短花针茅响应放牧的转录组学及遗传多样性研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-9页 |
| 第一章 前言 | 第12-19页 |
| 1.1 研究目的与意义 | 第12-13页 |
| 1.2 研究综述 | 第13-17页 |
| 1.2.1 转录组测序 | 第13-14页 |
| 1.2.2 与放牧相关的基因挖掘 | 第14-15页 |
| 1.2.3 分子标记与遗传多样性 | 第15-16页 |
| 1.2.4 针茅属植物遗传多样性研究进展 | 第16-17页 |
| 1.3 研究内容及技术路线 | 第17-19页 |
| 1.3.1 研究内容 | 第17页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第17-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-22页 |
| 2.1 取样 | 第19页 |
| 2.2 转录组测序与数据验证 | 第19-20页 |
| 2.3 SSR标记开发与遗传多样性分析 | 第20-22页 |
| 2.3.1 DNA提取 | 第20-21页 |
| 2.3.2 引物设计 | 第21页 |
| 2.3.3 PCR扩增 | 第21页 |
| 2.3.4 SSR引物退火温度筛选 | 第21页 |
| 2.3.5 SSR引物多态性筛选 | 第21页 |
| 2.3.6 遗传多样性分析 | 第21-22页 |
| 第三章 研究结果 | 第22-43页 |
| 3.1 转录组数据分析与验证 | 第22-36页 |
| 3.1.1 注释统计 | 第22页 |
| 3.1.2 GO注释结果 | 第22-23页 |
| 3.1.3 COG注释结果 | 第23-24页 |
| 3.1.4 KEGG注释结果 | 第24-25页 |
| 3.1.5 差异表达基因的筛选 | 第25-26页 |
| 3.1.6 qRT-PCR验证 | 第26-29页 |
| 3.1.7 转录组数据挖掘 | 第29-36页 |
| 3.2 与放牧相关的SSR标记开发 | 第36-41页 |
| 3.2.1 SSR最佳退火温度筛选 | 第36-40页 |
| 3.2.2 SSR多态性筛选 | 第40-41页 |
| 3.3 放牧对遗传多样性的影响 | 第41-43页 |
| 第四章 讨论 | 第43-46页 |
| 4.1 放牧植株的表型差异 | 第43页 |
| 4.2 放牧条件下基因表达差异分析 | 第43-44页 |
| 4.3 放牧导致的遗传多样性的变化 | 第44-46页 |
| 第五章 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-50页 |
| 致谢 | 第50页 |
