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基于miRNA和siRNA策略抗水稻条纹病毒和水稻黑条矮缩病毒的研究

中文摘要第1-14页
Abstract第14-18页
1 前言第18-35页
   ·水稻条纹病毒的研究进展第18-23页
     ·水稻条纹叶枯病第18页
     ·水稻条纹病毒第18-21页
     ·水稻条纹病毒的基因组转录及复制第21页
     ·水稻条纹病毒传的传毒介体及传毒机制第21-23页
   ·水稻黑条矮缩病毒的研究进展第23-27页
     ·水稻黑条矮缩病第23-24页
     ·水稻黑条矮缩病毒第24-25页
     ·水稻黑条矮缩病毒的基因组转录及复制第25-26页
     ·水稻黑条矮缩病毒的传毒介体及传毒机制第26-27页
   ·水稻病毒病的防治第27-28页
     ·通过化学防治来控制病害第27页
     ·运用品种抗性来控制病害第27-28页
     ·基因工程技术来控制病害第28页
   ·RNA沉默第28-31页
     ·小干扰RNA第29-30页
     ·微小RNA第30-31页
   ·RNA沉默与植物病毒抗性第31-32页
   ·本研究的目的与意义第32-35页
2 材料与方法第35-62页
   ·材料第35-37页
     ·毒源第35页
     ·供试植物、昆虫第35页
     ·菌株和质粒第35页
     ·序列测定第35页
     ·常用化学试剂与分子生物学试剂第35-36页
     ·引物设计第36-37页
   ·方法第37-62页
     ·osa-miR528的克隆第37-41页
       ·水稻总DNA的提取第37-38页
       ·osa-miR528的PCR扩增第38页
       ·DNA片段的回收第38-39页
       ·目的基因DNA片段与pMD18-T载体的连接第39页
       ·感受态细胞制备第39页
       ·大肠杆菌感受态细胞的转化第39-40页
       ·转化菌落PCR鉴定第40页
       ·质粒DNA的小量提取第40-41页
     ·amiRNA的筛选第41页
     ·amiRNA植物表达载体的构建第41-44页
       ·amiRNA植物表达载体的构建策略第41-42页
       ·pre-miR528改造为pre-amiR-RSV和pre-amiR-RBSDV第42页
       ·质粒DNA的酶切第42-43页
       ·目的片段与质粒DNA的连接第43页
       ·冻融法转化农杆菌第43-44页
     ·农杆菌介导的瞬时表达第44页
     ·Northern杂交分析第44-48页
       ·植株总RNA的提取第44-45页
       ·总RNA的甲醛凝胶电泳第45页
       ·总RNA的转膜第45-46页
       ·探针制备第46页
       ·DIG标记有效性检测第46-47页
       ·预杂交与杂交第47-48页
       ·洗膜与显影第48页
     ·植株siRNA/miRNA的Northern blot分析第48-50页
       ·植株siRNA/miRNA的提取第48-49页
       ·sRNA聚丙烯酰胺凝胶电泳第49页
       ·sRNA转膜第49-50页
       ·miRNA探针的制备第50页
       ·miRNA杂交第50页
     ·5'-RLM-RACE验证miRNA靶基因的剪切位点第50-52页
     ·农杆菌介导的水稻转化及转基因植株的获得第52-54页
       ·预培养第52-53页
       ·农杆菌侵染和共培养第53页
       ·转化植株的获得第53页
       ·再生植株的PPT抗性检测第53页
       ·再生植株总DNA的小量提取第53-54页
       ·再生植株的PCR检测第54页
     ·转基因水稻植株的抗病性鉴定第54页
     ·转基因植株的ELISA检测第54-55页
     ·转基因植株的Southern blot分析第55-58页
       ·水稻总DNA的提取第55页
       ·转基因植株总DNA的酶切第55页
       ·DNA凝胶电泳第55-56页
       ·DNA转膜第56页
       ·探针标记第56-57页
       ·DIG标记有效性的检测第57页
       ·预杂交与杂交第57-58页
       ·洗膜与显影第58页
     ·转基因植株的遗传稳定性分析第58页
     ·amiRNA二级结构的预测第58-59页
     ·灰飞虱NCuP基因的克隆第59页
     ·qRT-PCR检测灰飞虱体内目的基因的表达量第59页
     ·灰飞虱的饲毒实验第59页
     ·检测灰飞虱的带毒率第59-60页
     ·体外转录合成NCuP的dsRNA第60页
     ·dsRNA饲喂灰飞虱第60-61页
     ·灰飞虱的获毒试验第61页
     ·灰飞虱的传毒试验第61-62页
3 结果与分析第62-85页
   ·基于amiRNA策略培育双抗RSV和RBSDV转基因水稻新材料第62-79页
     ·水稻osa-miR528的扩增第62-63页
     ·amiRNA的筛选及引物设计第63页
     ·pre-miRNA的改造第63-66页
       ·靶向于RSV CP基因不同区段的人工miRNA前体的构建第63-64页
       ·靶向于RBSDV CP基因不同区段的人工miRNA前体的构建第64-65页
       ·双抗植物表达载体的构建第65-66页
     ·农杆菌介导的瞬时侵染检测amiRNA表达载体的有效性第66页
     ·Northern blot检测靶RNA的积累第66-67页
     ·5'-RLM-RACE验证miRNA靶基因的剪切位点第67-68页
     ·T_0代转基因再生植株的获得及检测第68-70页
     ·转基因植株的amiRNA的表达检测第70页
     ·T_2代转基因植株的抗性鉴定第70-72页
     ·T_2代转基因植株的Northern杂交分析第72-73页
     ·T_2代转基因植株的amiRNA杂交分析第73页
     ·T_2代转基因植株的siRNA杂交分析第73-74页
     ·转基因植株的Southern blot分析第74-75页
     ·转基因和病毒抗性的遗传稳定性分析第75-77页
     ·amiRNA二级结构的预测第77-79页
   ·介体传毒相关蛋白的鉴定及沉默传毒相关蛋白对介体传毒的影响第79-85页
     ·灰飞虱NCuP基因的克隆第79-80页
     ·NCuP基因在灰飞虱不同发育时期的表达特性第80-81页
     ·RSV的侵染对不同龄期灰飞虱NCuP基因表达的影响第81页
     ·体外转录合成dsNCuP第81-82页
     ·dsNCuP干扰灰飞虱体内的RSV表达第82-83页
     ·饲喂dsNCuP对灰飞虱获毒效率的影响第83-84页
     ·饲喂dsNCuP对灰飞虱传毒效率的影响第84-85页
4 讨论第85-89页
   ·靶向RSV和RBSDV CP基因不同区段的ami RNA介导了对两种病毒的抗病性第85-87页
   ·沉默灰飞虱体内与RSV互作的基因影响灰飞虱对RSV的传播第87-89页
5 结论第89-90页
参考文献第90-107页
致谢第107-108页
攻读学位期间发表的论文及成果第108页

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