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耐高糖酿酒酵母菌株的筛选及性状诱发基因的功能研究

摘要第4-8页
Abstract第8-13页
第一章 前言第18-37页
    1.1 酿酒酵母糖发酵研究的发展史第18-19页
    1.2 绿色新能源-燃料乙醇第19-22页
    1.3 影响酿酒酵母乙醇发酵的因素第22-23页
    1.4 酿酒酵母耐高渗机制的研究第23-29页
        1.4.1 HOG途径上游信号转导机制第24-28页
        1.4.2 HOG途径下游适应性应答第28-29页
    1.5 基因表达量测定方法的发展第29-31页
        1.5.1 Northern 印迹法第29页
        1.5.2 RT-PCR第29-30页
        1.5.3 微列阵芯片技术第30-31页
        1.5.4 RNA-Seq第31页
    1.6 酵母基因功能研究方法第31-35页
    1.7 立项依据和研究内容第35-36页
    1.8 技术路线第36-37页
第二章 材料与方法第37-58页
    2.1 材料第37-40页
        2.1.1 菌株第37页
        2.1.2 培养基第37-38页
        2.1.3 菌种培养与保存第38页
        2.1.4 酶与试剂第38-39页
        2.1.5 主要仪器设备第39-40页
    2.2 实验方法第40-58页
        2.2.1 紫外诱变及筛选第40页
        2.2.2 菌株在YPD培养基中生长曲线的测定第40-41页
        2.2.3 菌株在YP40培养基中生长曲线和发酵曲线的测定第41页
        2.2.4 菌株在不同浓度葡萄糖固体培养基上的生长情况第41页
        2.2.5 菌株乙醇耐受性的检测第41页
        2.2.6 RNA的提取及质量检测第41-42页
        2.2.7 转录组测序数据分析第42-44页
        2.2.8 荧光定量PCR检测第44-46页
        2.2.9 菌株相对呼吸强度的检测第46-47页
        2.2.10 高糖胁迫下细胞膜透性的检测第47页
        2.2.11 利用Cre/LoxP系统对STE12和TUP1基因进行敲除第47-54页
        2.2.12 敲除株性状变化检测第54页
        2.2.13 STE12和TUP1基因的回补表达第54-57页
        2.2.14 回补表达菌株性状的检测第57-58页
第三章 结果与分析第58-96页
    3.1 紫外诱变菌株的筛选第58页
    3.2 菌株UV02_HG和MF02在YPD培养基中的生长曲线第58-59页
    3.3 菌株UV02_HG和MF02在YP40培养基中的生长和发酵曲线第59-60页
    3.4 菌株MF02和UV02_HG在不同浓度葡萄糖固体培养基上的生长情况第60页
    3.5 菌株MF02和UV02_HG乙醇耐受性的检测第60-61页
    3.6 RNA提取及质量检测第61-62页
    3.7 转录组测序及数据分析第62-76页
        3.7.1 测序数据质量分析第62-63页
        3.7.2 与参考基因组比对情况第63-65页
        3.7.3 表达差异分析第65页
        3.7.4 KEGG分析第65-71页
        3.7.5 GO分析第71-72页
        3.7.6 SNP分析第72-73页
        3.7.7 PheNetic网络分析第73-76页
    3.8 荧光定量PCR验证第76页
    3.9 高糖压力下突变株UV02_HG和野生菌株MF02相对呼吸强度的检测第76-78页
    3.10 高糖压力下突变菌株UV02_HG和野生菌株MF02细胞膜透性的变化第78页
    3.11 STE12和TUP1基因的敲除第78-84页
        3.11.1 两个基因的扩增第78-79页
        3.11.2 敲除系统的构建第79页
        3.11.3 酿酒酵母UV02_HG菌株单倍体细胞的制备第79-80页
        3.11.4 敲除株的筛选及验证第80-83页
        3.11.5 单倍体敲除株的复倍第83页
        3.11.6 二倍体敲除株的消抗第83-84页
    3.12 基因缺失菌株的性状检测第84-90页
        3.12.1 基因缺失菌株在YPD培养基中的生长曲线第84-85页
        3.12.2 基因缺失菌株在YP40中的生长和发酵曲线第85-86页
        3.12.3 基因缺失菌株在不同浓度葡萄糖固体培养基上的生长情况第86-87页
        3.12.4 基因缺失菌株乙醇耐受性的检测第87页
        3.12.5 基因缺失菌株相对呼吸强度的检测第87-89页
        3.12.6 基因缺失菌株在高糖压力下细胞膜透性的检测第89-90页
    3.13 STE12和TUP1基因的回补表达第90-92页
        3.13.1 STE12和TUP1的扩增第90页
        3.13.2 表达组件的构建第90-91页
        3.13.3 同源置换片段的转化及筛选第91-92页
    3.14 回补菌株性状变化的检测第92-96页
        3.14.1 基因缺失和基因回补菌株在YPD中的生长曲线第92页
        3.14.2 基因缺失和基因回补菌株在YP40中的生长和发酵曲线第92-93页
        3.14.3 基因缺失和基因回补菌株相对呼吸强度的检测第93-94页
        3.14.4 基因缺失和基因回补菌株细胞膜透性的检测第94-96页
第四章 讨论第96-106页
    4.1 野生酿酒酵母菌株MF02和突变菌株UV02_HG性状及表达差异分析第96-101页
        4.1.1 核糖体第96页
        4.1.2 线粒体和氧化磷酸化第96页
        4.1.3 糖代谢途径第96-99页
        4.1.4 MAPK途径第99页
        4.1.5 蛋白加工及运输第99-100页
        4.1.6 突变菌株性状诱发因子分析第100-101页
    4.2 STE12和TUP1基因对酿酒酵母菌株耐高糖性状的影响及功能分析第101-106页
        4.2.1 STE12基因第101-102页
        4.2.2 TUP1基因第102-106页
第五章 总结第106-108页
参考文献第108-127页
附录第127-149页
    附录Ⅰ 部分试剂的配置第127-128页
    附录Ⅱ 部分基因测序序列第128-134页
    附录Ⅲ 部分实验结果第134-149页
致谢第149-150页
攻读学位期间所发表的学术论文和研究成果第150-151页

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