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Virgibacillus halodenitrificans PDB-F2转运四氢嘧啶类物质的机制及全基因测序分析

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第1章 前言第11-25页
    1.1 研究背景与意义第11-12页
        1.1.1 研究背景第11页
        1.1.2 研究意义第11-12页
    1.2 中度嗜盐菌耐盐机制概述第12-15页
        1.2.1 中度嗜盐菌的定义和分类第12页
        1.2.2 中度嗜盐菌的特点和应用第12-14页
        1.2.3 中度嗜盐菌的耐盐机制第14-15页
    1.3 相容性溶质耐盐机制概述第15-18页
        1.3.1 相容性溶质种类和作用机制第15-16页
        1.3.2 中度嗜盐菌的相容性溶质耐盐机理第16页
        1.3.3 相容性溶质的合成与转运第16-18页
    1.4 四氢嘧啶类物质的研究进展第18-23页
        1.4.1 四氢嘧啶和羟基四氢嘧啶第18-19页
        1.4.2 四氢嘧啶和羟基四氢嘧啶的合成途径及其调控第19-21页
        1.4.3 四氢嘧啶和羟基四氢嘧啶的转运过程第21-23页
    1.5 研究目的及内容第23-25页
        1.5.1 研究目的第23页
        1.5.2 研究内容第23-24页
        1.5.3 技术路线第24-25页
第2章 实验材料及分析方法第25-36页
    2.1 实验试剂及配制方法第25-30页
        2.1.1 实验试剂第25-27页
        2.1.2 培养基及其配制第27-29页
        2.1.3 试剂配制及保存方法第29-30页
    2.2 实验仪器和设备第30-34页
        2.2.1 实验仪器/设备第30-31页
        2.2.2 主要实验仪器/设备及用途第31-34页
    2.3 分析方法第34-36页
        2.3.1 四氢嘧啶和羟基四氢嘧啶的分析方法第34-36页
第3章 不同相容性溶质对V.halodenitrificans PDB-F2的影响第36-43页
    3.1 引言第36页
    3.2 材料与方法第36-38页
        3.2.1 不同相容性溶质对V.halodenitrificans PDB-F2生长的影响实验第36-37页
        3.2.2 外加相容性溶质对V.halodenitrificans PDB-F2体内积累相容性溶质的影响实验第37页
        3.2.3 外源性四氢嘧啶对V.halodenitrificans PDB-F2在不同盐度下生长的影响实验第37-38页
    3.3 结果与讨论第38-42页
        3.3.1 不同相容性溶质对V.halodenitrificans PDB-F2在高盐环境中生长的影响第38-39页
        3.3.2 外源添加不同相容性溶质对V.halodenitrificans PDB-F2体内积累相容性溶质的影响第39-41页
        3.3.3 四氢嘧啶对V.halodenitrificans PDB-F2在不同盐度下生长的影响第41-42页
    3.4 本章小结第42-43页
第4章 V.halodenitrificans PDB-F2全基因组测序及预测分析第43-55页
    4.1 引言第43页
    4.2 材料与方法第43-44页
        4.2.1 V.halodenitrificans PDB-F2基因组DNA的提取第43-44页
        4.2.2 V.halodenitrificans PDB-F2全基因组测序和基因预测分析第44页
    4.3 结果与讨论第44-54页
        4.3.1 V.halodenitrificans PDB-F2全基因组测序结果和基因预测分析结果第44-49页
        4.3.2 V.halodenitrificans PDB-F2中相容性溶质合成和转运相关基因的预测结果第49-52页
        4.3.3 四氢嘧啶类物质转运基因预测结果的结构分析第52-54页
    4.4 本章小结第54-55页
第5章 四氢嘧啶类物质转运基因的功能验证第55-62页
    5.1 引言第55页
    5.2 材料与方法第55-58页
        5.2.1 细菌基因组DNA的提取第55页
        5.2.2 目的基因PCR扩增和表达质粒构建第55-58页
        5.2.3 功能互补验证实验第58页
    5.3 结果与讨论第58-61页
        5.3.1 目的基因的PCR扩增和表达质粒构建验证第58-60页
        5.3.2 功能互补实验结果第60-61页
    5.4 本章小结第61-62页
第6章 四氢嘧啶类物质的转运机制第62-73页
    6.1 引言第62-63页
    6.2 材料与方法第63-66页
        6.2.1 高渗冲击下V.halodenitrificans PDB-F2对四氢嘧啶类物质的转运实验第63页
        6.2.2 低渗冲击下V.halodenitrificans PDB-F2对四氢嘧啶类物质的转运实验第63页
        6.2.3 四氢嘧啶转运过程的调控水平第63页
        6.2.4 细菌总RNA的提取第63-64页
        6.2.5 cDNA第一链合成方法第64-65页
        6.2.6 实时荧光定量PCR实验第65-66页
    6.3 结果与讨论第66-71页
        6.3.1 高/低渗冲击下V.halodenitrificans PDB-F2对四氢嘧啶类物质的表观转运规律第66-68页
        6.3.2 高/低渗冲击下V.halodenitrificans PDB-F2四氢嘧啶类物质转运基因的表达规律第68-70页
        6.3.3 四氢嘧啶转运过程的调控水平第70-71页
    6.4 本章小结第71-73页
第7章 结论与展望第73-75页
    7.1 结论第73-74页
    7.2 展望第74-75页
参考文献第75-82页
致谢第82-83页
硕士期间相关研究成果第83页

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