| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-15页 |
| 1 引言 | 第15-39页 |
| ·研究背景 | 第15-16页 |
| ·基因表达芯片及其常规分析方法 | 第16-24页 |
| ·基因表达 | 第16页 |
| ·基因芯片概念 | 第16-17页 |
| ·实验设计 | 第17-18页 |
| ·基因芯片数据校正 | 第18页 |
| ·差异表达基因统计分析方法 | 第18-20页 |
| ·聚类分析 | 第20-21页 |
| ·信号解读与基因注释 | 第21-24页 |
| ·基因集富集分析 | 第24-29页 |
| ·基因集的定义 | 第24-26页 |
| ·GSEA 方法及其扩展 | 第26-29页 |
| ·基因集富集分析的优点 | 第29页 |
| ·元分析方法 | 第29-33页 |
| ·合并P 值的FISHER 法 | 第30页 |
| ·基于T 模型的方法 | 第30-31页 |
| ·秩积法(RANK PRODUCT APPROACH) | 第31-32页 |
| ·秩融合法(RANK AGGREGATION APPROACH) | 第32-33页 |
| ·比较基因组学 | 第33-35页 |
| ·直向同源基因 | 第34页 |
| ·比较基因组学的研究方法 | 第34-35页 |
| ·全基因组的比较研究 | 第35页 |
| ·内参基因 | 第35-38页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第35-36页 |
| ·理想内参基因的条件 | 第36页 |
| ·内参基因稳定性的分析方法 | 第36-37页 |
| ·基于微阵列的参考基因筛选 | 第37-38页 |
| ·研究目的与意义 | 第38-39页 |
| 2 子宫内膜异位症芯片数据的基因集富集分析及整合 | 第39-50页 |
| ·引言 | 第39页 |
| ·材料与方法 | 第39-41页 |
| ·数据检索与收集 | 第39-40页 |
| ·数据预处理 | 第40页 |
| ·基因集富集分析 | 第40-41页 |
| ·分析结果 | 第41-46页 |
| ·影响卵巢型子宫内膜异位症的显著通路 | 第41-44页 |
| ·影响腹膜型子宫内膜异位症的显著通路 | 第44-45页 |
| ·子宫周期各个阶段表达显著的通路 | 第45-46页 |
| ·人子宫内膜内皮细胞的差异表达通路 | 第46页 |
| ·讨论 | 第46-49页 |
| ·结论 | 第49-50页 |
| 3 能量负平衡对子宫内膜相关通路及基因的影响 | 第50-60页 |
| ·引言 | 第50页 |
| ·材料与方法 | 第50-51页 |
| ·数据 | 第50-51页 |
| ·筛选差异表达基因 | 第51页 |
| ·基因集富集分析 | 第51页 |
| ·分析结果 | 第51-56页 |
| ·差异表达基因 | 第51-53页 |
| ·通路富集分析 | 第53-55页 |
| ·比较通路间的重叠部分 | 第55-56页 |
| ·讨论 | 第56-59页 |
| ·结论 | 第59-60页 |
| 4 影响猪子宫内膜的候选通路及基因筛选 | 第60-73页 |
| ·引言 | 第60页 |
| ·材料与方法 | 第60-61页 |
| ·数据 | 第60-61页 |
| ·HOMOLOGENE 数据库 | 第61页 |
| ·BIOMART 数据库 | 第61页 |
| ·结果 | 第61-69页 |
| ·人与牛同源基因比对结果 | 第61-63页 |
| ·猪同源基因比对 | 第63-69页 |
| ·讨论 | 第69-73页 |
| 5 猪胚胎和子宫内膜发育相关内参基因的筛选 | 第73-81页 |
| ·引言 | 第73页 |
| ·材料与方法 | 第73-75页 |
| ·数据收集 | 第73-74页 |
| ·数据预处理 | 第74页 |
| ·基因排序 | 第74页 |
| ·元分析 | 第74-75页 |
| ·基因注释 | 第75页 |
| ·结果 | 第75-78页 |
| ·讨论 | 第78-81页 |
| 6 结论与展望 | 第81-82页 |
| ·结论 | 第81页 |
| ·展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-98页 |
| 附录 | 第98-101页 |
| 附录1 论文中应用的生物学相关软件以及数据库 | 第98-99页 |
| 附录2 词汇缩写列表 | 第99-101页 |
| 致谢 | 第101-103页 |
| 攻读博士学位期间发表或录用的论文 | 第103页 |