| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 前言 | 第11-25页 |
| 1.1 测序技术概述 | 第11-15页 |
| 1.1.1 第一代测序技术 | 第12页 |
| 1.1.2 第二代测序技术 | 第12-14页 |
| 1.1.3 第三代测序技术 | 第14-15页 |
| 1.2 基因组组装 | 第15-18页 |
| 1.2.1 组装算法 | 第15-17页 |
| 1.2.2 基因组组装面临的挑战 | 第17页 |
| 1.2.3 基因组组装结果的评价 | 第17-18页 |
| 1.3 基因组注释 | 第18-20页 |
| 1.3.1 重复序列注释 | 第18-19页 |
| 1.3.2 非编码RNA序列的预测 | 第19页 |
| 1.3.3 基因结构预测 | 第19-20页 |
| 1.3.4 基因功能注释 | 第20页 |
| 1.4 比较基因组学分析 | 第20-21页 |
| 1.4.1 基因组共线性分析 | 第20-21页 |
| 1.4.2 蛋白质家族聚类比较分析 | 第21页 |
| 1.5 链霉菌基因组研究进展 | 第21-22页 |
| 1.6 昆虫基因组研究进展 | 第22-23页 |
| 1.7 研究内容及意义 | 第23-25页 |
| 第二章 白色链霉菌基因组研究与抗生素pls的调控研究 | 第25-67页 |
| 2.1 引言 | 第25-28页 |
| 2.2 ε-聚赖氨酸产生菌的筛选与鉴定 | 第28-36页 |
| 2.2.1 材料与方法 | 第28-33页 |
| 2.2.2 结果与分析 | 第33-36页 |
| 2.3 S.albulus ZPM基因组测序分析以及比较基因组学分析 | 第36-52页 |
| 2.3.1 材料与方法 | 第36-40页 |
| 2.3.2 结果与分析 | 第40-52页 |
| 2.4 S.albulus ZPM突变体文库构建、测序及SNP分析 | 第52-62页 |
| 2.4.1 材料与方法 | 第53-55页 |
| 2.4.2 结果与分析 | 第55-62页 |
| 2.5 转录因子HrdD结合到pls的启动子区域 | 第62-66页 |
| 2.5.1 材料与方法 | 第63-65页 |
| 2.5.2 结果与分析 | 第65-66页 |
| 2.6 讨论与小结 | 第66-67页 |
| 第三章 白背飞虱基因组与转录组测序 | 第67-91页 |
| 3.1 引言 | 第67页 |
| 3.2 白背飞虱基因组测序 | 第67-80页 |
| 3.2.1 材料与方法 | 第67-69页 |
| 3.2.2 结果与分析 | 第69-80页 |
| 3.3 白背飞虱不同发育阶段转录组测序与分析 | 第80-88页 |
| 3.3.1 材料与方法 | 第80-81页 |
| 3.3.2 结果与分析 | 第81-88页 |
| 3.4 讨论与小结 | 第88-91页 |
| 参考文献 | 第91-101页 |
| 附录 | 第101-143页 |
| 攻读博士期间论文发表情况 | 第143-145页 |
| 致谢 | 第145页 |
