菌株与质粒第34页
        2.1.2 生化试剂、试剂盒、酶第34页
        2.1.3 仪器、层析板、色谱柱第34-35页
        2.1.4 溶液配制第35-36页
        2.1.5 培养基第36-37页
        2.1.6 酶促反应底物第37页
    2.2 实验方法第37-53页
        2.2.1 总RNA、cDNA的获取及Ctpmo1基因的获得第37-39页
        2.2.2 CtPMO1酶的真核表达第39-46页
        2.2.3 CtPMO1酶的N端鉴定第46-48页
        2.2.4 CtPMO1酶活性以及TLC鉴定第48-49页
        2.2.5 酶解产物的MALDI-TOF-MS鉴定第49页
        2.2.6 CtPMO1酶解产物的核磁共振谱第49页
        2.2.7 I_2氧化法分析CtPMO1酶解产物第49-50页
        2.2.8 Br_2氧化法分析CtPMO1酶解产物第50页
        2.2.9 还原法分析CtPMO1酶解产物第50页
        2.2.10 Br_2氧化法分析CtPMO1酶解反应不溶物第50页
        2.2.11 Br_2氧化法分析以纤维七糖为底物的CtPMO1酶解产物第50-51页
        2.2.12 CtPMO1酶的同源建模第51页
        2.2.13 CtPMO1酶的位点突变第51-52页
        2.2.14 CtPMO1酶突变酶的产物鉴定第52页
        2.2.15 PMO酶的序列比对以及系统发育树第52-53页
3 结果与分析第53-91页
    3.1 总RNA、cDNA的获取及Ctpmo1基因的获得第53-54页
    3.2 CtPMO1酶的真核表达第54-58页
    3.3 CtPMO1酶的N端鉴定第58-61页
        3.3.1 CtPMO1酶的N端测序第58-59页
        3.3.2 CtPMO1酶的N端质谱鉴定第59-61页
    3.4 CtPMO1酶活性及可溶性产物分析第61-71页
        3.4.1 CtPMO1酶活性及可溶性产物的TLC分析第61页
        3.4.2 CtPMO1可溶性酶解产物的MALDI-TOF-MS鉴定第61-67页
        3.4.3 CtPMO1酶解产物的核磁共振谱第67页
        3.4.4 I_2氧化法分析CtPMO1酶解产物第67-69页
        3.4.5 Br_2氧化法分析CtPMO1酶解产物第69-71页
        3.4.6 还原法分析CtPMO1酶解产物第71页
    3.5 CtPMO1酶解反应不溶物成分分析第71-73页
    3.6 CtPMO1酶对纤维寡糖的氧化作用第73-75页
    3.7 CtPMO1酶的三维结构模型第75-76页
    3.8 底物结合平面芳香族氨基酸在CtPMO1酶活性中的作用第76-84页
        3.8.1 CtPMO1突变酶可溶性产物的TLC和MALDI-TOF-MS分析第76-79页
        3.8.2 CtPMO1突变酶可溶性产物的C4、C6位氧化分析第79-81页
        3.8.3 CtPMO1突变酶可溶性产物的HPACE-PAD分析第81-82页
        3.8.4 CtPMO1突变酶反应不溶物的碳位氧化分析第82-84页
    3.9 底物结合平面其他氨基酸在CtPMO1酶活性中作用的初步研究第84-88页
        3.9.1 活性中心氨基酸对CtPMO1酶活性影响的初步研究第84-86页
        3.9.2 Gln166位点对CtPMO1酶活性的影响的初步研究第86-88页
    3.10 C6氧化PMO酶的序列比对以及系统发育分析第88-91页
4 讨论第91-99页
    4.1 I_2氧化鉴定方法的弊端第91-92页
    4.2 Br_2氧化方法的优势第92-93页
    4.3 CtPMO1酶C6氧化更易发生于可溶性寡糖第93页
    4.4 CtPMO1酶对底物氧化区域选择性的分子机理第93-95页
    4.5 CtPMO1酶具有C6氧化功能的机理尚未明确第95-96页
    4.6 C6氧化产物的去向第96页
    4.7 底物结合平面其他氨基酸对酶活性的影响第96-97页
    4.8 多糖单加酶分类第97-98页
    4.9 AA9家族蛋白的多样性第98-99页
5 结论第99-102页
    5.1 CtPMO1酶的获得及碳位氧化区域选择性第99-100页
    5.2 CtPMO1酶可作用于可溶性纤维寡糖第100页
    5.3 底物结合位点影响CtPMO1酶的区域选择性第100页
    5.4 其他影响CtPMO1酶活性的位点第100-101页
    5.5 CtPMO1酶序列比对以及系统发育分析第101-102页
参考文献第102-119页
附录第119-120页
致谢第120-121页
攻读学位期间发表论文情况第121页

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