| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 文献综述 | 第9-16页 |
| 1.1 皂荚属概况 | 第9-11页 |
| 1.1.1 皂荚属的分类与分布 | 第9页 |
| 1.1.2 皂荚属植物资源的价值概述 | 第9-11页 |
| 1.2 分子系统发育分析研究和进展 | 第11-16页 |
| 1.2.1 DNA序列测序法在植物系统进化中的应用 | 第11-12页 |
| 1.2.2 系统发育基因组学的研究及适应性进化研究 | 第12-14页 |
| 1.2.3 分子标记在植物遗传多样性研究中的应用 | 第14-16页 |
| 2 引言 | 第16-17页 |
| 2.1 研究目的与意义 | 第16页 |
| 2.2 研究内容 | 第16-17页 |
| 3 皂荚属在豆科植物中的进化关系分析 | 第17-27页 |
| 3.1 试验材料 | 第17页 |
| 3.2 试验方法 | 第17-20页 |
| 3.2.1 直系同源组的鉴定 | 第17-19页 |
| 3.2.2 物种进化树的构建 | 第19页 |
| 3.2.3 正选择基因的检测 | 第19-20页 |
| 3.2.4 正选择基因的GO和KEGG功能注释 | 第20页 |
| 3.3 试验结果与分析 | 第20-26页 |
| 3.3.1 皂荚属在豆科中的进化关系 | 第20-22页 |
| 3.3.2 直系同源对的功能分析 | 第22-23页 |
| 3.3.3 正选择进化分析 | 第23-26页 |
| 3.4 讨论 | 第26-27页 |
| 4 基于cpDNA的皂荚属植物亲缘关系分析 | 第27-32页 |
| 4.1 材料与方法 | 第27-28页 |
| 4.1.1 供试材料 | 第27页 |
| 4.1.2 试验仪器 | 第27-28页 |
| 4.1.3 试验药品 | 第28页 |
| 4.2 试验方法 | 第28-29页 |
| 4.2.1 基因组DNA提取与检测 | 第28页 |
| 4.2.2 cp DNA片段的选择 | 第28页 |
| 4.2.3 PCR扩增和测序 | 第28-29页 |
| 4.2.4 数据分析 | 第29页 |
| 4.3 试验结果 | 第29-30页 |
| 4.3.1 序列组合结果 | 第29-30页 |
| 4.3.2 建树结果 | 第30页 |
| 4.4 讨论 | 第30-32页 |
| 5 皂荚EST-SSR引物的开发 | 第32-43页 |
| 5.1 材料 | 第32-33页 |
| 5.1.1 供试材料 | 第32页 |
| 5.1.2 试验仪器 | 第32-33页 |
| 5.1.3 试验药品 | 第33页 |
| 5.2 试验方法 | 第33-35页 |
| 5.2.1 皂荚植物基因组DNA提取与检测 | 第33页 |
| 5.2.2 转录组数据来源 | 第33页 |
| 5.2.3 EST-SSR搜索与引物设计 | 第33-34页 |
| 5.2.4 PCR扩增体系建立 | 第34页 |
| 5.2.5 多态性引物的筛选及通用性引物的检测 | 第34-35页 |
| 5.3 试验结果与分析 | 第35-41页 |
| 5.3.1 SSR在转录组中的分布特点 | 第35页 |
| 5.3.2 EST-SSR类型及特征 | 第35-37页 |
| 5.3.3 EST-SSR引物的有效性、多态性及通用性检测 | 第37-41页 |
| 5.4 讨论 | 第41-43页 |
| 6 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-50页 |
| 附录 | 第50-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 作者简介 | 第57页 |
| 参加的科研项目 | 第57页 |
