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未培养微生物预苯酸脱氢酶基因的克隆、表达和功能鉴定

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 前言第12-29页
   ·未培养微生物第12-16页
     ·微生物资源与未培养微生物概述第12页
     ·未培养微生物资源开发的研究方法第12-16页
   ·酪氨酸合成第16-18页
     ·酪氨酸的工业合成第16-17页
     ·酪氨酸在生物体内的合成第17-18页
   ·TyrA蛋白家族第18-28页
     ·TyrA蛋白家族与酪氨酸合成第18-20页
     ·TyrA蛋白家族的系统进化分析第20-21页
     ·TyrA的催化区域第21-22页
     ·TyrA蛋白的调节第22-23页
     ·TyrA蛋白的催化机制第23页
     ·Escherichia coli的TyrA第23-24页
     ·TyrA的空间结构第24-28页
   ·本课题的研究目的第28-29页
第二章 材料与方法第29-43页
   ·实验材料第29-31页
     ·筛选文库第29页
     ·菌株和质粒第29页
     ·培养基第29-30页
     ·抗生素第30页
     ·菌体培养第30页
     ·菌种保存第30-31页
     ·仪器、试剂和溶液配制第31页
   ·实验方法第31-43页
     ·质粒DNA的提取第31-32页
     ·PCR扩增目标DNA第32页
     ·胶回收纯化DNA片段第32-33页
     ·PCR产物纯化第33页
     ·琼脂糖凝胶电泳检测DNA第33-34页
     ·DNA的酶切第34页
     ·DNA的连接反应第34-35页
     ·感受态细胞制备第35-36页
     ·化学转化法第36页
     ·目的蛋白样品的制备第36-37页
     ·亲和层析纯化目的蛋白第37-38页
     ·超滤脱盐第38-39页
     ·SDS-PAGE第39-40页
     ·蛋白质浓度测定第40-41页
     ·预苯酸脱氢酶酶活检测第41-43页
第三章 tyrA基因的筛选及其生物信息学分析第43-52页
   ·tyrA基因的筛选第43-44页
   ·tyrA基因pdhE的生物信息学分析第44-51页
     ·相似性检索第44-46页
     ·PdhE的理化性质预测第46页
     ·PdhE的信号肽预测第46页
     ·PdhE的跨膜结构域预测第46页
     ·PdhE的亲疏水性预测第46-47页
     ·PdhE的二级结构预测第47-48页
     ·PdhE的功能域预测第48页
     ·PdhE的系统发育分析第48-49页
     ·蛋白PdhE的多重序列比对分析第49-51页
   ·小结第51-52页
第四章 pdhE基因的克隆、表达和功能鉴定第52-56页
   ·pdhE基因的克隆第52页
   ·pdhE在大肠杆菌中表达第52-54页
     ·重组质粒pETBlue-2/pdhE的构建第52-54页
     ·重组质粒pETBlue-2/pdhE导入表达宿主第54页
     ·pdhE的表达和表达产物纯化第54页
   ·重组蛋白PdhE的功能鉴定第54-55页
   ·小结第55-56页
第五章 pdhE-1基因的克隆、表达和功能鉴定第56-68页
   ·融合PCR获得融合蛋白编码基因第56-59页
     ·pdhE部分DNA片段的PCR扩增第56-57页
     ·大肠杆菌K-12菌株tyrA基因部分DNA片段PCR扩增第57-58页
     ·融合PCR获得融合蛋白编码序列第58-59页
   ·pdhE-1在大肠杆菌中表达第59-61页
     ·重组质粒pETBlue-2/pdhE-1的构建第59-61页
     ·重组质粒pETBlue-2/pdhE-1导入表达宿主第61页
     ·pdhE-1的表达和表达产物纯化第61页
   ·重组蛋白PdhE-1的生化性质的测定第61-67页
     ·pH值对重组蛋白PdhE-1的影响第62-63页
     ·温度对重组蛋白PdhE-1的影响第63-64页
     ·金属离子对重组蛋白PdhE-1的影响第64-65页
     ·EDTA对酶活力的影响第65页
     ·重组蛋白PdhE-1的催化动力学分析第65-66页
     ·L-酪氨酸对重组蛋白PdhE-1的影响第66-67页
   ·小结第67-68页
第六章 总结、讨论与展望第68-70页
   ·总结与讨论第68-69页
   ·展望第69-70页
参考文献第70-78页
致谢第78-79页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第79页

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