| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第一章 绪论 | 第21-36页 |
| 1.1 引言 | 第21页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第21-33页 |
| 1.2.1 印楝和苦楝提取物功能研究及化学生态学效应 | 第21-24页 |
| 1.2.2 印楝和苦楝分子生物学研究进展 | 第24-31页 |
| 1.2.3 柠檬苦素类化合物合成研究进展（以印楝素为例） | 第31-32页 |
| 1.2.4 基于转录组学策略分析次生代谢物合成研究进展 | 第32-33页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第33-34页 |
| 1.4 研究基础和主要研究内容 | 第34-35页 |
| 1.4.1 研究基础 | 第34页 |
| 1.4.2 主要研究内容 | 第34-35页 |
| 1.5 研究技术路线 | 第35-36页 |
| 第二章 印楝叶片转录组测序分析 | 第36-58页 |
| 2.1 实验材料 | 第36-37页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第36-37页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第37页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第37页 |
| 2.2 实验方法 | 第37-42页 |
| 2.2.1 印楝叶片总RNA的提取 | 第37-38页 |
| 2.2.2 RNA质量检测 | 第38页 |
| 2.2.3 RNA文库构建 | 第38-39页 |
| 2.2.4 转录组文库质量检测 | 第39页 |
| 2.2.5 测序及质量控制 | 第39页 |
| 2.2.6 测序数据分析 | 第39-42页 |
| 2.3 结果与分析 | 第42-57页 |
| 2.3.1 印楝叶片总RNA提取 | 第42-43页 |
| 2.3.2 转录组测序数据比对统计与评估 | 第43-50页 |
| 2.3.3 转录组测序数据深度分析 | 第50-57页 |
| 2.4 小结与讨论 | 第57-58页 |
| 第三章 苦楝叶片转录组测序分析 | 第58-75页 |
| 3.1 实验材料 | 第58-59页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第58页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第58-59页 |
| 3.1.3 主要仪器设备 | 第59页 |
| 3.2 实验方法 | 第59-61页 |
| 3.2.1 苦楝叶片总RNA的提取和质量检测 | 第59页 |
| 3.2.2 转录组文库构建和质量检测 | 第59页 |
| 3.2.3 测序及质量控制 | 第59页 |
| 3.2.4 测序数据分析 | 第59-61页 |
| 3.3 结果与分析 | 第61-74页 |
| 3.3.1 苦楝叶片总RNA提取 | 第61-64页 |
| 3.3.2 转录组测序数据统计与评估 | 第64-68页 |
| 3.3.3 转录组测序数据深度分析 | 第68-74页 |
| 3.4 小结与讨论 | 第74-75页 |
| 第四章 印楝和苦楝转录组比较分析 | 第75-114页 |
| 4.1 实验方法 | 第75-77页 |
| 4.1.1 直系同源基因的筛选 | 第76页 |
| 4.1.2 基因表达量标准化 | 第76页 |
| 4.1.3 差异基因筛选 | 第76-77页 |
| 4.1.4 差异表达基因功能注释和富集分析 | 第77页 |
| 4.1.5 萜类合成通路相关基因的筛选 | 第77页 |
| 4.1.6 印楝和苦楝总萜含量测定 | 第77页 |
| 4.2 结果与分析 | 第77-113页 |
| 4.2.1 直系同源基因的筛选和表达量标准化 | 第77-78页 |
| 4.2.2 DEGs的筛选和功能注释 | 第78-91页 |
| 4.2.3 DEGs的富集分析 | 第91-94页 |
| 4.2.4 印楝和苦楝萜类合成通路相关基因的筛选 | 第94-112页 |
| 4.2.5 印楝和苦楝总萜含量测定 | 第112-113页 |
| 4.3 小结与讨论 | 第113-114页 |
| 第五章 印楝和苦楝柠檬苦素合成相关基因的克隆和表达 | 第114-142页 |
| 5.1 实验材料 | 第114-116页 |
| 5.1.1 菌株和载体 | 第114页 |
| 5.1.2 主要试剂 | 第114-115页 |
| 5.1.3 主要仪器设备 | 第115-116页 |
| 5.2 实验方法 | 第116-122页 |
| 5.2.1 印楝和苦楝叶片总RNA的提取及质量检测 | 第116页 |
| 5.2.2 cDNA文库构建 | 第116页 |
| 5.2.3 萜类合成相关基因全长c DNA的获取 | 第116-119页 |
| 5.2.4 目的条带割胶回收 | 第119页 |
| 5.2.5 克隆载体的构建与转化 | 第119页 |
| 5.2.6 阳性克隆的筛选 | 第119-120页 |
| 5.2.7 序列测定和重组克隆质粒抽提 | 第120页 |
| 5.2.8 AiSS重组表达质粒的构建、转化和表达 | 第120-122页 |
| 5.3 结果与分析 | 第122-141页 |
| 5.3.1 柠檬苦素合成相关基因的PCR扩增及克隆结果 | 第122-124页 |
| 5.3.2 基因的测序结果分析 | 第124-139页 |
| 5.3.3 AiSS基因的初步表达结果分析 | 第139-141页 |
| 5.4 小结与讨论 | 第141-142页 |
| 第六章 结论与展望 | 第142-146页 |
| 6.1 结论 | 第142-144页 |
| 6.1.1 印楝转录组分析 | 第142页 |
| 6.1.2 苦楝转录组分析 | 第142-143页 |
| 6.1.3 两种楝树差异基因比较分析 | 第143-144页 |
| 6.1.4 柠檬苦素合成相关基因的克隆和初步表达分析 | 第144页 |
| 6.2 展望 | 第144-146页 |
| 参考文献 | 第146-156页 |
| 附录：缩略语表 | 第156-158页 |
| 在读期间的学术研究 | 第158-159页 |
| 致谢 | 第159-160页 |
