| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-27页 |
| 1.1 碳循环与自养微生物 | 第12-16页 |
| 1.2 自养微生物固定 CO2的途径 | 第16-18页 |
| 1.2.1 Calvin 循环 | 第16-17页 |
| 1.2.2 厌氧乙酰-CoA 途径 | 第17页 |
| 1.2.3 还原性三羧酸循环途径 | 第17-18页 |
| 1.2.4 3-羟基丙酸途径 | 第18页 |
| 1.2.5 琥珀酰-CoA 途径 | 第18页 |
| 1.3 RubisCO 的研究进展 | 第18-23页 |
| 1.3.1 RubisCO 分布与定位 | 第18-19页 |
| 1.3.2 RubisCO 的结构和类型 | 第19-22页 |
| 1.3.3 RubisCO 的调控以及活性调节 | 第22-23页 |
| 1.4 自养微生物群落及多样性研究进展 | 第23-25页 |
| 1.4.1 陆地生态系统中自养微生物分子生态学研究 | 第23-24页 |
| 1.4.2 水生生态系统中自养微生物分子生态学研究 | 第24-25页 |
| 1.5 本研究的目的和内容 | 第25-27页 |
| 1.5.1 本课题的研究目的 | 第25-26页 |
| 1.5.2 本课题的研究内容 | 第26-27页 |
| 第二章 珠江水体中 RubisCO 基因多样性研究 | 第27-52页 |
| 2.1 材料与方法 | 第27-37页 |
| 2.1.1 采样 | 第27页 |
| 2.1.2 水样各种物质浓度的测定 | 第27-30页 |
| 2.1.3 水样基因组的提取与纯化 | 第30-31页 |
| 2.1.4 水样 RubisCO 基因的扩增 | 第31-32页 |
| 2.1.5 cbbL 与 cbbM 基因克隆文库的构建 | 第32-34页 |
| 2.1.6 克隆文库的 RFLP 分析 | 第34-37页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第37-50页 |
| 2.2.1 珠江中下游不同位点水样中各物质浓度 | 第37-38页 |
| 2.2.2 基因组 DNA 提取结果 | 第38页 |
| 2.2.3 cbbL 基因与 cbbM 基因 PCR 产物扩增结果 | 第38-39页 |
| 2.2.4 cbbL 基因和 cbbM 基因克隆文库的构建 | 第39-40页 |
| 2.2.5 cbbL 基因与 cbbM 基因克隆文库限制性片段长度多态性分析 | 第40-42页 |
| 2.2.6 基因文库库容以及多样性指数分析 | 第42-43页 |
| 2.2.7 cbbL 和 cbbM 克隆文库中 cbbL 与 cbbM 基因的系统发育分析 | 第43-50页 |
| 2.3 本章小结 | 第50-52页 |
| 第三章 化能自养细菌的富集、筛选和鉴定 | 第52-66页 |
| 3.1 引言 | 第52页 |
| 3.2 材料和方法 | 第52-55页 |
| 3.2.1 样品准备 | 第52页 |
| 3.2.2 培养基 | 第52-53页 |
| 3.2.3 富集培养和菌株分离 | 第53-54页 |
| 3.2.4 分离硫氧化细菌(SOB)和耐重金属贪铜菌总 DNA 的提取 | 第54页 |
| 3.2.5 分离硫氧化细菌(SOB)和耐重金属贪铜菌 16S rRNA 鉴定 | 第54页 |
| 3.2.6 分离硫氧化细菌(SOB)和耐重金属贪铜菌 cbbL 基因与 cbbM 基因的鉴定43 | 第54页 |
| 3.2.7 测序以及进化树分析 | 第54-55页 |
| 3.3 结果和讨论 | 第55-65页 |
| 3.3.1 硫氧化细菌的富集 | 第55页 |
| 3.3.2 硫氧化细菌的分离和菌落形态 | 第55-58页 |
| 3.3.3 硫氧化细菌分离菌株 16S r RNA 鉴定以及进化分析 | 第58-60页 |
| 3.3.4 分离硫氧化细菌(SOB)的 cbbL 基因与 cbbM 基因的鉴定 | 第60-63页 |
| 3.3.5 耐重金属贪铜菌的分离与菌落形态 | 第63页 |
| 3.3.6 分离菌株的 16S rRNA 鉴定以及进化分析 | 第63-64页 |
| 3.3.7 分离耐重金属贪铜菌的 cbbL 基因与 cbbM 基因的鉴定 | 第64-65页 |
| 3.4 本章小结 | 第65-66页 |
| 第四章 硫氧化细菌 | 第66-86页 |
| 4.1 引言 | 第66-68页 |
| 4.2 材料和方法 | 第68-70页 |
| 4.2.1 硫氧化细菌 | 第68页 |
| 4.2.2 硫氧化细菌 | 第68页 |
| 4.2.3 硫氧化细菌 | 第68-69页 |
| 4.2.4 基于硫氧化细菌菌株 | 第69-70页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第70-84页 |
| 4.3.1 硫氧化细菌 | 第70页 |
| 4.3.2 硫氧化细菌 | 第70-72页 |
| 4.3.3 基于硫氧化细菌菌株 | 第72-84页 |
| 4.4 本章小结 | 第84-86页 |
| 结果与展望 | 第86-89页 |
| 参考文献 | 第89-100页 |
| 附录 | 第100-108页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 附件 | 第110页 |
