摘要 | 第3-4页 |
ABSTRACT | 第4页 |
第一章 蛋白质折叠综述 | 第7-19页 |
1.1 蛋白质折叠概况 | 第8-12页 |
1.1.1 第二遗传密码 | 第8-10页 |
1.1.2 分子生物学的中心法则 | 第10页 |
1.1.3 蛋白质折叠的热力学和动力学 | 第10-11页 |
1.1.4 疏水性的影响 | 第11-12页 |
1.2 预测蛋白质结构 | 第12-13页 |
1.2.1 实验测定的蛋白质结构 | 第12页 |
1.2.2 基于数据的蛋白质结构预测 | 第12-13页 |
1.2.3 从头预测 | 第13页 |
1.3 蛋白质介绍 | 第13-18页 |
1.3.1 蛋白质的基本组成结构 | 第14-17页 |
1.3.2 蛋白质的形成过程 | 第17-18页 |
1.4 研究背景及意义 | 第18页 |
1.5 论文的内容和结构 | 第18-19页 |
第二章 蛋白质折叠和模拟可视化技术简介 | 第19-25页 |
2.1 OPENGL体系结构 | 第19-20页 |
2.2 GLUT类库的产生及其功能 | 第20页 |
2.2.1 GLUT | 第20页 |
2.2.2 GLUT基本功能 | 第20页 |
2.3 GLUT基本结构 | 第20-21页 |
2.3.1 GLUT的初始化 | 第20-21页 |
2.3.2 创建显示窗口 | 第21页 |
2.3.3 设置“事件”回调函数 | 第21页 |
2.3.4 窗口消息的检查 | 第21页 |
2.4 GLUT对键盘控制的实现 | 第21-22页 |
2.5 利用GLUT类库进行绘制 | 第22-25页 |
2.5.1 GLUT的安装和OPENGL的安装 | 第22-23页 |
2.5.2 用GLUT实现代码框架 | 第23-25页 |
第三章 CONNOLLY软件分子表面处理及计算 | 第25-31页 |
3.1 CONNOLLY软件计算公式相关定义 | 第26-28页 |
3.2 分子表面的表面积计算公式 | 第28页 |
3.3 分子表面的体积计算公式 | 第28页 |
3.4 CONNOLLY软件介绍 | 第28-31页 |
3.4.1 蛋白质表面 | 第29页 |
3.4.2 溶济分子可接触表面 | 第29-30页 |
3.4.3 代码介绍 | 第30-31页 |
第四章 基于CONNOLLY软件的集成化程序设计 | 第31-50页 |
4.1 程序总体设计 | 第31-32页 |
4.2 程序详细设计 | 第32-47页 |
4.2.1 读取氨基酸序列 | 第32-33页 |
4.2.2 合成肽链设计 | 第33-37页 |
4.2.3 基于CONNOLLY模块计算肽链的体积和表面积 | 第37页 |
4.2.4 肽链的折叠旋转 | 第37-42页 |
4.2.5 OPENGL显示可视化 | 第42-47页 |
4.2.6 GLUT画球函数 | 第47页 |
4.2.7 GLU绘制球杆函数 | 第47页 |
4.3 程序绘制模型 | 第47-49页 |
4.4 程序优化 | 第49-50页 |
第五章 总结及展望 | 第50-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-54页 |