| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 前言 | 第11-39页 |
| 1.1 微生物重金属研究概述 | 第13-20页 |
| 1.1.1 微生物对重金属的抗性机制假说 | 第13-15页 |
| 1.1.2 重金属铜在生命活动中的作用 | 第15页 |
| 1.1.3 酿酒酵母的铜抗性研究 | 第15-18页 |
| 1.1.4 丝状真菌的铜抗性研究 | 第18-20页 |
| 1.1.4.1 活性氧 | 第18页 |
| 1.1.4.2 抗氧化酶类及其同工酶 | 第18页 |
| 1.1.4.3 超氧化物歧化酶(SOD) | 第18-19页 |
| 1.1.4.4 过氧化物酶(POD) | 第19-20页 |
| 1.2 蛋白质组学 | 第20-26页 |
| 1.2.1 蛋白质组学研究的分类 | 第21-22页 |
| 1.2.2 蛋白质组学的主要研究策略 | 第22-24页 |
| 1.2.3 iTRAQ技术简介 | 第24-26页 |
| 1.3 真菌的蛋白质组学研究进展 | 第26-27页 |
| 1.4 代谢组学研究概述 | 第27-35页 |
| 1.4.1 代谢组学的分析方法 | 第29页 |
| 1.4.2 样品的制备 | 第29-30页 |
| 1.4.3 代谢组学研究用到的技术 | 第30-32页 |
| 1.4.4 数据的分析和解释 | 第32-33页 |
| 1.4.5 微生物领域的代谢组学 | 第33-35页 |
| 1.4.6 代谢组学与微生物重金属抗性机制 | 第35页 |
| 1.5 金属组学 | 第35-37页 |
| 1.6 本研究的工作基础,内容和目的意义 | 第37-39页 |
| 第二章 不同浓度铜胁迫下GXCR蛋白质组差异分析 | 第39-51页 |
| 2.1 材料与方法 | 第39-46页 |
| 2.1.1 真菌的培养 | 第39-40页 |
| 2.1.1.1 微紫青霉菌GXCR孢子悬液制备 | 第39页 |
| 2.1.1.2 菌丝体的培养 | 第39-40页 |
| 2.1.1.3 菌丝体的收集 | 第40页 |
| 2.1.2 真菌总蛋白的提取 | 第40页 |
| 2.1.3 蛋白质的消化 | 第40-41页 |
| 2.1.4 肽段的标记 | 第41页 |
| 2.1.5 强阳离子交换(SCX)高效液相色谱(HPLC)分离 | 第41-42页 |
| 2.1.6 肽段的纯化 | 第42-43页 |
| 2.1.7 质谱检测 | 第43-44页 |
| 2.1.8 定性和定量蛋白质分析 | 第44-45页 |
| 2.1.9 功能注释和蛋白质路径分类 | 第45-46页 |
| 2.2 实验结果 | 第46-51页 |
| 2.2.1 蛋白质定性分析结果 | 第49-50页 |
| 2.2.2 蛋白质定量分析结果 | 第50-51页 |
| 第三章 差异表达蛋白 | 第51-63页 |
| 3.1 高丰度的蛋白质 | 第51-52页 |
| 3.2 高丰度的差异表达蛋白(DP) | 第52-54页 |
| 3.3 目标的差异表达蛋白 | 第54-55页 |
| 3.4 将DPs映射到代谢途径的结果 | 第55-59页 |
| 3.5 糖酵解和糖异生途径 | 第59-60页 |
| 3.6 三羧酸循环（TCA)途径 | 第60-61页 |
| 3.7 脂肪酸合成和代谢途径 | 第61-62页 |
| 3.8 氧化磷酸化(OP)途径 | 第62页 |
| 3.9 信号传导通路 | 第62-63页 |
| 第四章 铜胁迫下的GXCR代谢产物分析 | 第63-70页 |
| 4.1 材料与方法 | 第63-66页 |
| 4.1.1 真菌的培养 | 第63-64页 |
| 4.1.1.1 真菌孢子悬液的制备 | 第63页 |
| 4.1.1.2 菌丝体的培养 | 第63-64页 |
| 4.1.1.3 菌丝体的收集 | 第64页 |
| 4.1.2 极性代谢物的提取 | 第64页 |
| 4.1.3 提取物的衍生化 | 第64-65页 |
| 4.1.4 气相色谱和质谱联用检测 | 第65页 |
| 4.1.4.1 色谱参数 | 第65页 |
| 4.1.4.2 质谱参数 | 第65页 |
| 4.1.5 代谢物鉴定 | 第65页 |
| 4.1.6 数据分析 | 第65-66页 |
| 4.2 实验结果 | 第66-70页 |
| 4.2.1 代谢物的鉴定 | 第66页 |
| 4.2.2 微紫青霉菌株GXCR铜胁迫下的代谢谱 | 第66-70页 |
| 第五章 结果分析与讨论 | 第70-79页 |
| 5.1 铜胁迫下GXCR的差异蛋白 | 第70-72页 |
| 5.2 铜胁迫下GXCR的代谢产物 | 第72-74页 |
| 5.3 GXCR抗铜机制模型 | 第74-77页 |
| 5.4 总结 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-93页 |
| 附录 | 第93-163页 |
| 致谢 | 第163-164页 |
| 攻读博士学位期间取得的科研成果 | 第164页 |