| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 符号说明 | 第9-14页 |
| 1 文献综述 | 第14-28页 |
| 1.1 玉米株高和穗位高研究进展 | 第14-15页 |
| 1.1.1 玉米株高和穗位高研究的重要性 | 第14页 |
| 1.1.2 玉米株高和穗位高QTL定位研究概况 | 第14-15页 |
| 1.2 配合力的研究进展 | 第15-20页 |
| 1.2.1 配合力的分类 | 第15-16页 |
| 1.2.2 配合力的测定 | 第16-17页 |
| 1.2.3 植物数量性状的GCA及其QTL定位的研究进展 | 第17-20页 |
| 1.3 关联分析的研究进展 | 第20-28页 |
| 1.3.1 关联分析基本概念 | 第20-21页 |
| 1.3.2 连锁不平衡的基本概念 | 第21页 |
| 1.3.3 连锁不平衡的度量 | 第21-22页 |
| 1.3.4 影响LD的因素 | 第22-23页 |
| 1.3.5 连锁不平衡作图(LD作图) | 第23页 |
| 1.3.6 群体结构与亲缘关系 | 第23页 |
| 1.3.7 关联分析的基本方法 | 第23-25页 |
| 1.3.8 关联分析的应用 | 第25-28页 |
| 2 目的与意义 | 第28-29页 |
| 3 材料与方法 | 第29-34页 |
| 3.1 技术路线图 | 第29页 |
| 3.2 供试材料 | 第29-30页 |
| 3.2.1 SNP分子标记检测材料 | 第29-30页 |
| 3.2.2 田间试验材料 | 第30页 |
| 3.3 分子遗传多样性分析 | 第30-31页 |
| 3.3.1 SNP基因型分型 | 第30页 |
| 3.3.2 群体结构分析 | 第30-31页 |
| 3.3.3 亲缘关系分析 | 第31页 |
| 3.3.4 连锁不平衡分析 | 第31页 |
| 3.4 田间试验 | 第31-33页 |
| 3.4.1 试验设计 | 第31-32页 |
| 3.4.2 表型测定 | 第32页 |
| 3.4.3 数据分析 | 第32-33页 |
| 3.5 全基因组关联分析 | 第33页 |
| 3.6 候选基因的筛选与确定 | 第33-34页 |
| 4 结果与分析 | 第34-65页 |
| 4.1 供试自交系的分子遗传多样性 | 第34-40页 |
| 4.1.1 SNP标记在染色体上的分布 | 第34-36页 |
| 4.1.2 供试自交系的群体结构 | 第36-38页 |
| 4.1.3 亲缘关系分析 | 第38-39页 |
| 4.1.4 连锁不平衡分析 | 第39-40页 |
| 4.2 株高和穗位高及其一般配合力的统计分析 | 第40-58页 |
| 4.2.1 株高和穗位高的正态分布检验 | 第40-41页 |
| 4.2.2 株高和穗位高的差异显著性检验 | 第41-43页 |
| 4.2.3 不同亚群自交系株高和穗位高的比较 | 第43-45页 |
| 4.2.4 株高和穗位高一般配合力效应值的正态分布检验 | 第45-50页 |
| 4.2.5 株高和穗位高配合力效应值的差异显著性检验 | 第50页 |
| 4.2.6 不同亚群自交系株高和穗位高GCA的比较 | 第50-58页 |
| 4.3 株高和穗位高及其一般配合力的全基因组关联分析 | 第58-60页 |
| 4.3.1 株高和穗位高的全基因组关联分析 | 第58-59页 |
| 4.3.2 株高和穗位高一般配合力的全基因组关联分析 | 第59-60页 |
| 4.4 候选基因分析 | 第60-65页 |
| 4.4.1 株高和穗位高候选基因分析 | 第60-61页 |
| 4.4.2 株高和穗位高GCA候选基因分析 | 第61-65页 |
| 5 讨论 | 第65-71页 |
| 5.1 供试自交系株高和穗位高及其GCA的评价 | 第65-66页 |
| 5.1.1 自交系株高和穗位高的评价 | 第65页 |
| 5.1.2 自交系株高和穗位高GCA的评价 | 第65-66页 |
| 5.2 玉米株高和穗位高与其GCA效应的遗传基础 | 第66-68页 |
| 5.2.1 株高和穗位高关联位点与前人研究结果的比较 | 第66-67页 |
| 5.2.2 株高和穗位高GCA相关位点与前人研究结果的比较 | 第67页 |
| 5.2.3 株高和穗位高与其GCA效应可能具有不同的遗传基础 | 第67-68页 |
| 5.3 供试自交系群体中的连锁不平衡效应 | 第68-69页 |
| 5.4 候选基因评述 | 第69-71页 |
| 5.4.1 株高和穗位高候选基因评述 | 第69-70页 |
| 5.4.2 株高和穗位高GCA候选基因评述 | 第70-71页 |
| 6 结论 | 第71-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-82页 |
| 附录一 GAPIT脚本 | 第82-83页 |
| 附录二 株高和穗位高的GCA效应值 | 第83-89页 |
| 附录三 PH和EH全基因组关联分析结果曼哈顿图 | 第89-91页 |
| 附录四 PH和EH的GCA效应全基因组关联分析结果曼哈顿图 | 第91-95页 |
| 附录五 PH和EH全基因组关联分析结果Q-Q图 | 第95-96页 |
| 附录六 PH和EH的GCA效应全基因组关联分析结果Q-Q图 | 第96-97页 |
