绿竹、麻竹、孟宗竹的线粒体基因组测序及比较分析
| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 中英文词汇对照表 | 第9-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-25页 |
| ·绿竹,麻竹,孟宗竹的种属,形态特征及地理分布 | 第13-17页 |
| ·植物线粒体的基因组学研究 | 第17-21页 |
| ·线粒体的起源,功能及超微结构 | 第17-20页 |
| ·线粒体基因组的分子构型 | 第20-21页 |
| ·植物线粒体基因组特点 | 第21页 |
| ·高等植物线粒体DNA的迁移 | 第21-24页 |
| ·DNA序列迁移机制 | 第21-22页 |
| ·DNA序列迁移的流向 | 第22-23页 |
| ·迁移DNA序列在新基因组内的分布及序列重排 | 第23页 |
| ·高等植物线粒体tRNA基因 | 第23-24页 |
| ·线粒体测序的现状和未来 | 第24-25页 |
| 第二章 测序与拼接 | 第25-31页 |
| ·线粒体D N A的提取 | 第25页 |
| ·线粒体提取 | 第25页 |
| ·DNA提取 | 第25页 |
| ·测序 | 第25-28页 |
| ·AB 3730测序原理 | 第26-27页 |
| ·Roche 454测序原理 | 第27-28页 |
| ·拼接 | 第28-31页 |
| ·测序数据拼接 | 第28-31页 |
| 第三章 结果与分析 | 第31-41页 |
| ·竹子线粒体基因组序列的拼接 | 第31-32页 |
| ·竹子线粒体基因组结构特征 | 第32-35页 |
| ·竹子线粒体编码基因 | 第33页 |
| ·串联重复序列 | 第33-35页 |
| ·竹子线粒体基因组序列多态性分析 | 第35-36页 |
| ·竹子线粒体与叶绿体之间的DNA迁移 | 第36-39页 |
| ·蛋白质编码基因的迁移 | 第36-37页 |
| ·非蛋白质编码基因迁移 | 第37-39页 |
| ·蛋白编码基因的系统发生进化树 | 第39-41页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第41-44页 |
| ·绿竹、麻竹、孟宗竹之间的比较分析 | 第41页 |
| ·竹子与其他植物的比较分析 | 第41-42页 |
| ·tRNA基因迁移的机制和高频率迁移 | 第42页 |
| ·绿竹与其他单子叶植物编码基因序列多态性比较 | 第42页 |
| ·竹子的系统发生进化分析 | 第42-44页 |
| 未来工作展望 | 第44-45页 |
| 附录一 高等植物基因注释信息 | 第45-46页 |
| 附录二 绿竹、麻竹、孟宗竹种内多态性位点 | 第46-48页 |
| 附录三 绿竹、麻竹亚种问蛋白编码基因多态性位点 | 第48页 |
| 附录四 绿竹、孟宗竹亚种间蛋白编码基因多态性位点 | 第48-49页 |
| 附录五 麻竹、孟宗竹亚种间蛋白编码基因多态性位点 | 第49页 |
| 附录六 水稻与绿竹蛋白编码基因多态性位点 | 第49-52页 |
| 附录七 高粱与绿竹蛋白编码基因多态性位点 | 第52-55页 |
| 附录八 小麦与绿竹蛋白编码基因多态性位点 | 第55-57页 |
| 附录九 玉米与绿竹蛋白编码基因多态性位点 | 第57-61页 |
| 作者简介及论文发表情况 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-65页 |
