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文昌鱼VLR样蛋白--基于三维结构的分子功能研究

摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
第一部分 文昌鱼可变淋巴受体样蛋白Bf66946的研究第11-67页
    第一章 研究背景第11-27页
        1.1 引言第11-13页
        1.2 无颌类脊椎动物中的免疫第13-21页
            1.2.1 无颌类脊椎动物中的淋巴样组织和细胞第13-15页
            1.2.2 无颌类脊椎动物中的可变淋巴受体(VLR)第15-21页
        1.3 文昌鱼中的免疫研究进展第21-27页
            1.3.1 文昌鱼中淋巴样细胞的发现第21-22页
            1.3.2 文昌鱼中发现的原始的适应性免疫系统的存在证据第22-25页
            1.3.3 文昌鱼中VLR样蛋白存在的可能性分析第25-27页
    第二章 实验材料、仪器设备与方法第27-39页
        2.1 实验材料第27页
            2.1.1 所用质粒、菌株和细胞株第27页
            2.1.2 酶与其它实验试剂第27页
        2.2 仪器设备第27-28页
        2.3 实验方法第28-39页
            2.3.1 Bf66946蛋白的重组质粒构建第28-31页
            2.3.2 目的蛋白的表达与纯化第31-33页
            2.3.3 蛋白质的质量评估第33页
            2.3.4 晶体初筛与优化第33-34页
            2.3.5 数据收集与结构解析第34-35页
            2.3.6 Bf66946与小分子的结合实验第35页
            2.3.7 Bf66946与细菌的结合实验第35-36页
            2.3.8 Bf66946与细菌肽聚糖的结合实验第36-37页
            2.3.9 文昌鱼的培养第37页
            2.3.10 荧光定量PCR第37-39页
    第三章 结果与讨论第39-67页
        3.1 文昌鱼中VLR样蛋白靶标的筛选第39-40页
        3.2 Bf66946的序列分析第40-42页
        3.3 Bf66946的表达与纯化第42-47页
        3.4 Bf66946的结晶实验第47-49页
        3.5 Bf66946的结构解析第49-53页
        3.6 Bf66946的结构与序列分析第53-58页
        3.7 Bf66946的功能分析第58-66页
            3.7.1 Bf66946与小分子的结合实验第58-59页
            3.7.2 Bf66946与细菌的结合实验第59-62页
            3.7.3 Bf66946与细菌肽聚糖的结合实验第62-64页
            3.7.4 Bf66946同源蛋白Bb24355的生理实验第64-66页
        3.8 本章小结第66-67页
第二部分 其它工作第67-85页
    第四章 蓝细菌中天冬氨酸消旋酶McyF的结构和功能研究第67-83页
        4.1 简单研究背景第67-69页
        4.2 实验材料与方法第69-74页
            4.2.1 McyF的分子克隆第69页
            4.2.2 McyF的表达纯化和结晶第69-70页
            4.2.3 McyF的结构解析第70-72页
            4.2.4 McyF的酶活实验第72-74页
        4.3 实验结果与讨论第74-81页
            4.3.1 McyF的整体结构第74页
            4.3.2 McyF的活性位点口袋第74-77页
            4.3.3 Glu197氨基酸残基在催化反应中的重要作用第77-78页
            4.3.4 McyF与L-Asp/Glu特异性消旋酶EcL-DER的比较第78页
            4.3.5 McyF可能催化甲基化天冬氨酸的手性异构反应第78-81页
        4.4 本章小结第81-83页
    第五章 南极鱼卵透明带蛋白的抗冻功能研究第83-85页
参考文献第85-91页
附录第91-111页
致谢第111-113页
攻读学位期间发表的学术论文与参加的学术会议和项目第113-114页

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